| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,063,465 | G→C | 7.1% | L118L (CTG→CTC) ‡ | ubiC → | chorismate pyruvate‑lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,063,465 | 0 | G | C | 7.1% | 225.5 / 6.2 | 70 | L118L (CTG→CTC) ‡ | ubiC | chorismate pyruvate‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/30); new base C (2/3); total (37/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
TGGGCATCGCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACCTGCTG > NC_002947/6063317‑6063612 | tGGGCATCGCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTg > 2:205051/1‑149 (MQ=255) aTCGCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGa < 5:51012/149‑1 (MQ=255) tCGCTGCCGGCTCCGAAGGCTGGGTGCTCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCAAACCTTGTGTATTCTCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTTGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAg < 3:52939/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGGCAACCTTGTGTATTCGCACGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAgctg < 8:258954/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCCCAGCGAgcggct < 5:43090/149‑1 (MQ=255) cgcCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCt < 5:2664/149‑1 (MQ=255) cgcCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCt < 5:272622/149‑1 (MQ=255) ccGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCAGCTCGCCCAGCGAGcggctgcccaag < 3:238678/149‑7 (MQ=255) gAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGa > 8:296578/1‑149 (MQ=255) ggCTTGGTGCGGGAAGTTTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGTGTATTCGCCCTCATCGTTGCCTGCCGCAGCGCCCTTGAACGTGGTGGCCTTGACCTGGAAACCTTTGGCAGCCGGTCGCTGGGCGTGCTGCTGTTCTGCGTcc < 4:15625/148‑1 (MQ=255) ggTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGAc > 8:245578/1‑142 (MQ=255) ggTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGAc < 7:245578/142‑1 (MQ=255) tGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGAGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGtt > 6:85319/1‑148 (MQ=255) gAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCg < 7:73597/149‑1 (MQ=255) gAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCg > 7:269532/1‑149 (MQ=255) aGTGTATCTGCGCGGCCATGGACAACCTTGGGTATTCGCCCGGAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTc < 8:247672/149‑1 (MQ=255) aTCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCa > 5:301317/1‑149 (MQ=255) tCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGt < 2:329495/134‑1 (MQ=255) tCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGt > 1:329495/1‑134 (MQ=255) tCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCAGCTCGCCCAGCGAgcggct > 7:132171/1‑117 (MQ=255) tCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCAGCTCGCCCAGCGAgcggct < 8:132171/117‑1 (MQ=255) tGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAACCCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGa > 7:119576/1‑124 (MQ=255) gcgcGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTc > 5:183170/1‑148 (MQ=255) gcgcGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAACGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTc > 4:276106/1‑148 (MQ=255) cgcgGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCAc < 7:296578/145‑1 (MQ=255) cgcgGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTc < 2:229532/147‑1 (MQ=255) ggCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAgt > 3:71633/1‑149 (MQ=255) ggCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAACGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAgt < 3:276106/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGtgtg > 1:42224/1‑149 (MQ=255) aTGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGGCCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGtgtg > 7:66671/1‑148 (MQ=255) ggCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAgt < 7:294496/143‑1 (MQ=255) ggCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAgt > 8:294496/1‑143 (MQ=255) ggCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCAc > 3:33843/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATc > 5:131414/1‑148 (MQ=255) cTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCca > 7:89974/1‑149 (MQ=255) ttGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATc > 5:57483/1‑125 (MQ=255) ttGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATc < 6:57483/125‑1 (MQ=255) ggTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAgg > 6:155378/1‑149 (MQ=255) tATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGTGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGcc > 8:285817/1‑149 (MQ=255) cGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTgg < 4:33843/148‑1 (MQ=255) cccGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTg < 1:59784/149‑1 (MQ=255) cccGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTg < 1:54864/149‑1 (MQ=255) cGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGcc > 6:184152/1‑149 (MQ=255) cGCAGAGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGcc < 5:85319/149‑1 (MQ=255) gCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTAt < 7:196920/131‑1 (MQ=255) gCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTAt > 8:196920/1‑131 (MQ=255) gCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCg < 5:90321/149‑1 (MQ=255) aGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTc < 6:301317/149‑1 (MQ=255) cGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGGCCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCg < 8:66671/149‑1 (MQ=255) tGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGaa < 5:155378/149‑1 (MQ=255) ccAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCt < 6:131414/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGcac < 4:325441/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACAt > 3:137241/1‑149 (MQ=255) aGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATgc < 6:183170/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGCCCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCAAATgcg > 2:294851/1‑149 (MQ=255) ccTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGgcgc > 7:220127/1‑149 (MQ=255) ccTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGgcgc > 8:62439/1‑149 (MQ=255) ccTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGgcgc > 7:312666/1‑149 (MQ=255) tGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCtt > 8:298256/1‑149 (MQ=255) aaCGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTgg < 5:184152/149‑1 (MQ=255) aaCGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTgg < 4:71633/149‑1 (MQ=255) gtggtgGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGgc > 6:99397/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAgcg > 8:102200/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCaa > 7:68162/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCaa > 2:82029/1‑149 (MQ=255) cagaacagcagCTCGCCCAGCGAGCGGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCaa > 5:134217/6‑149 (MQ=255) ccGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTg > 5:57172/1‑148 (MQ=255) gctcgctGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGAc > 2:79166/1‑149 (MQ=255) gctGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACctgc < 8:220127/149‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACctgctg > 6:294007/1‑149 (MQ=255) tGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACAAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTCGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACctgctg > 2:153279/1‑149 (MQ=255) | TGGGCATCGCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACCTGCTG > NC_002947/6063317‑6063612 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |