| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 683,651 | A→G | 6.3% | L67P (CTG→CCG) | PP_0585 ← | MerR family metal‑sensitive transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 683,651 | 0 | A | G | 6.3% | 233.5 / 4.4 | 79 | L67P (CTG→CCG) | PP_0585 | MerR family metal‑sensitive transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/37); new base G (2/3); total (39/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
TCACCCTGACAGTGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACG > NC_002947/683507‑683799 | tcACCCTGACAGTGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCaa > 3:108396/1‑149 (MQ=255)tcACCCTGACAGTGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCa > 3:284076/1‑148 (MQ=255) ccTGACAGTGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCGGCAAGTTg > 3:76496/1‑149 (MQ=255) ccTGACAGTGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTg > 1:216831/1‑149 (MQ=255) cTGACAGTGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGc > 2:119673/1‑149 (MQ=255) tGACAGTGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGcc > 2:35960/1‑149 (MQ=255) tGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGAcctc > 4:31554/1‑149 (MQ=255) tGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGAcctc > 5:311244/1‑149 (MQ=255) cGAAACCAGCTCGCCTAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCACCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGAc < 4:232325/144‑1 (MQ=255) cGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCACCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGAc > 3:232325/1‑144 (MQ=255) gAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCGGCAAGTTGCTGAccttgtg < 3:97854/149‑5 (MQ=255) aaaCCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCGTCAAGTTGCTGAccttgtgg < 4:76496/149‑6 (MQ=255) aaCCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACctcctc > 4:326673/1‑147 (MQ=255) aCCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAg > 7:85158/1‑149 (MQ=255) aCCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAg < 5:30007/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAgg < 1:119673/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAggg < 5:330866/149‑1 (MQ=255) tCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGaaaa < 4:291003/149‑1 (MQ=255) gCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGaaaa < 2:278744/147‑1 (MQ=255) gCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGaaaa < 2:2204/147‑1 (MQ=255) gCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGaaaa < 6:185533/147‑1 (MQ=255) gCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAg < 3:326673/148‑1 (MQ=255) gCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGGCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGaaaa < 6:180865/147‑1 (MQ=255) ccGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGcc > 5:197114/1‑149 (MQ=255) cGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCACCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGccc < 4:62118/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCgg > 2:40687/1‑148 (MQ=255) tCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCtt > 5:50382/1‑148 (MQ=255) aCCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTtgat < 2:232707/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTtg < 3:31554/147‑1 (MQ=255) cAGCTCCTCGATGCACCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAg > 8:203514/1‑117 (MQ=255) cAGCTCCTCGATGCACCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAg < 7:203514/117‑1 (MQ=255) gCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAg < 8:85158/149‑1 (MQ=255) tcctcGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGc > 3:275386/1‑149 (MQ=255) ctcGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTtgat < 4:173844/141‑1 (MQ=255) ctcGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTtgat > 3:173844/1‑141 (MQ=255) ctcGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGc > 6:188179/1‑147 (MQ=255) gATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGt > 3:162768/1‑149 (MQ=255) aTGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGtt < 4:284076/149‑1 (MQ=255) ttcagttcaTCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTc < 2:216831/149‑1 (MQ=255) gttcaTCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGTACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTgc > 2:79204/1‑149 (MQ=255) caTCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGcc > 7:247856/1‑149 (MQ=255) caTCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGcc > 2:333253/1‑149 (MQ=255) aTCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCt > 4:282485/1‑149 (MQ=255) tCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGTTGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTg < 1:35960/149‑1 (MQ=255) tCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTg < 1:40687/149‑1 (MQ=255) cGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAAGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTgg > 5:218145/1‑149 (MQ=255) aTGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTa < 5:303238/149‑1 (MQ=255) tgtgGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTa > 6:182401/1‑148 (MQ=255) gtgCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAg > 8:174340/1‑115 (MQ=255) gtgCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAg < 7:174340/115‑1 (MQ=255) gtgCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGc < 5:311713/149‑1 (MQ=255) ggCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCg < 4:32659/148‑1 (MQ=255) cATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCgg < 5:188179/148‑1 (MQ=255) cTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGc > 6:52988/1‑149 (MQ=255) ttCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCt > 6:182997/1‑149 (MQ=255) acaTCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAAGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGc < 6:218145/148‑1 (MQ=255) caTCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGcc < 5:225868/98‑1 (MQ=255) caTCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGcc > 6:225868/1‑98 (MQ=255) caTCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGa < 4:275386/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTAc < 6:167080/124‑1 (MQ=255) aTCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTAc > 5:167080/1‑124 (MQ=255) aTCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAg > 4:177704/1‑149 (MQ=255) gCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGttt > 2:111304/1‑149 (MQ=255) aCGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGTTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGa < 3:282485/149‑1 (MQ=255) cGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAg < 8:247856/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTg > 8:80859/1‑131 (MQ=255) gTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTg < 7:80859/131‑1 (MQ=255) ttGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAg > 7:208058/1‑147 (MQ=255) tCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGAt < 6:311244/149‑1 (MQ=255) cTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAg > 7:108199/1‑138 (MQ=255) cTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAg < 8:108199/138‑1 (MQ=255) gCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGAt > 2:228688/1‑149 (MQ=255) ccACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGa < 6:50382/147‑1 (MQ=255) ccACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGAtt > 5:84309/1‑149 (MQ=255) ccACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGAtt < 8:208058/149‑1 (MQ=255) aggaGGTCGGCAAGTTGCTGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGa < 6:294671/129‑1 (MQ=255) aggaGGTCGGCAAGTTGCTGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGa > 5:294671/4‑132 (MQ=255) aaGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCgta < 1:79204/149‑1 (MQ=255) cAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTCTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAAc > 7:156151/1‑149 (MQ=255) aGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAAc < 5:52988/148‑1 (MQ=255) aGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACg > 4:121549/1‑149 (MQ=255) | TCACCCTGACAGTGCGAAACCAGCTCGCCGAGGGTGTCGCGCAGGCTCACCAGCTCCTCGATGCGCCGGTTCAGTTCATCGATGTGGTGCATGGCCAGCGCCTTCACATCGGCGCTGGCACGTTGGCGGTCCTGCCACAAGGTCAGCAACTTGCCGACCTCCTCGAGGGAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACG > NC_002947/683507‑683799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |