Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 508,220 | T→A | 6.9% | N264I (AAC→ATC) ‡ | estP ← | esterase EstP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 508,220 | 0 | T | A | 6.9% | 164.5 / 2.9 | 58 | N264I (AAC→ATC) ‡ | estP | esterase EstP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/20); new base A (2/2); total (36/22) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.78e-01 |
TAATCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGTGG > NC_002947/508076‑508368 | tAATCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTg > 6:202858/1‑149 (MQ=255) cGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCg > 5:216476/1‑149 (MQ=255) cAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGACCTGGTCggca < 5:260778/149‑4 (MQ=255) aaTCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTgg > 6:310055/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGc < 5:13386/149‑1 (MQ=255) gctgctGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAgg < 6:216476/149‑1 (MQ=255) cccGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAact > 3:228526/1‑148 (MQ=255) ggTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGc > 1:6483/1‑148 (MQ=255) ggTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGc > 3:240019/1‑148 (MQ=255) gACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAgc < 5:202858/148‑1 (MQ=255) aCCGAGTCGTTGAACAGCAGTGTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCAGTACACCGGGTTTTACACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAgcgc < 4:188501/149‑1 (MQ=255) cGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCt > 2:239584/1‑149 (MQ=255) aGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCg > 2:116080/1‑149 (MQ=255) aaCAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACa < 5:310055/148‑1 (MQ=255) aaCAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACa < 2:6483/148‑1 (MQ=255) aCAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTgggg < 7:103504/125‑1 (MQ=255) aCAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTgggg > 8:103504/1‑125 (MQ=255) gTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAgg > 7:79811/1‑148 (MQ=255) gTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAgg > 2:20978/1‑148 (MQ=255) tttGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCATCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTg > 4:174799/1‑97 (MQ=255) tttGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGa > 5:8675/1‑149 (MQ=255) tttGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGa > 1:228447/1‑149 (MQ=255) tCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGtt > 5:182973/1‑148 (MQ=255) tCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTg > 8:151948/1‑148 (MQ=255) cTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTCGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGa < 1:239584/149‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGa < 4:240019/146‑1 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGc > 6:84243/1‑70 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGc < 5:84243/70‑1 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATc > 8:190845/1‑149 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATc > 8:269975/1‑149 (MQ=255) ccGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGTGCGCTGGCCAGGCCGAACTGACGGGGGCGGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCt < 8:305412/148‑1 (MQ=255) ccGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTg > 4:293377/1‑149 (MQ=255) cacCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGAt > 4:291906/1‑114 (MQ=255) cacCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGAt < 3:291906/114‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATGAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAgc > 1:198880/1‑149 (MQ=255) cGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAgct > 6:159171/1‑149 (MQ=255) ttCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGa > 6:267860/1‑149 (MQ=255) cACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCa < 7:151948/149‑1 (MQ=255) cacAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGt < 7:20054/147‑1 (MQ=255) aGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATTTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGa < 5:293766/148‑1 (MQ=255) aGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATTTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGa > 6:293766/1‑148 (MQ=255) gccgcTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTg > 3:323303/1‑148 (MQ=255) ccgcTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGTCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACATCAAAGGGATGTTCAGt < 3:312552/96‑1 (MQ=255) ccgcTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCAAGGTCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACATCAAAGGGATGTTCAGt > 4:312552/1‑96 (MQ=255) aGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAACTGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGga < 1:97740/149‑1 (MQ=255) agcGACCAGAACCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGa < 4:288446/117‑1 (MQ=255) agcGACCAGAACCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGa > 3:288446/3‑119 (MQ=255) agcGACCAGAACCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGagag > 1:33779/3‑147 (MQ=255) ccGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCa < 1:116080/148‑1 (MQ=255) ccGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCa < 7:190845/148‑1 (MQ=255) ccGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAg > 8:40047/1‑149 (MQ=255) gACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGt > 7:214503/1‑148 (MQ=255) aCCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGa > 7:98855/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGa < 4:228526/149‑1 (MQ=255) cAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGa > 6:342589/1‑147 (MQ=255) cAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGa > 1:299764/1‑147 (MQ=255) gTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGCGAGCTGTGACAggg > 4:203611/1‑147 (MQ=255) gTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGTg > 5:128551/1‑149 (MQ=255) ttCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGTgg < 6:8675/149‑1 (MQ=255) ttCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGTgg < 2:198880/149‑1 (MQ=255) | TAATCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTAT‑AGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAA‑TGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGTGG > NC_002947/508076‑508368 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |