New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4722643 | 54 (1.000) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 5.5% | coding (921/1905 nt) | htpG | chaperone protein HtpG |
? | NC_002947 | = 4722713 | 51 (0.990) | coding (851/1905 nt) | htpG | chaperone protein HtpG |
GAATCAACCACACCCTTGATGAAGCGCAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACGGGTCCACAGGGCGCTGGCGC > NC_002947/4722566‑4722860 | gAATCAACCACACCCTTGATGAAGCGCAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAg < 5:156014‑M2/149‑2 (MQ=255) aaTCAACCACACCCTTGATGAAGCGCAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAgc > 6:45852‑M2/1‑147 (MQ=255) acacCCTTGATGAAGCGCAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGtt < 2:288215/149‑1 (MQ=255) ccTTGATGAAGCGCAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCCCGGGCCGGCACGTACAGCAGAGAGTTGTAt > 4:189381/1‑149 (MQ=255) ccTTGATGAAGCGCAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTAt > 2:168831/1‑149 (MQ=255) cTTGATGAAGCGCAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTAtt < 7:241314/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGc > 3:228837/1‑149 (MQ=255) gcAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCt > 3:134446/1‑149 (MQ=255) gcAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCt > 2:60415/1‑149 (MQ=255) gTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGa > 4:313508/1‑149 (MQ=255) aGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCtt < 4:228837/149‑1 (MQ=255) cAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTtgttgt < 2:194152/149‑1 (MQ=255) cAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTtgttgt > 4:41646/1‑149 (MQ=255) cAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTtgttgt < 1:60415/149‑1 (MQ=255) ggAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCttg < 2:297927/143‑1 (MQ=255) ggAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCttg > 1:297927/1‑143 (MQ=255) cTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAgg > 3:84831/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGc > 6:218702/1‑147 (MQ=255) ggCCTGGTCCATGATGAACACACGCTACACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGc < 6:281757/147‑1 (MQ=255) tGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCgg > 4:76345/1‑149 (MQ=255) cATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGtttt < 5:218702/149‑1 (MQ=255) cATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGtttt < 4:134446/149‑1 (MQ=255) atgaACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCg > 3:57991/1‑147 (MQ=255) tgaACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCg > 4:8793/1‑146 (MQ=255) tgaACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGaa < 3:313508/148‑1 (MQ=255) tgaACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGaa < 3:8793/148‑1 (MQ=255) aaCACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGt > 6:259638/1‑148 (MQ=255) acacacGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAgcagcgtgtgttcatcatggaccaggccgagtcgttcctgccgctgtacctgcgcttcatcaagggtg < 1:294164‑M2/149‑69 (MQ=255) cacGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATgg < 5:259638/149‑1 (MQ=255) acGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTa < 3:253887/90‑1 (MQ=255) acGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTa > 4:253887/1‑90 (MQ=255) gCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAgcagcgtgtgttcatcatggaccaggccgagtcgttcctgccgctgtacctgcgcttcatcaagggtgtggtt < 3:261133‑M2/148‑74 (MQ=255) gCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGAtg < 3:308266/149‑1 (MQ=255) gTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCt > 2:72831/1‑149 (MQ=255) gTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCt > 2:67986/1‑149 (MQ=255) tACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCtt > 2:290990/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTg > 4:262786/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGaa > 5:64096/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTcc < 7:192119/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTa < 1:290990/149‑1 (MQ=255) gcgcTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGTCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTActcc < 6:115681/149‑1 (MQ=255) gcgcTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAgcagcgtgtgttcatcatggaccaggccgagtcgttcctgccgctgtacctgcgcttcatcaagggtgtggttgattccaatgacctgtcgctgaacgtgt > 2:294164‑M2/1‑48 (MQ=255) gcTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTActcctc < 3:262786/149‑1 (MQ=255) gcTTCGCGCTGGTAAAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCAAGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGCCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTActcctc < 3:189381/149‑1 (MQ=255) ttCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGt < 3:41646/149‑1 (MQ=255) tGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCAc > 4:50689/1‑149 (MQ=255) ggTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACt > 6:201789/1‑149 (MQ=255) tgaCAGGGCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTAAACCACCGTTTTTTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACtt < 7:206740/147‑1 (MQ=255) aCAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCg > 4:124867/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCg < 1:168831/148‑1 (MQ=255) gTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTgc > 5:151317/1‑149 (MQ=255) gcgcACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACgg > 8:277189/1‑149 (MQ=255) cgcACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACggg < 5:201789/149‑1 (MQ=255) gcACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACGGGt > 3:279779/1‑149 (MQ=255) cACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACGGGTc < 6:156014/149‑1 (MQ=255) aCGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACGGGTcc < 1:72831/149‑1 (MQ=255) aCGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACGGGTcc < 1:67986/149‑1 (MQ=255) cagcagCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACGGGTCCACAGGGCGCTGgcgc < 4:57991/149‑1 (MQ=255) | GAATCAACCACACCCTTGATGAAGCGCAGGTACAGCGGCAGGAACGACTCGGCCTGGTCCATGATGAACACACGCTGCACGTACAGCTTCAGGCCGCGCGGCGCTTCGCGCTGGTACAGGTCGAACGGCGCACGGGCCGGCACGTACAGCAGCGAGTTGTATTCGAGCTTGCCTTCGACCTTGTTGTGGCTCCAGGCCAGCGGGTTTTCGAAGTCATGGCCGATGTGCTTGTAGAACTCCTGGTACTCCTCGTCCTTCACTTCGGTGCGCGAACGGGTCCACAGGGCGCTGGCGC > NC_002947/4722566‑4722860 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |