Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,551,996 | T→C | 24.3% | S409P (TCA→CCA) | PP_4882 → | iron ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,551,996 | 0 | T | C | 24.3% | 117.7 / 37.6 | 70 | S409P (TCA→CCA) | PP_4882 | iron ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/24); new base C (9/8); total (38/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCTGCCCTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTGGTGTTC > NC_002947/5551851‑5552142 | tCTGCCCTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCACTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCAc > 5:330675/1‑149 (MQ=255) cccTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCg < 2:117076/147‑1 (MQ=255) cccTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGt < 4:206609/149‑1 (MQ=255) cccTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCg < 2:103450/147‑1 (MQ=255) cccTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGt > 7:146969/1‑149 (MQ=255) tATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTgcg > 4:6630/1‑149 (MQ=255) ctgcACGCCCTGCCCGGCCTAGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCa < 5:69393/145‑1 (MQ=255) cACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCACGCt > 6:345011/1‑149 (MQ=255) cACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCt < 8:289076/149‑1 (MQ=255) cccTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAAc < 5:307512/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAAc > 4:14499/1‑148 (MQ=255) cTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCTCGCTGAACaa < 5:345011/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAgg > 8:265015/1‑149 (MQ=255) tGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGcc > 7:29399/1‑148 (MQ=255) gATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGc > 6:146872/1‑149 (MQ=255) aTTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCt > 8:11832/1‑149 (MQ=255) gCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTgg < 2:168187/148‑1 (MQ=255) ccTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTACTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCAGAACAAGGCTTCGCCGACGCTgg > 5:27815/1‑146 (MQ=255) cTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGgaag > 7:124092/1‑148 (MQ=255) gtgtTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCcgcgc < 3:256403/148‑1 (MQ=255) tgtTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCgcgcgc > 5:35322/1‑149 (MQ=255) cttcGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGgaagaa < 7:187367/136‑1 (MQ=255) cttcGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGgaagaa > 8:187367/1‑136 (MQ=255) cttcGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCAccc > 2:274903/1‑149 (MQ=255) ccTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGgcg < 7:11832/149‑1 (MQ=255) cTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGgcgc < 5:146872/149‑1 (MQ=255) tACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGagcag > 3:116013/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCttt < 3:6630/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCttt < 6:269394/149‑1 (MQ=255) cGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGcc > 5:278055/1‑149 (MQ=255) cGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGcc > 4:106464/1‑149 (MQ=255) cGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTGCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGcc < 3:14499/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGagc > 2:61754/1‑139 (MQ=255) tGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTc > 2:202418/1‑149 (MQ=255) gTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCt > 8:66838/1‑149 (MQ=255) ccAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGc < 6:46194/148‑1 (MQ=255) cAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCg > 2:119684/1‑149 (MQ=255) cAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCg > 8:37375/1‑149 (MQ=255) gACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCggg > 6:346801/1‑149 (MQ=255) aCCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGt < 8:146969/149‑1 (MQ=255) cACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGa > 3:188010/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGAcc > 7:202925/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCtt < 5:346801/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGcc > 5:100678/1‑149 (MQ=255) ctgctgTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGat > 7:42635/1‑149 (MQ=255) ctgctgTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGa < 4:116013/148‑1 (MQ=255) ctgTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGatc < 6:330675/147‑1 (MQ=255) ctgTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGatc < 8:42635/147‑1 (MQ=255) ctgTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGatc < 8:202925/147‑1 (MQ=255) ttGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGatcatc < 1:49457/147‑1 (MQ=255) ttGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCtt > 8:35947/1‑149 (MQ=255) ggCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCACGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTc < 2:176837/148‑1 (MQ=255) ccTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCg < 1:274903/149‑1 (MQ=255) cTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCgg > 6:104491/1‑149 (MQ=255) cTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTCGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCATTGGCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCTTCTTCCCgg > 8:304683/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCa < 7:265015/148‑1 (MQ=255) cgcTGCTGTTCCTGCCTTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCAt < 1:119684/148‑1 (MQ=255) gctgctGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATgg > 4:165654/1‑149 (MQ=255) ctgctgTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATggc < 6:35322/149‑1 (MQ=255) cTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCtt > 7:270074/1‑149 (MQ=255) cTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCtt > 4:33758/1‑149 (MQ=255) cTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCtt > 4:210183/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCttt > 4:79899/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCttt > 5:259461/1‑149 (MQ=255) ccGTTGGCGCAACCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCttt < 5:104491/147‑1 (MQ=255) gTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTgcgc < 6:100678/149‑1 (MQ=255) ggCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCAGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTg < 6:27815/148‑1 (MQ=255) gcgcAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTgg < 7:66838/148‑1 (MQ=255) gcAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTGgtgt > 2:74945/1‑149 (MQ=255) aaTCACCGGTGCGCACCGAGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGAGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTGGTGTTc > 7:56395/1‑149 (MQ=255) | TCTGCCCTATCTGCTGCACGCCCTGCCCGGCCTGGTGATTGCCCTGACGTTGGTGTTCTTCGCCCTGCACTACGTGCCGGCGCTGTACCAGACCACGGCCTTGCTGCTGTTGGCCTATGCGCTGCTGTTCCTGCCGTTGGCGCAATCACCGGTGCGCACCGCGCTGAACAAGGCTTCGCCGACGCTGGAAGAAGCCGCGCGCACCCTTGGCGCGAGCAGCTTTGCCGCGTTCTGCCGGGTGACCTTGCCGATCATCTTCCCGGCCATGGCGGCAGCCTTTGCGCTGGTGTTC > NC_002947/5551851‑5552142 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |