Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,159,062 | G→C | 8.8% | A361P (GCA→CCA) | opuA → | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,159,062 | 0 | G | C | 8.8% | 205.3 / 8.7 | 68 | A361P (GCA→CCA) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/34); new base C (3/3); total (31/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 |
TCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAG > NC_002947/3158914‑3159202 | tCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTgg > 4:160408/1‑149 (MQ=255) gCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTgg > 2:186675/1‑147 (MQ=255) gCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTgg > 1:200517/1‑147 (MQ=255) ccAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAg > 7:98299/1‑149 (MQ=255) cAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGGGTGGCGCGAGGGGGCGGGGGGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGt < 1:218925/149‑1 (MQ=255) cAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGt > 4:144156/1‑149 (MQ=255) gtgtTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGCCAGtgctgtg < 5:335299/149‑3 (MQ=255) ggCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCaa > 6:3376/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAAt < 4:303747/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGCCAGtgctgtg < 5:37442/142‑3 (MQ=255) gCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGCCAGtgctgtg > 6:37442/1‑140 (MQ=255) cccGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGtgctg < 1:194904/139‑1 (MQ=255) cccGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGtgctg > 2:194904/1‑139 (MQ=255) cccGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATc > 1:49195/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCg > 8:275185/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGCCAGtgctgtg < 5:65256/140‑3 (MQ=255) ccGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGCCAGtgctgtg > 6:65256/1‑138 (MQ=255) gcgcTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTggg < 5:231897/149‑1 (MQ=255) gctcgctGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGtt > 7:161821/1‑149 (MQ=255) gctGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGCCAgtggtgtg > 1:194435/1‑126 (MQ=255) ctGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGAGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCt > 1:249540/1‑149 (MQ=255) ccgccgGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTgg < 8:98299/149‑1 (MQ=255) ccgccgGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTgg < 2:31833/149‑1 (MQ=255) ccgccgGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGGGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGGAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTgg < 4:66889/149‑1 (MQ=255) cgccgGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCAAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTggg > 4:133337/1‑149 (MQ=255) gACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGc < 2:329039/149‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTg < 1:186675/149‑1 (MQ=255) ggttggttGTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTgg < 7:67044/135‑1 (MQ=255) ggttggttCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTgg > 8:67044/1‑135 (MQ=255) gttggttCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCtt < 4:178846/121‑1 (MQ=255) gttggttCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCtt > 3:178846/1‑121 (MQ=255) gttggttCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGAAGTGCTGCTGGTCAATCGCttcg > 4:217917/1‑121 (MQ=255) gttCTGGCTGGCGCGGCGGGGGGAGGGGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGcacggccac < 2:200517/148‑1 (MQ=255) ttCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTCGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGcacggccacgg > 2:314982/1‑149 (MQ=255) ggctggcGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGt > 4:15015/1‑149 (MQ=255) gctggcGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGt < 8:161821/148‑1 (MQ=255) ctggcGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGa > 7:190287/1‑149 (MQ=255) ggcGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGgccgtggccgtgcag < 3:270839/149‑4 (MQ=255) gcgcTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACt > 8:98886/1‑148 (MQ=255) cgcTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCa < 2:49195/149‑1 (MQ=255) gAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGcacggccacgg > 2:129127/1‑128 (MQ=255) gAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGcacggccacgg < 1:129127/128‑1 (MQ=255) aGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCt < 2:249540/149‑1 (MQ=255) gTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCtt > 1:197300/1‑148 (MQ=255) ggcggcCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTAc > 1:276602/1‑149 (MQ=255) ggcCCTGGGCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCt > 8:109904/1‑149 (MQ=255) ggcCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCt > 3:11470/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTgg < 1:314982/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTgg < 4:20884/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCATGCTGGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTgg < 7:275185/149‑1 (MQ=255) tGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGgcg > 5:345160/1‑149 (MQ=255) gCCATGGTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCg < 6:240970/133‑1 (MQ=255) gCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCgct < 8:190287/149‑1 (MQ=255) gCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCgct < 3:15015/149‑1 (MQ=255) gCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGATGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCg > 5:240970/1‑133 (MQ=255) cATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTgg < 2:9206/91‑1 (MQ=255) cATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTgg > 1:9206/1‑91 (MQ=255) cttgctGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTAc < 2:276602/148‑1 (MQ=255) ctGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGt < 5:3376/148‑1 (MQ=255) tggcgcgtggcgcgAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGa < 7:98886/149‑1 (MQ=255) ggcgcgtggcgcgAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCgctg < 3:188452/138‑1 (MQ=255) ggcgcgtggcgcgAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCgctg > 4:188452/1‑138 (MQ=255) gcgtggcgcgAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCa < 3:144156/149‑1 (MQ=255) ggcgcgAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCa > 5:279203/1‑149 (MQ=255) caaGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGa < 3:133337/147‑1 (MQ=255) gCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATg > 5:17123/1‑149 (MQ=255) cGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATgg < 2:326221/149‑1 (MQ=255) gggTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCgctgc > 2:111733/1‑118 (MQ=255) gggTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCgctgc < 1:111733/118‑1 (MQ=255) tCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGAc < 4:11470/149‑1 (MQ=255) caGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCagag < 2:197300/149‑1 (MQ=255) | TCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAG > NC_002947/3158914‑3159202 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |