| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 503,593 | T→A | 7.8% | F208L (TTT→TTA) ‡ | PP_0414 → | polyamine ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 503,593 | 0 | T | A | 7.8% | 186.2 / 5.4 | 64 | F208L (TTT→TTA) ‡ | PP_0414 | polyamine ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/26); new base A (2/3); total (35/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 | |||||||||||
GGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGT > NC_002947/503446‑503732 | ggCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGCCCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGCGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTg > 8:274804/1‑149 (MQ=255)ggCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGttt > 6:206449/1‑148 (MQ=255) gACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACg < 6:131342/149‑1 (MQ=255) gCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTACTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTCAAACGAgg < 5:250018/149‑1 (MQ=255) gCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtg > 1:51220/1‑149 (MQ=255) cAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggt < 8:3589/149‑1 (MQ=255) gggTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggtggt > 8:278505/1‑149 (MQ=255) tACATTGTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTGACCTCTGCTTGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCTCTGTTTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGATCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtgg < 8:90248/136‑1 (MQ=255) tACAATCTGGTGAGTGCGGC‑GGCCAGACTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCA‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAgttgg > 7:90248/1‑136 (MQ=255) cAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGttt < 6:75895/124‑1 (MQ=255) aaTCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCt > 7:56346/1‑149 (MQ=255) aaTCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTCAAACGAggtg < 7:192252/132‑1 (MQ=255) aaTCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTCAAACGAggtg > 8:192252/1‑132 (MQ=255) gtgcgtgcGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCgc < 4:147401/146‑1 (MQ=255) ggc‑ggcCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGATTTAGCTCGGGAGCCCTTGGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCgccgggccg > 1:106214/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCaa < 3:197023/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCaa > 5:299915/1‑148 (MQ=255) ccTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAacac < 7:278505/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCAT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAacac > 2:179529/1‑149 (MQ=255) ctctGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATg > 7:131149/1‑149 (MQ=255) tctGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGt > 4:158103/1‑149 (MQ=255) tgctgGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGtt > 4:160033/1‑148 (MQ=255) tgGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGc > 3:137213/1‑149 (MQ=255) tgGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCACGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGc > 6:180214/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCGCCGGGTGACCCTGTCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCgg > 6:68855/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCgg > 3:181472/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCgg > 7:172388/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCg < 7:86478/148‑1 (MQ=255) gccgccgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCGACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTa < 3:186111/146‑1 (MQ=255) gccgGGTGACCCTGTCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcgc < 5:68855/149‑1 (MQ=255) cgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcgc > 3:118374/1‑147 (MQ=255) tGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAAc < 6:299915/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGAt > 4:185131/1‑122 (MQ=255) cTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGAt < 3:185131/122‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAg > 1:163107/1‑149 (MQ=255) cGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCg < 3:158103/149‑1 (MQ=255) aTTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCAt > 5:145617/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGa > 2:68544/1‑144 (MQ=255) ttGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGa < 1:68544/144‑1 (MQ=255) cgcCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCTGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGcc > 3:20084/1‑149 (MQ=255) cgcCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGc < 2:106214/148‑1 (MQ=255) ggTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCgcggc > 6:112560/1‑149 (MQ=255) tg‑‑tCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCgcggcgg < 3:160033/149‑1 (MQ=255) tg‑‑tCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCgcggcgg > 2:61869/1‑149 (MQ=255) tctcGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGAcc > 2:253367/1‑149 (MQ=255) gggAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGc < 8:172388/149‑1 (MQ=255) ggAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCt > 7:45483/1‑149 (MQ=255) gAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTg < 5:112560/149‑1 (MQ=255) aGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGa < 5:206449/149‑1 (MQ=255) cccT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCTGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGAtt < 4:181472/149‑1 (MQ=255) cccT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGAtt > 2:211539/1‑149 (MQ=255) cccT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGGTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGAtt < 8:56346/149‑1 (MQ=255) cT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGAt > 5:48430/1‑146 (MQ=255) cT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGAt < 6:48430/146‑1 (MQ=255) cT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGc < 1:179529/149‑1 (MQ=255) gcctttgccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTtctc > 8:155912/1‑149 (MQ=255) cctttgccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCg > 3:197053/1‑149 (MQ=255) cctttgccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTCCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCAGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTtctag > 4:210680/1‑147 (MQ=255) tgccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGgt < 1:61869/147‑1 (MQ=255) tgccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGgt < 2:51220/147‑1 (MQ=255) caccACCTCGTCAAACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTtctc < 5:46467/142‑1 (MQ=255) caccACCTCGTCAAACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTtctc > 6:46467/3‑144 (MQ=255) gccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGgtgt < 4:137213/148‑1 (MQ=255) ccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgttg < 7:155912/149‑1 (MQ=255) ccACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgttg > 8:266229/1‑149 (MQ=255) cACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgttgt > 5:275701/1‑149 (MQ=255) | GGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGC‑GGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTG‑‑TCATCTCGGGAGCCCT‑‑GTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGT > NC_002947/503446‑503732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |