New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1948721 | 44 (0.820) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 7.6% | coding (934/1746 nt) | PP_1749 | acetyltransferase |
? | NC_002947 | = 1948789 | 54 (1.030) | coding (866/1746 nt) | PP_1749 | acetyltransferase |
CGCCAGGTTGTCATCGGCATTGCCCGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGCCAGGCCCGAGGAACAGC > NC_002947/1948578‑1948869 | cGCCAGGTTGTCATCGGCATTGCCCGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGTCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGaa < 5:161115/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCATCGGCATTGCCCGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATgc < 6:194363/149‑1 (MQ=255) ttGTCATCGGCATTGCCCGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGcgccg > 3:167887/1‑149 (MQ=255) aTCGGCATTGCCCGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGccgcccgc > 7:146743/1‑149 (MQ=255) tCGGCATTGCCCGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGCGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCcgcctgcc < 1:279007/149‑1 (MQ=255) ggCATTGCCCGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCgcccgccc < 2:254300/148‑1 (MQ=255) cGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAggg < 4:167887/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAggg > 5:320850/1‑149 (MQ=255) gCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAtcgaagtgcaggtggacgacgccgctggcggcct > 3:296959‑M1/1‑115 (MQ=255) cTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATgc < 8:181582/122‑1 (MQ=255) gcgcGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGgccg > 7:158520/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGgccgc < 2:106103/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAgcggcg > 6:233363/1‑149 (MQ=255) tGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGcgtc > 5:346931/1‑149 (MQ=255) aGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCgtcgtc < 6:346931/149‑1 (MQ=255) ccAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCAc > 4:281275/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCAc < 8:146743/149‑1 (MQ=255) cGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTg > 3:20055/1‑148 (MQ=255) ggTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAtcgaagtgcaggtggacgacgccgctggcggcctgttcaccctgagcctgggcgggcggcgcattcgctgccgggaat < 4:296959‑M1/147‑79 (MQ=255) tCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCATGGGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAg > 1:20798/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAgg < 2:20798/149‑1 (MQ=255) aGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGc < 3:281275/149‑1 (MQ=255) aGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTAGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGc > 2:294338/1‑149 (MQ=255) gCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAtcgaagtgcaggtggacgacgccgctggcggcctgttcaccctgagcctgggcgggcggcgcattcgctgccgg < 4:40904‑M1/137‑75 (MQ=255) gCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAtcgaagtgcaggtggacgacgccgctggcggcctgttcaccctgagcctgggcgggcggcgcattcgctgccgg > 3:40904‑M1/1‑63 (MQ=255) gCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCt > 2:173642/1‑149 (MQ=255) gTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGCGCCtcg > 2:129164/1‑149 (MQ=255) cTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTcgacga < 1:122411/149‑1 (MQ=255) gCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACgatga < 8:158520/149‑1 (MQ=255) aGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGAtgcg > 6:319714/1‑149 (MQ=255) aT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGAtgcgtgcg > 4:45761/1‑147 (MQ=255) aT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATgcgtgcgt < 5:233363/148‑1 (MQ=255) t‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGTGCGATTCCGGGCAGCGAATGGTCCGCCCGCGCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGTCGCAGGGCCTCGTCGAAGATGATGAGTGCGTAg < 2:138315/149‑1 (MQ=255) cGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGTGGTTg < 3:64574/149‑1 (MQ=255) ggCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGa < 3:256266/149‑1 (MQ=255) gCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAg < 6:320850/149‑1 (MQ=255) gTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGc < 3:45761/149‑1 (MQ=255) tCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCt > 5:49738/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCtt > 3:313065/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCtt > 3:308170/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCg > 5:20470/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGAGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCg > 1:253987/1‑149 (MQ=255) gCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGc < 4:20055/149‑1 (MQ=255) cTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGa > 5:223389/1‑133 (MQ=255) cTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGa < 6:223389/133‑1 (MQ=255) tGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGc < 5:236462/139‑1 (MQ=255) tGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGGTGCTGTCGGCtagaacgt > 6:236462/1‑140 (MQ=255) aGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGCCAgg > 5:125974/1‑149 (MQ=255) aTTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGAtgccgggaatcgctcagcgacctgaccagtgccgtgaccatgaccctgtgccaggacaaacgcctgacc < 4:296959‑M2/147‑70 (MQ=255) cccGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGCCAGGCCCGAg < 8:205261/148‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGAtgccgggaatcgctcagcgacctgaccagtgccgtgaccatgaccctgtgccaggacaaacgc < 4:40904‑M2/137‑64 (MQ=255) ccGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGAtgccgggaatcgctcagcgacctgaccagtgccgtgaccatgaccctgtgccaggacaaacgc > 3:40904‑M2/1‑74 (MQ=255) cGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGCCAGGCCCGAGGaa > 4:74546/1‑149 (MQ=255) gCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGCCAGGc > 8:234883/1‑139 (MQ=255) gCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGCCAGGc < 7:234883/139‑1 (MQ=255) aGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGCCAGGCCCGAGGAACAgc < 1:173642/149‑1 (MQ=255) | CGCCAGGTTGTCATCGGCATTGCCCGCCAGCTGTTGCGCGGGCACCTGCAGCCCAGCGTTGTGCAGGGCATGCTGGGTCAGGCGTTTGTCCTGGCACAGGGTCAT‑GGTCACGGCACTGGTCAGGTCGCTGAGCGATTCCCGGCAGCGAATGCGCCGCCCGCCCAGGCTCAGGGTGAACAGGCCGCCAGCGGCGTCGTCCACCTGCACTTCGATGCCCCGGCGCAGGGCCTCGTCGACGATGATGCGTGCGTAGGGGTTGAGGTCGGCTTGCGGGCCAGGCCCGAGGAACAGC > NC_002947/1948578‑1948869 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |