Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,485,310 | G→C | 7.5% | A67P (GCC→CCC) | yhdY → | amino acid ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,485,310 | 0 | G | C | 7.5% | 194.8 / 3.4 | 64 | A67P (GCC→CCC) | yhdY | amino acid ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/25); new base C (3/2); total (35/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGGCGCCGCGCCGCTGTTCATC > NC_002947/1485164‑1485456 | gCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGcc > 2:276688/1‑149 (MQ=255) tGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGAt < 7:9412/149‑1 (MQ=255) cTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGAtt < 2:270460/148‑1 (MQ=255) tCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTg > 5:25344/1‑148 (MQ=255) cATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCATCTGGCTTAACACGCTGTTGACACTGTTCGACATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCATCTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCAcc < 3:303004/149‑1 (MQ=255) aTGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCAcc > 4:235395/1‑148 (MQ=255) tGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCaa < 8:143666/149‑1 (MQ=255) gCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGgcgc > 5:71321/1‑149 (MQ=255) aaTCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCctg > 7:12490/1‑149 (MQ=255) tGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTgg > 3:182829/1‑149 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCTCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCTCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCTACGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTgg < 4:46856/147‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGgt > 7:85173/1‑149 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGgt > 4:5167/1‑149 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGgt < 4:182829/149‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCCCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGgt > 1:155730/1‑149 (MQ=255) ttCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCCCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGgt > 1:160807/1‑149 (MQ=255) ctcCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGgtgt > 3:71449/1‑149 (MQ=255) cTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTGGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTgc < 3:249405/149‑1 (MQ=255) gCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTgcag < 8:305713/148‑1 (MQ=255) ttAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGcagcag > 6:322792/1‑149 (MQ=255) ttAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGCGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGcagcag > 8:118403/1‑149 (MQ=255) acacGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAgcg < 3:235395/148‑1 (MQ=255) cacGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCt > 4:4305/1‑149 (MQ=255) acGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCtt > 5:336256/1‑149 (MQ=255) cggtGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCttt < 5:187696/146‑1 (MQ=255) cGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGGGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTCGGCGTTGATCGCTTTCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCttt < 1:276688/149‑1 (MQ=255) tGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTg < 7:118403/147‑1 (MQ=255) ttGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCa < 3:5167/149‑1 (MQ=255) aCCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTg > 3:219912/1‑142 (MQ=255) aCCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTg < 4:219912/142‑1 (MQ=255) aCCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGtt > 3:11727/1‑149 (MQ=255) cccTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGtt > 2:237493/1‑148 (MQ=255) cTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGTCAGTTCAt < 3:84072/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCAt > 6:148521/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCAt < 7:118665/149‑1 (MQ=255) tGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCCCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATg > 7:22391/1‑149 (MQ=255) ttCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCCCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGt < 2:155730/148‑1 (MQ=255) ttCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCCCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGt < 2:160807/148‑1 (MQ=255) cGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTAc < 6:336256/148‑1 (MQ=255) gCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACg < 8:85173/148‑1 (MQ=255) ccATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGt > 1:322059/1‑149 (MQ=255) cgtGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGttatt < 4:71449/144‑1 (MQ=255) ccTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTgg < 6:281970/126‑1 (MQ=255) ccTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTgg > 5:281970/1‑126 (MQ=255) ccTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTAc < 5:262139/148‑1 (MQ=255) ccTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTAc < 4:11727/148‑1 (MQ=255) tGGTGTGGCTGATCGAGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCAAGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTCTTCGTGCAGCAGCGCTTTCGCCAGTTCATGTACGGTTATAAcca > 2:296438/1‑147 (MQ=255) gCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAAc > 3:155448/1‑149 (MQ=255) gCTCATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCACCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAAc > 1:34960/1‑149 (MQ=255) gTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCTCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTg < 8:22391/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTg > 6:224178/1‑149 (MQ=255) gTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTg > 3:97693/1‑149 (MQ=255) gccgTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCgtg > 1:185278/1‑149 (MQ=255) cgTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGtgtg < 4:97693/149‑1 (MQ=255) gTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGtgtg > 4:56788/1‑148 (MQ=255) tGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCt > 8:308592/1‑148 (MQ=255) cAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGa < 3:4305/148‑1 (MQ=255) tGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCgt > 8:117862/1‑149 (MQ=255) gTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGc > 2:197319/1‑149 (MQ=255) aTCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTg < 6:71321/148‑1 (MQ=255) ccAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGAGTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTc < 8:26966/149‑1 (MQ=255) aaCTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCTCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCgg > 5:242429/1‑149 (MQ=255) ggTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGgcgccg > 5:336658/1‑149 (MQ=255) gcacgccgcgcgCCGATGGCAGCAAGGCAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGGGCAGCCGCGCGTTGGCCAGTTCATGTAGGGGTATTCCCCGAGTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGGTCGgcgc < 5:87099/136‑1 (MQ=255) gCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGGACGGTTATTACCCGACTGCACTCCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGAGAGGCTTGCCGTGCTCGgcgc > 6:87099/1‑142 (MQ=255) gcgcCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGGCGCCGCGCCGCTGTtcat > 1:142239/1‑148 (MQ=255) gcCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGGCGCCGCGCCGCTGTtcatc > 1:57288/1‑147 (MQ=255) | GCGTGCTCGCATGGATGCGTGCCAATCTGTTCTCCAGCTGGCTTAACACGCTGTTGACCCTGTTCGCCATCTACCTGGTGTGGCTGATCGTGCCGCCGTTACTGCAGTGGGCGTTGATCGATGCCAACTGGGTTGGCACCACGCGCGCCGATTGCACCAAGGAAGGCGCCTGCTGGGTGTTCGTGCAGCAGCGCTTTGGCCAGTTCATGTACGGTTATTACCCGACTGAACTGCGCTGGCGTGTGGACCTGACCGTGTGGCTTGCCGTGCTCGGCGCCGCGCCGCTGTTCATC > NC_002947/1485164‑1485456 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |