| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 505,155 | T→C | 5.8% | F179F (TTT→TTC) | PP_0416 → | phosphoglycolate phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 505,155 | 0 | T | C | 5.8% | 202.0 / 2.2 | 72 | F179F (TTT→TTC) | PP_0416 | phosphoglycolate phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/32); new base C (2/2); total (37/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.41e-01 | |||||||||||
GGCCCGCTGCTGGACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTGCGCGCATTGCTGCC > NC_002947/505012‑505298 | ggCCCGCTGCTGGACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCgg > 6:125593/1‑149 (MQ=255)ggCCCGCTGCTGGACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCg < 6:269594/148‑1 (MQ=255) gCCCGCTGCTGGACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGt < 1:33479/149‑1 (MQ=255) cGCTGCTGGACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGAt > 3:248489/1‑149 (MQ=255) gctgGACCAGATGAAGATCGGTAATTTCATCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTcgc < 6:273295/149‑1 (MQ=255) ctgGACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTcgcg < 5:67882/149‑1 (MQ=255) gACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCgcgc < 6:87616/147‑1 (MQ=255) gACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTAGCGCAg > 5:198250/1‑149 (MQ=255) aCCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTGGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGt > 2:158931/1‑149 (MQ=255) aGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGAc < 4:49678/149‑1 (MQ=255) aGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGAc < 2:324296/149‑1 (MQ=255) aGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGAc < 4:248489/149‑1 (MQ=255) gATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACg > 2:303454/1‑149 (MQ=255) gATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTCGTCGGTGATTCGCGCAGTGACg > 4:297580/1‑149 (MQ=255) gATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTCGTCGGTGATTCGCGCAGTGACg > 4:292651/1‑149 (MQ=255) aTCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAggc < 6:293356/149‑1 (MQ=255) aTCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAggc > 4:298658/1‑149 (MQ=255) ggTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAggcgg < 8:90186/148‑1 (MQ=255) gTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAggcggc > 2:59597/1‑148 (MQ=255) gTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAggcggc > 4:289882/1‑148 (MQ=255) tAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGcc > 3:28094/1‑148 (MQ=255) aTTTCTTCCGCTGGATGATTGGTGGCGACACCTTGGAGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGAGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGGAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTg < 4:99538/137‑1 (MQ=255) aTTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAg > 8:191572/1‑149 (MQ=255) aTTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTAGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTg > 3:99538/1‑137 (MQ=255) tttCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAgg < 4:137121/149‑1 (MQ=255) ttcttcCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAggc > 2:259692/1‑149 (MQ=255) cttcCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAgg < 8:47489/146‑1 (MQ=255) cttcCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAgg > 7:47489/1‑146 (MQ=255) cGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTg < 2:34899/148‑1 (MQ=255) gCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCGGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGc < 2:261352/149‑1 (MQ=255) aTCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTcgc > 3:66565/1‑112 (MQ=255) aTCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTcgc < 4:66565/112‑1 (MQ=255) tCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTCGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCaa < 3:297580/149‑1 (MQ=255) tCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTCGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCaa < 3:292651/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAAt < 5:125593/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAAt < 1:59597/148‑1 (MQ=255) ttGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGc > 5:79972/1‑149 (MQ=255) ttGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCACAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGc > 4:54066/1‑149 (MQ=255) tggCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAg > 2:249723/1‑118 (MQ=255) tggCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAg < 1:249723/118‑1 (MQ=255) tggCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCg < 3:268926/137‑1 (MQ=255) tggCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCg > 4:268926/1‑137 (MQ=255) gCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGc < 7:191572/149‑1 (MQ=255) acacCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCt > 2:229668/1‑148 (MQ=255) gCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTAc < 6:198250/148‑1 (MQ=255) gCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTAc < 6:79972/148‑1 (MQ=255) gCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGc > 7:272650/1‑148 (MQ=255) cAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCta > 6:79091/1‑149 (MQ=255) aGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTGGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCtat < 1:158931/149‑1 (MQ=255) aaGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAg > 6:292961/1‑96 (MQ=255) gCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATg < 4:28094/149‑1 (MQ=255) cccGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATggccggc < 8:272650/149‑1 (MQ=255) cccGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATggccggc < 1:229668/149‑1 (MQ=255) ggcggcGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGa < 3:289882/149‑1 (MQ=255) cGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATccc > 5:205509/1‑149 (MQ=255) aTGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCAt > 6:175343/1‑120 (MQ=255) aGATGGCCGGTGTCACCCCACAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTg < 3:54066/149‑1 (MQ=255) aGATGGCCGGTGGCACCCCGCAGCAGGCCCTGGTGGGCGGTGATGCGCGCAGTGACGTGCAGCCGGCCAAGGCGGCGGGCGTGCATTGCGTGGGTCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTg < 1:259692/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTaa > 6:89526/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAAt < 5:89526/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATc > 7:154939/1‑149 (MQ=255) aCCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCCTGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGCCGACCt > 8:278011/1‑149 (MQ=255) aCCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAAt > 7:147888/1‑140 (MQ=255) aCCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAAt < 8:147888/140‑1 (MQ=255) aCCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCt > 1:179926/1‑149 (MQ=255) cccGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTgc > 4:2841/1‑149 (MQ=255) gcagcaGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTgcgcg > 7:52620/1‑149 (MQ=255) agcagTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTGCGCGCa > 7:62624/1‑149 (MQ=255) cagTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTGCGCGCAtt > 3:218356/1‑149 (MQ=255) ccTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTTGGCCTGACCTACGGCTATATCCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTGCGCGCATtgctgc < 5:235103/149‑1 (MQ=255) ccTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGCCGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTGCGCGCATtgctgc > 8:291517/1‑149 (MQ=255) cTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTGCGCGCATTGCTGcc > 3:133270/1‑149 (MQ=255) | GGCCCGCTGCTGGACCAGATGAAGATCGGTAATTTCTTCCGCTGGATCATTGGTGGCGACACCTTGCCGCAGAAAAAGCCCGACCCGGCGGCGTTGCTGTTCGTCATGCAGATGGCCGGTGTCACCCCGCAGCAGTCCCTGTTTGTCGGTGATTCGCGCAGTGACGTGCAGGCGGCCAAGGCGGCTGGCGTGCAATGCGTGGGCCTGACCTACGGCTATAACCATGGCCGGCCGATCGACGCCGAATCCCCCAGCCTGGTAATCGACGACCTGCGCGCATTGCTGCC > NC_002947/505012‑505298 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |