Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,091,878 | G→C | 6.5% | P101P (CCG→CCC) | PP_5343 → | putative Transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,091,878 | 0 | G | C | 6.5% | 229.5 / 2.1 | 71 | P101P (CCG→CCC) | PP_5343 | putative Transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/38); new base C (3/2); total (31/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCATGGAAAGTCACCGACG > NC_002947/6091732‑6092014 | aCTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGAc < 7:147915/149‑1 (MQ=255) tgtATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCt < 2:239080/147‑1 (MQ=255) tgtATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTg < 4:128117/148‑1 (MQ=255) gtATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTgg > 2:119933/1‑148 (MQ=255) tATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCTGACCTGGaa < 5:150553/149‑1 (MQ=255) tATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCAATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCAAAGGTGGTGCACACCTCGa > 4:192682/1‑148 (MQ=255) ccgaCCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTAc < 8:52808/146‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTgg < 5:335239/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCgg > 6:201965/1‑149 (MQ=255) gCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGt < 1:239739/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGCCAACGTCCAATGTCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTCCTGGTATTCCCCGGCGCCGTTGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGGTATTACCCAATCATGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTTCCGACCTGGAACTTCCTGGCg < 4:122214/147‑1 (MQ=255) cAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCt > 7:309449/1‑148 (MQ=255) aCCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTAt < 7:213084/149‑1 (MQ=255) ccGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCCACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATg > 4:137421/1‑149 (MQ=255) ccGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCCACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATg > 4:132486/1‑149 (MQ=255) cGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGCCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑C‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATgg > 1:192660/1‑149 (MQ=255) gCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGc < 1:296624/149‑1 (MQ=255) gCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGc < 3:192682/149‑1 (MQ=255) ccAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGcc > 5:169666/1‑149 (MQ=255) aaTGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCg < 1:119933/149‑1 (MQ=255) gCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGcc > 7:141755/1‑148 (MQ=255) gCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCCACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGcc < 3:137421/148‑1 (MQ=255) gCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCCACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGcc < 3:132486/148‑1 (MQ=255) aaGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGaa < 4:304396/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGt < 3:21529/122‑1 (MQ=255) cTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGt > 4:21529/1‑122 (MQ=255) gcaCGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGaa < 3:152768/139‑1 (MQ=255) gcaCGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGaa > 4:152768/1‑139 (MQ=255) gcaCGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCAt > 1:158492/1‑148 (MQ=255) gcaCGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCACCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCCAGCAAGGCCGAAACCCCCAAGGTGGTGCCGACCTGCAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGCCCCGGCGGAAGTAATCCAt > 5:225410/1‑148 (MQ=255) caCGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGa < 8:141755/149‑1 (MQ=255) gcggcgAAGCACTGCTGGTATTCCACGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGcc < 6:91881/149‑1 (MQ=255) ggcgAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGcc > 2:312515/1‑147 (MQ=255) cgAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGCTCCAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGa < 1:114295/149‑1 (MQ=255) gAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGcc > 5:214346/1‑149 (MQ=255) aGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGc < 8:309449/149‑1 (MQ=255) tgctgGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTg > 6:2438/1‑149 (MQ=255) ctgGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGc > 5:105691/1‑149 (MQ=255) tgGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGc < 6:230507/115‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGATCTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGa < 1:239488/128‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGa > 2:239488/1‑128 (MQ=255) gTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTa < 4:260067/148‑1 (MQ=255) ccccGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGa > 6:246732/1‑123 (MQ=255) ccccGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGa < 5:246732/123‑1 (MQ=255) cccGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CCGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAACCCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTaa < 7:159644/148‑1 (MQ=255) cGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGcc > 3:129623/1‑124 (MQ=255) cGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGcc < 4:129623/124‑1 (MQ=255) gcCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCt < 6:105691/149‑1 (MQ=255) cGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTga < 5:201965/149‑1 (MQ=255) cGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTga < 6:169666/149‑1 (MQ=255) cTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAgccgc > 3:310258/1‑139 (MQ=255) cTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAgccgc < 4:310258/139‑1 (MQ=255) cTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTgaccgacc > 2:328216/1‑149 (MQ=255) tATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGaccgaccg > 5:106547/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGCTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCAc < 2:192660/148‑1 (MQ=255) ccGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAg > 5:338768/1‑149 (MQ=255) ccGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAg > 2:45515/1‑149 (MQ=255) ttACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCg > 1:8905/1‑147 (MQ=255) ttACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCa < 1:328216/149‑1 (MQ=255) cccAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAg > 6:6467/1‑114 (MQ=255) aagcaagGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAAc > 8:311945/1‑149 (MQ=255) caagGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCAt < 4:132625/149‑1 (MQ=255) caagGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCAt < 6:214346/149‑1 (MQ=255) caagGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCAt > 8:316555/1‑149 (MQ=255) agGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCATgg < 5:2438/149‑1 (MQ=255) ccGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCATGGaaa < 6:106547/149‑1 (MQ=255) aaCCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCATGGAAAGTCAc < 2:8905/149‑1 (MQ=255) ccccAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCATGGAAAGTCACCg < 7:316555/149‑1 (MQ=255) cccAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACa > 6:69392/1‑119 (MQ=255) cccAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACa < 5:69392/119‑1 (MQ=255) cAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCATGGAAAGTCACCGACg > 4:204066/1‑149 (MQ=255) | ACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATG‑T‑CAGCCCCGGCTATTACCCAAGCAAGGCCGAAAACCCCAAGGTGGTGCCGACCTGGAACTACCTGGCGGTGCACGCTTATGGCCCGGCCGAAGTTATCCATGAGGCCGAGCCGCTACTGGCTATCGTAAGCCGCCTGACCGACCGCCACGAACAGGGTCGCAGCGAACCATGGAAAGTCACCGACG > NC_002947/6091732‑6092014 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |