Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,655,155 | T→A | 5.6% | S131C (AGC→TGC) | epd ← | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,655,155 | 0 | T | A | 5.6% | 216.9 / 2.2 | 71 | S131C (AGC→TGC) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/30); new base A (2/2); total (39/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 |
ATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGATGCCTTCGGGGGTGGCACTGC > NC_002947/5655008‑5655301 | atTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTg > 4:83312/1‑149 (MQ=255) tCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGc > 6:246075/1‑149 (MQ=255) gATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCa > 5:24012/1‑149 (MQ=255) cAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGc > 8:239976/1‑149 (MQ=255) cAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGc > 6:161329/1‑149 (MQ=255) cAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCAGCCCATggc > 8:56300/1‑147 (MQ=255) aaaCGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATgg < 4:225119/146‑1 (MQ=255) aaaCGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATgg > 3:225119/1‑146 (MQ=255) aaaCGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCt > 2:112745/1‑149 (MQ=255) aaaCGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCt > 2:203149/1‑149 (MQ=255) cGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGc > 1:158096/1‑148 (MQ=255) cGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCg < 7:29897/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCgag < 8:178687/149‑1 (MQ=255) cTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCAGCCCATGGCCAGCgagg < 7:56300/149‑2 (MQ=255) tGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGaa > 8:292536/1‑149 (MQ=255) cAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCa > 1:325386/1‑149 (MQ=255) cAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCa < 3:83312/149‑1 (MQ=255) aGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCAc > 5:160206/1‑149 (MQ=255) gCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCACTTGGTGGTGCACGAGGCGATGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCAATGGGCTGCGAGAACAGCAcc > 3:169594/1‑149 (MQ=255) cacaCGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGACGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCAccc < 8:166694/149‑1 (MQ=255) cacGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCtt < 5:302917/149‑1 (MQ=255) gcagcaGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGgc < 7:239976/149‑1 (MQ=255) gcagcaGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGgc < 2:207609/149‑1 (MQ=255) agcGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCAcc < 5:246075/149‑1 (MQ=255) agcGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCGTGccgatgg > 3:4159/1‑145 (MQ=255) gCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCt > 6:255561/1‑149 (MQ=255) gccgcAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGa < 1:211099/149‑1 (MQ=255) gccgcAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGa < 7:292536/149‑1 (MQ=255) ccgcAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCa < 1:86892/127‑1 (MQ=255) ccgcAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTAGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCa > 2:86892/1‑127 (MQ=255) ctggtggTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGATAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACg > 6:106499/2‑149 (MQ=255) ggtggtGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTACGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCt > 4:246335/1‑149 (MQ=255) gtgCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGc > 6:69426/1‑148 (MQ=255) cACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATc < 5:106499/149‑1 (MQ=255) cGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACgg < 1:203149/149‑1 (MQ=255) ggACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGgtg < 6:306648/148‑1 (MQ=255) gACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGgtgt < 6:24012/148‑1 (MQ=255) cacCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCga < 8:274747/90‑1 (MQ=255) cacCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCga > 7:274747/1‑90 (MQ=255) acCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTta > 5:94042/1‑147 (MQ=255) acCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTGCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTta > 3:34513/1‑147 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAgg > 4:5535/1‑149 (MQ=255) ggTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCa < 2:189129/149‑1 (MQ=255) gTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAg > 5:317160/1‑149 (MQ=255) gTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAg < 5:98819/149‑1 (MQ=255) aggcaggcCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCAc < 5:255561/149‑1 (MQ=255) aggcCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAgg > 5:49005/1‑149 (MQ=255) ggcCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGt < 2:325386/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTTGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGGACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCg < 4:169594/149‑1 (MQ=255) cTGGTTGATGCCGTAGACACCCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGa > 2:28873/1‑149 (MQ=255) gTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGc > 5:337047/1‑94 (MQ=255) gTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGc < 6:337047/94‑1 (MQ=255) gTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGc > 6:251881/1‑149 (MQ=255) gATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGcc > 3:108157/1‑147 (MQ=255) gCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAgcg > 4:51389/1‑149 (MQ=255) cGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCTGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGa < 8:241897/138‑1 (MQ=255) cGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGa > 7:241897/1‑138 (MQ=255) gTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAg < 2:158096/149‑1 (MQ=255) aaCCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGt < 1:125420/149‑1 (MQ=255) acagTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTc > 2:152728/4‑149 (MQ=255) aCCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTc < 6:94042/149‑1 (MQ=255) cGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGa > 2:50699/1‑149 (MQ=255) cGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCAACGGCTTCGAGGAAACGCTTGCCATAGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGa > 6:231398/1‑149 (MQ=255) cGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAg < 4:196601/89‑1 (MQ=255) cGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAg > 3:196601/1‑89 (MQ=255) cGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGACGCCTTCgggg < 3:51389/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGATGCCTTCGGGGGTg > 4:212147/1‑149 (MQ=255) gttcTCGCAGCCCATGGCCAGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGATGCCTTCggg > 6:990/4‑144 (MQ=255) gttcTCGCAGCCCATGGCCAGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGATGCCTTCggg < 5:990/141‑1 (MQ=255) cTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGa > 4:233500/1‑131 (MQ=255) gCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGATGCCTTCGGGGGTGGCACTgc < 5:251881/149‑1 (MQ=255) | ATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGTCGATGCCCAGCGCAGCCCAGTCGATGCCTTCGGGGGTGGCACTGC > NC_002947/5655008‑5655301 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |