Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,421,950 | C→G | 7.7% | P80A (CCG→GCG) ‡ | moeA → | molybdenum::molybdopterin ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,421,950 | 0 | C | G | 7.7% | 162.6 / 4.5 | 52 | P80A (CCG→GCG) ‡ | moeA | molybdenum::molybdopterin ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (21/27); new base G (2/2); total (23/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 |
ACCGATCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATGG > NC_002947/2421802‑2422098 | aCCGATCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGc < 8:89155/149‑1 (MQ=255) aCCGATCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGc > 4:39383/1‑149 (MQ=255) ccGATCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGcc > 6:126558/1‑149 (MQ=255) cgcgAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGc < 8:157596/148‑1 (MQ=255) gcgAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCg < 4:166988/149‑1 (MQ=255) gagaCCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGt < 6:290326/149‑1 (MQ=255) gagaCCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGt < 3:39383/149‑1 (MQ=255) taCCGCAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACCGCGCCATGGACGGGTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTca < 8:269481/148‑1 (MQ=255) gaCCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTca < 7:91924/149‑1 (MQ=255) gaCCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTca < 5:243257/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGt > 6:5052/1‑136 (MQ=255) tGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGt < 5:5052/136‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTAtt > 3:110140/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTAtttt > 3:64865/1‑149 (MQ=255) gctgAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCgg < 5:252924/146‑1 (MQ=255) gCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATgc > 2:155077/1‑149 (MQ=255) cGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACCGGCAGCGGCTGGCCCTGCCAGTc > 6:287703/1‑121 (MQ=38) cGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACCGGCAGCGGCTGGCCCTGCCAGTc < 5:287703/121‑1 (MQ=38) ggCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGTGCCCCa < 2:110557/149‑1 (MQ=255) ggCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCa < 4:64865/149‑1 (MQ=255) ccGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGGCGGAACACCCCAATGGACGGTTATGCCTTGCGCATGGCTGCCTGGCAGGCCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTACGCCGGCCATGCGCCCCAg > 1:79733/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCt < 1:155077/149‑1 (MQ=255) tGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGTCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCaa > 3:72314/1‑149 (MQ=255) tGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCaa > 7:46488/1‑149 (MQ=255) gCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGTCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAAc < 4:72314/148‑1 (MQ=255) ctcgctcgACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGa > 2:286994/1‑149 (MQ=255) cgctcgACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCACCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATc < 2:79733/149‑1 (MQ=255) ctcgACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGc < 8:147867/79‑1 (MQ=255) ctcgACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGc > 7:147867/1‑79 (MQ=255) ctccACCTCCGGCCCG‑GGCCCCACCGGGCCTCGGCCGGTGAGGCCTTGCGCCTGGCGGCCTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGCGCAGCCAGCGGATTTTCCCCGGCCATGCGCCCGAGCCGCGGCATCCGGGTCCCTGCGCCCTGATCtt < 4:266797/149‑1 (MQ=255) tcgACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACCGGCAGCGGCTGGCCCTGCCAGTca > 8:116815/1‑84 (MQ=21) tcgACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACCGGCAGCGGCTGGCCCTGCCAGTca < 7:116815/84‑1 (MQ=21) gACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTc < 7:17184/147‑1 (MQ=255) gACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCAc < 5:26370/149‑1 (MQ=255) cccT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGcc > 3:248065/1‑149 (MQ=255) ccGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGcc > 4:36050/1‑149 (MQ=255) cGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCg > 2:232683/1‑149 (MQ=255) cGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCACTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCg < 5:333535/149‑1 (MQ=255) gcCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGc < 4:248065/149‑1 (MQ=255) ggTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGt < 2:225516/149‑1 (MQ=255) ggTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGt < 1:286994/149‑1 (MQ=255) gTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTc < 1:78478/149‑1 (MQ=255) gTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTc < 5:126558/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCa < 4:110140/147‑1 (MQ=255) gcCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGa > 5:110252/1‑148 (MQ=255) gCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAacac > 7:3558/1‑149 (MQ=255) tGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACAcc > 3:212625/1‑148 (MQ=255) tGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACAcc > 2:77328/1‑148 (MQ=255) aCTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCg > 4:158398/1‑147 (MQ=255) tGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTTTTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAg > 3:208538/1‑148 (MQ=255) tGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAg > 6:246213/1‑148 (MQ=255) gCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTAc < 8:131603/149‑1 (MQ=255) aGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTc > 4:294720/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGAt > 7:208063/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATg < 8:208063/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATgg > 1:237409/1‑149 (MQ=255) | ACCGATCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCT‑GGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATGG > NC_002947/2421802‑2422098 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |