New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2762390 = | 79 (1.470) | 5 (0.100) | 5/246 | NT | 7.7% | coding (505/789 nt) | PP_2416 | iron ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 2762482 = | 47 (0.940) | coding (413/789 nt) | PP_2416 | iron ABC transporter ATP‑binding protein |
GTCGAGAACCGCGACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTCCTGCCGGGAGAA > NC_002947/2762244‑2762537 | gTCGAGAACCGCGACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCcagcagcag < 4:199723/147‑1 (MQ=255) tCGAGAACCGCGACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCGTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑c < 3:206983/149‑1 (MQ=255) gagaACCGCGACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCt > 4:151705/1‑149 (MQ=255) agaACCGCGACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTg > 7:139619/1‑149 (MQ=255) ggttctcgACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGc > 2:8363/7‑149 (MQ=255) gcaacaggccgacacacttgatgcgatcagcgtgttcgacgcggttgccttgggccgcacgccctggctctcggccctggcaccgttctcccggcaggactgcgccatcgtcgagcaagccctggccgacctcgacgccctGCA‑CCTGc < 6:97208‑M1/8‑1 (MQ=255) aCCGCGACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCgg < 5:88528/149‑1 (MQ=255) cgcgACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGcc > 3:45642/1‑149 (MQ=255) acacGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTg < 1:8363/149‑1 (MQ=255) cacGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTgg < 2:151506/149‑1 (MQ=255) tCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAg > 6:13160/1‑149 (MQ=255) acttgatgcgatcagcgtgttcgacgcggttgccttgggccgcacgccctggctctcggccctggcaccgttctcccggcaggactgcgccatcgtcgagcaagccctggccgacctcgacgccctGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAgc < 2:218903‑M1/23‑1 (MQ=255) acaGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGGTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAgc < 1:86258/148‑1 (MQ=255) aGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCa > 7:158347/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACg > 1:297091/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACg > 6:170636/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACg < 7:275303/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGc > 3:182563/1‑149 (MQ=255) 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gTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCt > 6:168065/1‑149 (MQ=255) aTGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTgg < 2:297091/148‑1 (MQ=255) aGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTc < 5:13160/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCg > 6:283662/1‑148 (MQ=255) ggtggtGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTc < 8:149838/138‑1 (MQ=255) ggtggtGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTc > 7:149838/1‑138 (MQ=255) tggtgCCCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGc < 2:57055/149‑1 (MQ=255) tgACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGAc < 3:18024/149‑1 (MQ=255) gACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGAcc > 1:145805/1‑149 (MQ=255) aCCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCAGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGAccc > 1:98749/1‑149 (MQ=255) 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1:177261/1‑148 (MQ=255) gttggtCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCAGCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTCGCTcgacga < 4:53850/149‑1 (MQ=255) gttggtCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTcgacg < 3:100896/148‑1 (MQ=255) tCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGgcgc > 4:20426/1‑98 (MQ=255) tCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGgcgc < 3:20426/98‑1 (MQ=255) gTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAg > 7:109954/1‑149 (MQ=255) ttCGTCCAGCAGCAGGA‑CCTGCGGCGGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCAGACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCTTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCATGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGt < 2:160641/149‑1 (MQ=255) cGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTc < 2:98749/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTCCt > 8:81775/1‑149 (MQ=255) cagcagcagCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTCCTGcc > 5:97208/1‑149 (MQ=255) gcagcagca‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTCCTGCCgg < 1:76424/149‑1 (MQ=255) gcagca‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTCCTGCCGGgag < 7:250012/149‑1 (MQ=255) cagca‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTCCTGCCGGgag > 1:11875/1‑148 (MQ=255) agca‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTCCTGCCGGGAGaa < 7:105308/149‑1 (MQ=255) | GTCGAGAACCGCGACACGGTCACAGGTCAGCGCCTGGTTGAGGTCATGCAGCGCTACCAGGGTGGTGACCGGCAGCGCCTGCACTTGTTGCAGCAGGCTTAGCTGATGCTGAATGTCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCCAGCAGCAGCA‑CCTGCGGCCGTTGGGCCAGCGCACGGGCGATGTGCACACGCTGGCGCTCGCCACCGGACAGCGACCCCCACAGGCGCGTACGCAGGTGCAGGGCGTCGAGGTCGGCCAGGGCTTGCTCGACGATGGCGCAGTCCTGCCGGGAGAA > NC_002947/2762244‑2762537 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |