Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,425,650 | T→C | 8.3% | intergenic (+52/‑453) | PP_1249 → / → PP_1250 | DUF4223 domain‑containing protein/group II intron‑encoding maturase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,425,650 | 0 | T | C | 8.3% | 166.2 / 4.8 | 60 | intergenic (+52/‑453) | PP_1249/PP_1250 | DUF4223 domain‑containing protein/group II intron‑encoding maturase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/30); new base C (3/2); total (28/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
CACCTACGACTACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGG > NC_002947/1425508‑1425798 | cACCTACGACTACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGc < 5:33157/148‑1 (MQ=255) aCCTACGACTTCCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGGTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGca‑c < 5:109585/149‑1 (MQ=255) cTACGACTACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCAGGCA‑CAt > 3:218259/1‑149 (MQ=255) cTACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCgg < 2:246733/149‑1 (MQ=255) cTACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCgg < 2:251232/149‑1 (MQ=255) tACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCggg > 8:63161/1‑149 (MQ=255) tACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCggg > 8:97161/1‑149 (MQ=255) ccACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGttttt < 6:76709/148‑1 (MQ=255) cACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCTATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTt‑gt < 1:305663/149‑1 (MQ=255) cACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTt‑gt > 3:53442/1‑149 (MQ=255) aCCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTt‑gtg > 7:301072/1‑149 (MQ=255) ccTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTt‑gtgtg > 1:40675/1‑149 (MQ=255) ccTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTt‑gtgtg > 2:251076/1‑149 (MQ=255) ccTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGT‑ATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTgc > 2:259527/1‑149 (MQ=255) cTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGCCATGTG‑CATGACCgggggccgtgga > 8:118324/1‑138 (MQ=255) ttCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGAACCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTgcg > 5:308302/1‑149 (MQ=255) gTTTCCATCTCCAACATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCACCATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCa < 1:176000/149‑1 (MQ=255) tttCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAgg > 3:324891/1‑149 (MQ=255) ttCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAgg < 8:301072/148‑1 (MQ=255) cATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATg > 5:15689/1‑149 (MQ=255) aaTCTCCAAGATCATCGGTGTCTGCGGCCCTATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGAGCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATg < 7:287824/148‑1 (MQ=255) aTCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATgg > 2:155944/1‑149 (MQ=255) tcCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGgcgc > 5:60352/1‑149 (MQ=255) tcCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGgcgc > 2:194492/1‑149 (MQ=255) cAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGt > 3:9861/1‑149 (MQ=255) cAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGt > 8:9028/1‑149 (MQ=255) ggTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAt < 4:9861/148‑1 (MQ=255) ggTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTCTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAt < 1:194492/148‑1 (MQ=255) gTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATgc < 7:9028/149‑1 (MQ=255) tGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGCCATGTG‑CATGACCgggggcctt > 4:64296/1‑106 (MQ=38) tGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGCCATGTG‑CATGACCgggggcctt < 3:64296/110‑5 (MQ=38) tcgatAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGtt < 2:151599/149‑1 (MQ=255) cgatAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtg > 8:72426/1‑149 (MQ=255) gatAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtgt > 5:194519/1‑149 (MQ=255) aaaCTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTgtggt > 3:323574/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTgtggtg < 5:245566/149‑1 (MQ=255) aaCTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTgtggt < 4:313735/148‑1 (MQ=255) aaCTGCCTCAGCAGCAGT‑ATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTTAATGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTgtggtg < 1:259527/149‑1 (MQ=255) gcagcagcagTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGt < 1:126069/148‑1 (MQ=255) agcagcagTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATgcgc < 4:313888/121‑1 (MQ=255) gcagcagTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTggg < 3:91804/149‑1 (MQ=255) cagcagTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt < 7:97161/149‑1 (MQ=255) aTCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGACCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGa < 6:308302/149‑1 (MQ=255) cGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGaaa < 2:310891/149‑1 (MQ=255) aCCCTGATCGCGACGCTTGCGGAGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTcc < 7:134854/149‑1 (MQ=255) ccTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GAGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGTAGGTGAAAGTCctc > 5:166413/1‑149 (MQ=255) tGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAg > 2:290470/1‑121 (MQ=255) tGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAg < 1:290470/121‑1 (MQ=255) gCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCgg > 8:288805/1‑148 (MQ=255) cTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCa < 2:314645/149‑1 (MQ=255) gcggcgTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGTGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGcc < 4:232511/104‑1 (MQ=255) gcggcgTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGcc > 3:232511/1‑104 (MQ=255) gcggcgTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAgg > 2:83646/1‑149 (MQ=255) cggcgTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAgg < 1:155944/148‑1 (MQ=255) gcgTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAgggg > 5:44300/1‑148 (MQ=255) tCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAgtgt < 7:72426/148‑1 (MQ=255) cAAGGCCACCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCATGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCATCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTa < 4:53442/148‑1 (MQ=255) ccccGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAg < 4:324891/149‑1 (MQ=255) ccccGGCCATGTG‑CATGACCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAg < 6:138662/149‑1 (MQ=255) ccccGGCCATGTG‑CATGACCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAg > 5:138662/1‑149 (MQ=255) tCATGGA‑CTTGTCCGGGTGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGGATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGTTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTGCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAgg < 2:40675/149‑1 (MQ=11) tCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAgg < 7:63161/149‑1 (MQ=255) | CACCTACGACTACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCA‑CATGGCCGGGGGTTTTT‑GTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGG > NC_002947/1425508‑1425798 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |