| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,039,004 | A→G | 9.7% | L159S (TTG→TCG) | rffE ← | UDP‑N‑acetylglucosamine‑2‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,039,004 | 0 | A | G | 9.7% | 196.9 / 10.1 | 72 | L159S (TTG→TCG) | rffE | UDP‑N‑acetylglucosamine‑2‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/35); new base G (4/3); total (34/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.35e-01 | |||||||||||
GCCGGCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTGG > NC_002947/2038858‑2039150 | gCCGGCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAAc < 4:312733/149‑1 (MQ=255) cGGCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAg > 4:58175/1‑149 (MQ=255) ccgcTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGAGTTACCGGAGGTGAAGATGTGCGCCGCATCGGTGCCTTCCCCCAACAGGt > 8:122531/2‑149 (MQ=255) tCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAg < 2:338761/143‑1 (MQ=255) tCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAg > 1:338761/1‑143 (MQ=255) gtGCCAGTTATCTTAAGTTGCTGGCGAAACGGGACTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCATCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTcgcgc < 7:183172/148‑1 (MQ=255) cTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTcgcgc < 8:296128/149‑1 (MQ=255) cTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTcgcgc > 7:296128/1‑149 (MQ=255) tGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTcgcgc > 6:138504/1‑148 (MQ=255) ccAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAg < 1:139368/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCGACAACCTGTTGCGCGaag < 6:92051/149‑3 (MQ=255) aGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGt < 2:35232/149‑1 (MQ=255) cTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGt < 4:17895/149‑1 (MQ=255) tGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTg > 3:46361/1‑149 (MQ=255) tGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTg > 6:290738/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTgg > 1:281742/1‑149 (MQ=255) aaGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTg < 5:186584/147‑1 (MQ=255) aaGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTCTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTTGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGt < 7:46032/146‑1 (MQ=255) ggctggcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGgcgc > 1:147974/1‑148 (MQ=255) ctggcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGcgcg > 3:173738/1‑147 (MQ=255) ctggcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGaa < 2:239334/149‑1 (MQ=255) gcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTg < 3:58175/149‑1 (MQ=255) ttCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAg > 7:239691/1‑149 (MQ=255) aGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGc < 4:173738/149‑1 (MQ=255) tttGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAgg > 7:204515/1‑149 (MQ=255) tGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGgcg > 1:310471/1‑149 (MQ=255) ttGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGtt < 7:310946/147‑1 (MQ=255) ttGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTg < 2:281742/148‑1 (MQ=255) gCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCct > 3:100734/1‑149 (MQ=255) cACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCTGTGGGCGCGATGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCcttctt > 2:139217/1‑149 (MQ=255) cACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCcttctt < 2:294781/149‑1 (MQ=255) cACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCcttctt > 2:140170/1‑149 (MQ=255) aCCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCttcttc > 6:228776/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCgg > 5:228678/1‑149 (MQ=255) cAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCggg < 4:46361/147‑1 (MQ=255) gCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAg < 2:310471/149‑1 (MQ=255) aGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGt < 5:138504/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTg < 2:147974/149‑1 (MQ=255) cGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGaa < 5:228776/149‑1 (MQ=255) aTCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCg > 2:283301/1‑132 (MQ=255) aTCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCg < 1:283301/132‑1 (MQ=255) tgtTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCTGCGCGTCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGttgttg < 5:277304/149‑1 (MQ=255) tgtTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGttgttg < 5:290738/149‑1 (MQ=255) tgtTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGttgttg < 2:319545/149‑1 (MQ=255) tgtTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCCGGCCAGGGTGAATACAGGttgttg < 7:48249/149‑1 (MQ=255) ttACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGt > 1:300054/1‑149 (MQ=255) ccGGT‑GTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTgcg > 2:212811/1‑148 (MQ=255) cGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTgcg > 3:246391/1‑148 (MQ=255) gtgAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGcc > 6:333993/1‑149 (MQ=255) tgAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGAGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTAGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCg > 8:131919/1‑149 (MQ=255) gAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCgg > 7:268891/1‑149 (MQ=255) aaGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGc < 2:114638/149‑1 (MQ=255) aaGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTGCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGc > 5:41669/1‑149 (MQ=255) gttgtgCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGGGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCtt < 7:122531/147‑1 (MQ=255) gcgcCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACa > 6:89100/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCATCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACa > 6:286160/1‑149 (MQ=255) ccGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATgg > 6:83421/1‑149 (MQ=255) ccGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATgg < 5:89100/149‑1 (MQ=255) ccGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATgg < 8:204515/149‑1 (MQ=255) ccGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATgg < 1:212811/149‑1 (MQ=255) ccGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCATCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATgg < 5:286160/149‑1 (MQ=255) ggTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATgg < 8:239691/149‑1 (MQ=255) ggTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCGTCTACATGGGCAATg < 4:100734/148‑1 (MQ=255) ccacctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAAGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATggg > 8:17073/6‑148 (MQ=255) cacctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGa > 7:66348/5‑149 (MQ=255) acctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCTGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGtt < 2:220519/77‑1 (MQ=25) acctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAg < 1:303455/104‑1 (MQ=255) acctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAg > 2:303455/4‑107 (MQ=255) ctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGAttt > 1:63821/2‑149 (MQ=255) gcgcAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCt < 5:333993/149‑1 (MQ=255) gcAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTgg < 5:83421/149‑1 (MQ=255) cAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTgg > 4:125795/1‑148 (MQ=255) | GCCGGCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTGG > NC_002947/2038858‑2039150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |