| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1513574 | 39 (0.720) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.2% | coding (213/474 nt) | mraZ | cell division/cell wall cluster transcriptional repressor MraZ |
| ? | NC_002947 | = 1513636 | 54 (1.070) | coding (275/474 nt) | mraZ | cell division/cell wall cluster transcriptional repressor MraZ | |||||
GCCATGCCGAGTCGGTACCGTGACGAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGCGATGCTGGTGGGGCAACTG > NC_002947/1513428‑1513721 | gCCATGCCGAGTCGGTACCGTGACGAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGtt < 1:335330/149‑1 (MQ=255) cATGCCGAGTCGGTACCGTGACGAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGc > 6:147324/1‑149 (MQ=255) ccGAGTCGGTACCGTGACGAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGa < 7:184075/149‑1 (MQ=255) ccGAGTCGGTACCGTGACGAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGGGACCATTGAAGCCGTAGACCCCTTCTTGTGTGTTTATCAACTCGAAGAGTCGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCAACGTTGCGt > 7:135915/1‑147 (MQ=255) ccGTGACGAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAAccgc < 8:277394/148‑1 (MQ=255) ccGTGACGAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAAccgc < 5:147324/148‑1 (MQ=255) gAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCa < 7:28208/149‑1 (MQ=255) gTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGAtt < 3:299588/149‑1 (MQ=255) aTGGCCAACTGATCGTGTCCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGATGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAAt < 3:231338/149‑1 (MQ=255) cAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATACCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTTCCTTGACATCGTTGCGTGAGGAAAACCGACGCCTCCATCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGt > 6:205389/1‑149 (MQ=255) gACCATTGACGCCGTAGCCCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGc < 8:140599/149‑1 (MQ=255) cATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTc < 3:666‑M2/148‑2 (MQ=255) aTTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGagctccaggtcaaccgcattaccaatcagcaaacgctggaggcggcggttttcctcacgcaacga > 7:149458‑M1/1‑84 (MQ=255) ttGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTcgat < 1:226578‑M2/149‑5 (MQ=255) aCGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGagctccaggtcaaccgcattaccaatcagcaaacgctggaggcggcggttttcctcacgcaacgatgg < 8:149458‑M1/148‑69 (MQ=255) gCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTACGTGCCTTGCCATCGagctccaggtcaaccgcattaccaatcagcaaacgctggaggcggcggttttcctcacgcaacgatggcaa < 8:289117‑M1/149‑72 (MQ=255) cccTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTcgatgg > 4:256151‑M2/1‑131 (MQ=255) cccTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTcgatgg < 3:256151‑M2/137‑7 (MQ=255) cccTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGttt > 3:40679/1‑149 (MQ=255) cccTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGttt > 3:128795/1‑149 (MQ=255) cccTGCTTGTGTGTTCTTCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTGCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGAGCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGttt < 8:135915/149‑1 (MQ=255) cTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCt < 4:40679/147‑1 (MQ=255) gtgtgtTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTgc > 2:74391/1‑149 (MQ=255) tgtgtTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTgcc > 8:44136/1‑149 (MQ=255) tgtgtTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTgcc > 8:160934/1‑149 (MQ=255) tgtgtTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTgcc > 2:233244/1‑149 (MQ=255) gtgtTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTg > 1:200908/1‑99 (MQ=255) gtgtTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTg < 2:200908/99‑1 (MQ=255) tATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGccgcccc < 6:306452/148‑1 (MQ=255) cccTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTg > 7:259336/1‑149 (MQ=255) cccTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTg > 5:240227/1‑149 (MQ=255) cTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTcgatgg < 2:77703‑M2/116‑7 (MQ=255) gATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGt > 4:6370/1‑147 (MQ=255) gATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGa < 2:275560/149‑1 (MQ=255) tGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGt < 6:240227/149‑1 (MQ=255) gTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACg > 6:62672/1‑149 (MQ=255) aaCAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAg < 1:233244/149‑1 (MQ=255) aGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCATTGCCATCGTTCCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTTATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTc < 5:205389/149‑1 (MQ=255) gATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCg < 5:62672/149‑1 (MQ=255) tAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGa > 6:296755/1‑148 (MQ=255) gCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGt < 7:114412/126‑1 (MQ=255) gCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGt > 8:114412/1‑126 (MQ=255) cAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAgg < 2:226578/149‑1 (MQ=255) aGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGc > 5:209499/1‑148 (MQ=255) gTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGCGa < 3:6370/149‑1 (MQ=255) gCCTTTCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGCGATGCtggt < 6:118485/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGCGATGCtggt > 3:278571/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGCGATGCtggt < 6:209499/148‑1 (MQ=255) ttGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTcgatggcaaggcacgtaacttggcttctatctgttcccactcatcgaggggataaacacacaagcaggggtctacggc < 8:289117‑M2/149‑79 (MQ=255) ttGCCATCGTTGCGTGAGGAAAAAAGCCACAACCAAAGTTTGCTAATTGGTAATACAGTAAACATGAAGATCTATGGAAGTGGACGTTTCATGTTGCCCCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGAGATGATGGTggg > 7:49858/1‑149 (MQ=255) ccATCGagctccaggtcaaccgcattaccaatcagcaaacgctggaggcggcggttttcctcacgcaacgatggcaaggcacgcaacttggcttctatctgttcccactcatcgaggggataaacacacaagcaggg > 4:256151‑M1/1‑6 (MQ=255) ccATCGagctccaggtcaaccgcattaccaatcagcaaacgctggaggcggcggttttcctcacgcaacgatggcaaggcacgcaacttggcttctatctgttcccactcatcgaggggataaacacacaagcaggg < 3:256151‑M1/137‑132 (MQ=255) ccATCGagctccaggtcaaccgcattaccaatcagcaaacgctggaggcggcggttttcctcacgcaacgatggcaaggcacgcaacttggcttctatctgttcccactcatcgag < 2:77703‑M1/116‑111 (MQ=255) ccATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTcgatggcaaggcacgcaacttggcttctatctgttcccactcatcgaggggataaacacacaagcaggggtctacggcgt < 8:149458‑M2/148‑81 (MQ=255) cATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGCGATGCTGGTGGGGCaa < 4:666/149‑1 (MQ=255) aTCTTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGGAGTGGGCGTTTCGTTGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGCGATGCTGGTGGGGCAAc < 4:128795/149‑1 (MQ=255) aTCGagctccaggtcaaccgcattaccaatcagcaaacgctggaggcggcggttttcctcacgcaacgatggcaaggcacgcaacttggcttctatctgttcccactcatcgaggggataaacacacaagcaggggtctacggcgtcaa < 1:226578‑M1/149‑146 (MQ=255) tCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTcgatggcaaggcacgcaacttggcttctatctgttcccactcatcgaggggataaacacacaagcaggggtctacggcgtcaat > 7:149458‑M2/1‑65 (MQ=255) gagctccaggtcaaccgcattaccaatcagcaaacgctggaggcggcggttttcctcacgcaacgatggcaaggcacgcaacttggcttctatctgttcccactcatcgaggggataaacacacaagcaggggtctacggcgtcaatg < 3:666‑M1/148‑148 (MQ=255) | GCCATGCCGAGTCGGTACCGTGACGAGCTCGACTCACGTTGCAATGGCCAACTGATCGTGACCATTGACGCCGTAGACCCCTGCTTGTGTGTTTATCCCCTCGATGAGTGGGAACAGATAGAAGCCAAGTTGCGTGCCTTGCCATCGTTGCGTGAGGAAAACCGCCGCCTCCAGCGTTTGCTGATTGGTAATGCGGTTGACCTGGAGCTCGATGGCAGTGGGCGTTTCCTGGTGCCGCCCCGCCTGCGTGAGTACGCCAAGCTCGACAAGAAGGCGATGCTGGTGGGGCAACTG > NC_002947/1513428‑1513721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |