| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,173,535 | T→A | 5.2% | E368D (GAA→GAT) | glmU ← | bifunctional N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,173,535 | 0 | T | A | 5.2% | 240.9 / 2.6 | 77 | E368D (GAA→GAT) | glmU | bifunctional N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/35); new base A (2/2); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
TCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACGGGCCAGCATC > NC_002947/6173390‑6173675 | tCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCg < 3:107614/149‑1 (MQ=255) cgcgCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGAAATCGGTGCGCGCACCAATATCgg < 7:165306/149‑1 (MQ=255) cgcgCAGGACTTGTTTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAAGA‑CGGCTTCACCCATCACGGTCTTTATCTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGGCGATATTGGTGCGCGCACCGTTTTCgg < 7:283186/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGc < 6:157364/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATc < 8:35581/149‑1 (MQ=255) cGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATcc > 8:107834/1‑149 (MQ=255) tGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCTCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCagg > 5:47425/1‑149 (MQ=255) gATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCagg > 6:270053/1‑148 (MQ=255) aTTTCCACAGGTGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCTATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCagg > 7:180566/1‑147 (MQ=255) tCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCaggtaggt > 6:232851/1‑149 (MQ=255) cacaGGCGGCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGATCA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCATGTAGGTc < 5:341622/148‑1 (MQ=255) acaGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAg > 6:319734/1‑149 (MQ=255) aGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGt < 7:24039/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGt < 7:174777/149‑1 (MQ=255) gcgcCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACATCGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCag > 1:218414/1‑137 (MQ=255) gcgcCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGa > 6:196337/1‑149 (MQ=255) caGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCt > 4:210693/1‑149 (MQ=255) gCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTg < 4:5224/149‑1 (MQ=255) gCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGAAATCGGTGCGCGCACCAATATCGGc > 6:315387/1‑118 (MQ=39) gCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGAAATCGGTGCGCGCACCAATATCGGc < 5:315387/118‑1 (MQ=39) gtgttgttCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGTTGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGc < 5:41717/147‑1 (MQ=255) ttCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCtt > 4:281151/1‑148 (MQ=255) cGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGc > 2:64447/1‑141 (MQ=255) cGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGc < 1:64447/141‑1 (MQ=255) cGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCAc > 1:209067/1‑149 (MQ=255) aaCCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCTCCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCAcc > 4:185167/1‑148 (MQ=255) aaCCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGAc < 2:231880/129‑1 (MQ=255) aaCCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGAc > 1:231880/1‑129 (MQ=255) cGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTc > 8:75813/1‑119 (MQ=255) cGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTc < 7:75813/119‑1 (MQ=255) aca‑cGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCg > 5:298618/1‑149 (MQ=255) a‑cGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGtt > 8:121386/1‑149 (MQ=255) gTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGAGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCACAGGTAGGTCAGGTGCCCAGCCTTGGCCCCTTCACACAGGTGGGCGtttt > 6:30267/1‑149 (MQ=255) cACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCa < 5:282337/147‑1 (MQ=255) aCCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGCGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGtt > 2:18646/1‑149 (MQ=255) cccATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGtt > 4:134047/1‑148 (MQ=255) ccATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTc > 7:184769/1‑148 (MQ=255) cATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCaa < 6:298618/149‑1 (MQ=255) aTCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAAc < 1:24847/149‑1 (MQ=255) aCGGTCTTGAACTTGTTGGCGGCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCACCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGaa < 5:30267/149‑1 (MQ=255) aCGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGTTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCACAAGGTAGGTCAGGTGACCAGCATTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCaaag > 7:305232/1‑145 (MQ=255) aCGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACg > 5:128650/1‑147 (MQ=255) aCGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACg > 4:155556/1‑147 (MQ=255) ggTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGt > 2:112170/1‑149 (MQ=255) gTCTTGAACTTGTTGGCACCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGc < 7:27702/110‑1 (MQ=255) gTCTTGAACTTGTTGGCACCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGCCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTCACCAGCATAGGc > 8:27702/1‑110 (MQ=255) cTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTAc > 1:218891/1‑149 (MQ=255) gAACTTGTTGGCACCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTAccc > 6:128127/1‑148 (MQ=255) gttgGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATgg < 3:14757/148‑1 (MQ=255) ttgGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGc > 5:231629/1‑149 (MQ=255) gcCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTg < 4:160792/148‑1 (MQ=255) gcCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTg > 3:160792/1‑148 (MQ=255) ccATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCCCCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGc > 4:258118/1‑149 (MQ=255) ccATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGc < 5:270053/149‑1 (MQ=255) ccATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGc < 2:218891/149‑1 (MQ=255) tCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTc < 8:180566/149‑1 (MQ=255) tCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTc < 5:196337/149‑1 (MQ=255) tCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTc < 3:210693/149‑1 (MQ=255) gTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCa < 3:281151/149‑1 (MQ=255) gATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCg < 7:121386/149‑1 (MQ=255) gATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCg > 2:190040/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCgg < 5:319734/149‑1 (MQ=255) tGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCgg < 5:128127/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGgc < 1:112170/148‑1 (MQ=255) tGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGgcgc < 6:47425/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAg < 2:209067/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGc > 3:286625/1‑149 (MQ=255) gatgcCGAAATCGGTGCGCGCACCAATATCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGc > 8:131525/4‑149 (MQ=255) ggTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACggg < 1:130189/148‑1 (MQ=255) gTGCGCGCACAGATTTCGGCAGCCCCCAGGTATGTCAGGTGACCAGCCTTGTCCCCTTCACCCAGGTTGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACGGTcc < 8:305232/149‑1 (MQ=255) tGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACGGGc > 5:609/1‑147 (MQ=255) gcgcgcACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTg > 4:100212/1‑106 (MQ=255) gcgcgcACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTg < 3:100212/106‑1 (MQ=255) gcACCGATTTTGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACGGGCCAGCATc > 3:259962/1‑149 (MQ=255) gcACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACGGGCCAGCATc > 2:45743/1‑149 (MQ=255) aCCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACgg > 8:187708/1‑138 (MQ=255) aCCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACgg < 7:187708/138‑1 (MQ=255) | TCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACA‑CGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAACGGGCCAGCATC > NC_002947/6173390‑6173675 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |