Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,707,986 | G→C | 6.0% | Q668H (CAG→CAC) | PP_5009 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,707,986 | 0 | G | C | 6.0% | 217.7 / 2.9 | 67 | Q668H (CAG→CAC) | PP_5009 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/30); new base C (2/2); total (35/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.17e-01 |
GCTCGACGATGACGCGCGCCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGCGATCTTC > NC_002947/5707839‑5708133 | gCTCGACGATGTCGCGCGCCCGATTTACCATAACGACGTGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCTCTTGCTCATTGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCATCGCCTCAGACGCCCGGTCCAg < 4:70848/148‑1 (MQ=255) tCGACGATGACGCGCGCCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCAGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGt > 4:64728/1‑148 (MQ=255) acgaTGACGCGCGCCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCg > 2:217322/1‑149 (MQ=255) aTGACGCGCGCCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTc > 5:116585/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTCCCGATTTACCAGAACGACTGGGTCATGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCTCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGa < 4:258106/148‑1 (MQ=255) aCGCGCGCCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGa < 4:204829/148‑1 (MQ=255) cgcgcgCCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCACGCCTCGAACGAg > 1:35068/1‑148 (MQ=255) cgcgcCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCg < 7:263096/149‑1 (MQ=255) cgcgcCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGGCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGt < 7:178879/136‑1 (MQ=255) cgcgcCCGATTTACCAGAACGACGGGTTAAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGCCGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCACCTCCTCAGCCGCCCGGTCCAGGt > 8:178879/1‑136 (MQ=255) gcgcCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGt < 7:259482/149‑1 (MQ=255) gcgcCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGt < 1:73098/149‑1 (MQ=255) ccGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGAc > 4:911/1‑149 (MQ=255) cGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCACGCCTCGAACGAGACCTGGAcc < 1:189799/149‑2 (MQ=255) ttACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCACGCCTCGAACGAGACCTGGAccggg < 2:35068/148‑5 (MQ=255) aCCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGAc > 8:76868/1‑142 (MQ=255) aCCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGAc < 7:76868/142‑1 (MQ=255) ccAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATc > 2:173674/1‑149 (MQ=255) cAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCt > 5:196309/1‑149 (MQ=255) cAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCt < 7:112627/149‑1 (MQ=255) aGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCTTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTg < 5:14866/149‑1 (MQ=255) gAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTgg < 1:217322/149‑1 (MQ=255) cgacgGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGaca > 5:35857/1‑149 (MQ=255) cgGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGAcaccc > 7:198577/1‑149 (MQ=255) gggTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGAcaccca < 7:105163/149‑1 (MQ=255) ggTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTgg < 1:111655/141‑1 (MQ=255) ggTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTgg > 2:111655/1‑141 (MQ=255) ttCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCt < 4:60908/149‑1 (MQ=255) aGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGt‑t > 3:226744/1‑148 (MQ=255) gCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑Tc > 8:33254/1‑148 (MQ=255) ccGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTc > 3:44353/1‑108 (MQ=255) ccGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTc < 4:44353/108‑1 (MQ=255) gCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAAcgcgc < 6:196309/149‑1 (MQ=255) gCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAAcgcgc > 3:155451/1‑149 (MQ=255) ccGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGAc > 2:101678/1‑149 (MQ=255) ccGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCACGCCTCGAACGAGACCTGGAcc > 8:145537/1‑107 (MQ=38) gAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCa < 1:48036/149‑1 (MQ=255) ttACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTa < 4:155451/149‑1 (MQ=255) tACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTAt > 4:125240/1‑149 (MQ=255) cTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑Ct > 1:39145/1‑148 (MQ=255) cGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATg < 3:235654/134‑1 (MQ=255) cGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATg > 4:235654/1‑134 (MQ=255) gCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTcagc > 5:157972/1‑147 (MQ=255) aCTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTcagccag > 8:38808/1‑148 (MQ=255) aCTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTcagccag > 7:39253/1‑148 (MQ=255) aaTGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGGGGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGt > 1:241295/1‑149 (MQ=255) cGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAAt > 3:125764/1‑149 (MQ=255) cGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAAt < 5:291802/149‑1 (MQ=255) aGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGAGCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAg < 3:125240/149‑1 (MQ=255) aCTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAAcgc < 5:345474/90‑1 (MQ=255) aCTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAAcgc > 6:345474/1‑90 (MQ=255) cTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGaa < 4:299472/147‑1 (MQ=255) gACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGG‑AGTGCgg < 3:64728/149‑1 (MQ=255) aCGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCgg < 2:241295/149‑1 (MQ=255) ggCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGc < 6:35857/149‑1 (MQ=255) ccTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGc < 3:125439/143‑1 (MQ=255) ccTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGc > 4:125439/1‑143 (MQ=255) ttGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTgg < 2:39145/148‑1 (MQ=255) gCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGAcacccac < 7:253882/64‑1 (MQ=255) gCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGAcacccac > 8:253882/1‑64 (MQ=255) aGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGAGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGA‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGCGCTTTGGTGAAGGAGGCTGc > 8:186205/1‑149 (MQ=255) aCGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGTATCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCg > 1:262898/1‑149 (MQ=255) ccGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGc > 8:18593/1‑149 (MQ=255) ccGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGc > 7:240051/1‑149 (MQ=255) cGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGc > 7:282483/1‑148 (MQ=255) cGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGc > 4:124494/1‑148 (MQ=255) cGGTCCAGGGCCCGTTCCTCGCGTTGACGGTATATCTTGACAACCAACTGT‑TCAAAGCGCGTATCGCCACCATGTTATTTGCTTTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGc < 1:101678/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGCGATc < 4:125764/149‑1 (MQ=255) ggTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGCGATCTTc > 2:139514/1‑148 (MQ=255) ggTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGCGATCTTc > 5:296845/1‑148 (MQ=255) | GCTCGACGATGACGCGCGCCCGATTTACCAGAACGACGGGTTCAAGCACCCGCACTTGCACCCGAACATTACAGCGCTGACGCACTTGCTCAATGTGCCGGTCGAGCTACTGGACGGCCTTTTGCAACGCCTCAGACGCCCGGTCCAGGTCTCGTTCGAGGCGTGGACGGAAGATCTGGACACCCACCTGT‑TCAACGCGCGTATCGAGACCATGTTATTGGC‑CTCAGCCAGCAACAGCGTCTCCAATGCCCAGGAAGTGCGGGCTTTGGTGAAGGAGGCTGCGTGGGCGATCTTC > NC_002947/5707839‑5708133 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |