| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,171,861 | A→T | 8.1% | L147L (CTT→CTA) ‡ | glmS ← | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,171,861 | 0 | A | T | 8.1% | 182.1 / 5.3 | 62 | L147L (CTT→CTA) ‡ | glmS | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/30); new base T (2/3); total (29/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.28e-01 | |||||||||||
GTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCGATGATGCCGTTGTG > NC_002947/6171720‑6172007 | gTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTTGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGACGCCCTTAAg < 7:109511/145‑1 (MQ=255)gTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTaa < 1:148808/143‑1 (MQ=255)gTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTaa > 2:148808/1‑143 (MQ=255)gTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGt > 2:21814/1‑149 (MQ=255) tCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTc < 1:49628/149‑1 (MQ=255) cGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGTCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGACGCCCTTAAggcggcg < 1:81141/149‑6 (MQ=255) aCGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTc < 5:341127/149‑1 (MQ=255) cGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCa < 4:141228/149‑1 (MQ=255) gCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAg < 7:27508/149‑1 (MQ=255) gCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGACG‑CCCTTAAGGCGGCGGtgaa < 2:184053/149‑4 (MQ=255) gCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGAAAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCGGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAg < 2:294157/149‑1 (MQ=255) ccAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGACG‑CCCTTAAGGCGGCGGtgaag < 8:174905/149‑5 (MQ=255) cAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGt > 6:184702/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGAT‑AGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTc > 2:67951/1‑149 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAAt > 3:265693/1‑149 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGACG‑CCCTTAAGGcggcgg < 8:233053/136‑1 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGACG‑CCCTTAAGGcggcgg > 7:233053/1‑136 (MQ=255) gCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGctct > 8:17433/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGCTCAGGTCTGGAATGCTCtt > 8:8554/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCt > 5:330328/1‑137 (MQ=255) cAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCt < 6:330328/137‑1 (MQ=255) cAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGgtgt > 8:96932/1‑149 (MQ=255) gCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggt > 8:46042/1‑149 (MQ=255) aTAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGAt < 1:21814/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAgg > 4:156961/1‑149 (MQ=255) aGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCg < 4:177838/108‑1 (MQ=255) aGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCg > 3:177838/1‑108 (MQ=255) gggCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTg < 6:218262/146‑1 (MQ=255) gggCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTg > 5:218262/1‑146 (MQ=255) gggCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGAc < 5:184702/149‑1 (MQ=255) ccACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGAT‑AGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGa < 1:67951/147‑1 (MQ=255) gctgcCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATc > 6:304001/1‑149 (MQ=255) ctgcCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCg < 5:309094/149‑1 (MQ=255) gcCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCgg > 4:222085/1‑148 (MQ=255) accaGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTg > 4:51026/1‑149 (MQ=255) accaGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTg > 5:141848/1‑149 (MQ=255) tCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGaa < 3:156961/149‑1 (MQ=255) tCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGaa < 7:96932/149‑1 (MQ=255) cGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAg < 7:17433/148‑1 (MQ=255) ggCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGa > 1:205896/1‑148 (MQ=255) ctgctTGGCAATGATCAGCTCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACAt < 4:245784/149‑1 (MQ=255) cACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAgg > 4:263889/1‑149 (MQ=255) aCTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGTTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGc < 1:94444/149‑1 (MQ=255) aCTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGc > 3:75426/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGaa < 2:98755/125‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGaa > 1:98755/1‑125 (MQ=255) cAGCGCCAGCCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTc < 4:265693/148‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCa < 7:8554/148‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAg < 3:222085/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTc < 3:51026/149‑1 (MQ=255) gCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTcgc < 7:140796/149‑1 (MQ=255) cGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGcc < 6:136821/133‑1 (MQ=255) cGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGcc > 5:136821/1‑133 (MQ=255) tGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATg < 7:46042/149‑1 (MQ=255) gcTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTtctc > 1:70558/1‑148 (MQ=255) cTTCACGGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGTTGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCga < 3:263889/149‑1 (MQ=255) cTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCga < 2:70558/149‑1 (MQ=255) ttCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCgat > 1:26792/1‑149 (MQ=255) cACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCgatag > 5:204087/1‑147 (MQ=255) cACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCga < 6:204087/146‑1 (MQ=255) ccgacg‑CCCTTAAGGCGGCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCGatgatg > 5:193655/1‑149 (MQ=255) cTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATg > 4:175805/1‑129 (MQ=255) ttAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCGATGATGCCGTtgtg > 7:271418/1‑149 (MQ=255) tAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCGATGATGCCGTtgtg > 2:229577/1‑148 (MQ=255) | GTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCGATGATGCCGTTGTG > NC_002947/6171720‑6172007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |