| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,656,748 | G→C | 6.0% | S288R (AGC→AGG) | pabB ← | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,656,748 | 0 | G | C | 6.0% | 220.0 / 4.2 | 67 | S288R (AGC→AGG) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/28); new base C (2/2); total (37/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.86e-01 | |||||||||||
CGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGC > NC_002947/2656600‑2656890 | cGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCggg < 7:221295/149‑1 (MQ=255)cGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTCCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCggg > 2:90999/1‑149 (MQ=255) tgACCAGATGGTGCTCGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGGCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCagcagc > 5:211645/1‑149 (MQ=255) cAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCt > 7:42821/1‑149 (MQ=255) gATGGTGCTCGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGGCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTgg < 6:211645/149‑1 (MQ=255) gATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTgg < 2:70186/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTggg > 3:15371/1‑149 (MQ=255) cGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGc < 8:122428/149‑1 (MQ=255) gggTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTCCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGt < 1:90999/148‑1 (MQ=255) gggAAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGGGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTc < 8:242883/149‑1 (MQ=255) tcCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCgg > 8:91460/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCgg < 8:42821/147‑1 (MQ=255) aGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGt > 2:17197/1‑148 (MQ=255) ggCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCa > 4:165515/1‑149 (MQ=255) tGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTg > 4:18799/1‑149 (MQ=255) tGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTg > 8:25816/1‑149 (MQ=255) tGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTg > 8:304136/1‑149 (MQ=255) tGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTg > 2:139082/1‑149 (MQ=255) aaCAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTg < 2:176543/147‑1 (MQ=255) aaCAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTg < 4:15371/147‑1 (MQ=255) aGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGcgcg > 6:119835/1‑149 (MQ=255) gTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGt > 2:293444/1‑149 (MQ=255) gTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCgg < 7:304136/149‑1 (MQ=255) ttCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGcc > 1:60773/1‑149 (MQ=255) aCTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCtt > 8:255986/1‑149 (MQ=255) aGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGa < 7:25816/147‑1 (MQ=255) aGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGa < 7:255986/147‑1 (MQ=255) aGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGa < 1:17197/147‑1 (MQ=255) aGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATc < 7:91460/149‑1 (MQ=255) gCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCAc < 2:153424/122‑1 (MQ=255) gCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCAc > 1:153424/1‑122 (MQ=255) ccAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCgg < 1:293444/149‑1 (MQ=255) ccAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCgg > 2:118130/1‑149 (MQ=255) ccAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCgg > 3:74970/1‑149 (MQ=255) cAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGc > 2:291131/1‑149 (MQ=255) cAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGc < 1:166714/149‑1 (MQ=255) tctcGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCgg > 7:64384/1‑149 (MQ=255) gCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCgg < 8:64384/145‑1 (MQ=255) gCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGtt < 5:55794/148‑1 (MQ=255) cccAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCgg > 5:180013/1‑135 (MQ=255) cccAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCgg < 6:180013/135‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccc > 4:282416/1‑149 (MQ=255) ggTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccctgg < 5:119835/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccctgg < 2:262083/145‑1 (MQ=255) gTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccctgg > 1:262083/1‑145 (MQ=255) cgcAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGAcgcg > 5:195103/1‑149 (MQ=255) gcagcaGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCgg < 6:195103/149‑1 (MQ=255) gTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGttt < 2:23951/119‑1 (MQ=255) gTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAgc > 4:240116/1‑149 (MQ=255) gTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAgc > 3:155781/1‑149 (MQ=255) gacgaTCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCt > 7:253451/1‑149 (MQ=255) acgaTCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGGCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTc < 4:74970/149‑1 (MQ=255) tcatcaGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGc > 5:174457/1‑149 (MQ=255) atcaGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCg > 3:327133/1‑148 (MQ=255) tcaGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGa > 4:130244/1‑148 (MQ=255) caGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGaa > 2:80365/1‑148 (MQ=255) ttttCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCt < 3:18799/149‑1 (MQ=255) tCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTcag > 3:318271/1‑149 (MQ=255) aGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAgg < 2:60773/149‑1 (MQ=255) ggTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGGCAATGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTTATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGAAGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGCTa > 8:269614/1‑149 (MQ=255) gTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccctgg > 6:301227/1‑106 (MQ=255) ccTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTg > 2:187348/1‑149 (MQ=255) cTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTcag > 3:27691/1‑138 (MQ=255) cTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTcag < 4:27691/138‑1 (MQ=255) cTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGc < 1:139082/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccctggc > 4:58913/1‑104 (MQ=255) cTTCGGCCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccctggc > 4:54475/1‑104 (MQ=255) cTTCGGCCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccctggc < 3:58913/104‑1 (MQ=255) cTTCGGCCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctggccctggc < 3:54475/104‑1 (MQ=255) gggCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGaa < 7:196797/113‑1 (MQ=255) gggCTGTGCAGAAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGaa > 8:196797/1‑113 (MQ=255) ggCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctg < 1:192354/91‑1 (MQ=255) ggCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCAcctg > 2:192354/1‑91 (MQ=255) | CGGTGATGCTGCTGACCAGATGGTGCACGTTGGGGTAACTCTCCAGGCTGAACAGTTCCGGTACCTTCACTGAGCCAATCTCGCACGTGCGCCCCAGGTCGTTGCGCAGCAGGTCGACGATCATCAGGTTTTCCGAGCGGTCCTTCGGGCTGTGCAGCAGCTCCTGGGCATTACGCTGGTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGC > NC_002947/2656600‑2656890 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |