New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2916742 | 49 (0.910) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 7.8% | coding (5762/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin |
? | NC_002947 | = 2916797 | 47 (0.900) | coding (5817/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin |
GCTCGACTTGACCAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCTGGTGGCGCAGACCATGG > NC_002947/2916650‑2916936 | gCTCGACTTGACCAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTg < 2:177511‑M2/149‑2 (MQ=255) gACCAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCt < 1:177511/147‑1 (MQ=255) gACCAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTgg > 7:162512/1‑149 (MQ=255) gACCAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGGCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTg < 7:156320/148‑1 (MQ=255) aCCAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGc > 5:238615/1‑149 (MQ=255) ccAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGcc > 5:8798/1‑149 (MQ=255) cAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGcc > 6:155502/1‑148 (MQ=255) aaCGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTa > 5:57392/1‑149 (MQ=255) cGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAActg < 5:327544/148‑1 (MQ=255) cGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAActg > 6:327544/1‑148 (MQ=255) gggCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAActgct < 1:188269/149‑1 (MQ=255) gCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTgg < 6:57392/149‑1 (MQ=255) cAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑cgc > 3:189383/1‑149 (MQ=255) cAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑cgc < 6:267496/149‑1 (MQ=255) aGTTCCTTGCCGACATCGCGAACAATGCCGTGCCGGTGTTCGGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTTGCCGGCTATGCCGTGCAGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑cgcg < 8:84538/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCa < 7:76277/149‑1 (MQ=255) ccTTGACTACATCGCCGACAATGCCGTGCCGTTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCAc < 7:47554/148‑1 (MQ=255) cTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGTCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTa > 2:245832/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACt < 2:338004/148‑1 (MQ=255) ttGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTa > 4:307389/1‑148 (MQ=255) gACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGATCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGc > 1:15608/1‑149 (MQ=255) aCATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGcc < 6:238615/149‑1 (MQ=255) cacaATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACgg < 3:307389/149‑1 (MQ=255) tgccgGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAAc < 4:170947/149‑1 (MQ=255) tgccgGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAAc > 3:170947/1‑149 (MQ=255) tgccgGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAAc < 8:241712/149‑1 (MQ=255) gtgtTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGaa > 5:179999/1‑149 (MQ=255) gtgtTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGaa > 4:203322/1‑149 (MQ=255) aGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCgg > 3:148793/1‑149 (MQ=255) gTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGc < 8:96896/149‑1 (MQ=255) tttttgtggtggcggcGTATGCCTAAAACGTGGCCGGAATTGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTgccagcacgccgccacttaacaccggcacggcattgtgggcgatgtcggcaaggaactggtgcccggtacgcacggcgttg > 4:40173‑M2/6‑68 (MQ=255) gcggcgTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGTCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGACCGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCt < 1:245832/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTgccagcacgccgccactgaacaccggcacggcattgtgggcgatgtcggcaaggaactggtgcccggtacgcacggcgttg < 3:40173‑M2/143‑82 (MQ=255) cTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTgccagcacgccgccactgaacaccggcacggcattgtgggcgatgtcggcaaggaactggtgcccggtacccacggcgttggtcacgac < 5:104358‑M2/149‑90 (MQ=255) cTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGt < 5:308491/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGt < 3:57130/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGc < 6:8798/148‑1 (MQ=255) gcCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATg < 2:15608/149‑1 (MQ=255) gATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGAt > 4:320081/1‑149 (MQ=255) ccGTCAACGGGGCCGGCAATGGCGTGGCGGTCAACCCGCATACCGGTgccagcacgccgccactgaacaccggcacggcattgtgggcgatgtcggcaatgaactggtgcccggtacgcacggcgttggtcaagtcgagcggtgccagc > 6:104358‑M2/1‑47 (MQ=255) gACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAAc < 5:213276/117‑1 (MQ=255) gACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAAc > 6:213276/1‑117 (MQ=255) gACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGc > 2:295418/1‑123 (MQ=255) gACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGc < 1:295418/123‑1 (MQ=255) cAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAAcc < 3:320081/149‑1 (MQ=255) tgccgGTCAACCCGCAGACCGCTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCtggtg < 4:189383/149‑1 (MQ=255) cgGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCTGGTGgcg < 4:148793/149‑1 (MQ=255) aaCCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAAc > 6:257051/1‑132 (MQ=255) aaCCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAAc < 5:257051/132‑1 (MQ=255) aCCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCTGGTGGCGCAGAc > 3:201643/1‑148 (MQ=255) ccGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCTGGTGGCGCAGACCAt > 6:176535/1‑149 (MQ=255) cGCAGACCGGTGCCAACCTTGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCTGGTGGCGCAGACCATg < 8:162512/149‑1 (MQ=255) gCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAGCGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCTGGTGGCGCAGACCATgg > 7:270319/1‑149 (MQ=255) gCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCTGGTGGCGCAGACCATgg < 5:176535/149‑1 (MQ=255) | GCTCGACTTGACCAACGCCGTGCGTACCGGGCACCAGTTCCTTGCCGACATCGCCCACAATGCCGTGCCGGTGTTCAGTGGCGGCGTGCTGGCGCCGGATGCCGACAACGTGGCCGGCAATGCCGTGCCGGTCAACCCGCAGACCGGTGCCAACCTGGCCTACGACAACGAACTGCTGGA‑CGCGCACTACATCGCCGGTGACGGCCGGGTCAACGAGAACATCGGCCTGACCGCCGTGCATGCGATCTTCCACTCCGAGCACAACCGGCTGGTGGCGCAGACCATGG > NC_002947/2916650‑2916936 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |