| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,346,117 | G→C | 5.6% | A128G (GCC→GGC) | PP_2942 ← | two‑component system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,346,117 | 0 | G | C | 5.6% | 233.4 / 4.4 | 71 | A128G (GCC→GGC) | PP_2942 | two‑component system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/34); new base C (2/2); total (35/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.45e-01 | |||||||||||
AGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGTGATGC > NC_002947/3345970‑3346260 | aGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGc > 5:312412/1‑149 (MQ=255) cATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGCCGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCt > 2:267577/1‑149 (MQ=255) cATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCt > 4:118081/1‑149 (MQ=255) tGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTACTCCAG‑‑GGCCTgg < 5:78495/149‑1 (MQ=255) cAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGgcg > 7:98931/1‑148 (MQ=255) cGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAg < 3:51850/149‑1 (MQ=255) gTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGt < 8:98931/149‑1 (MQ=255) tCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTc < 2:239489/149‑1 (MQ=255) ctgcAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCAtt < 8:244451/148‑1 (MQ=255) tgcAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCt > 2:203112/1‑133 (MQ=255) tgcAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCt < 1:203112/133‑1 (MQ=255) tgcAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAg > 4:226046/1‑149 (MQ=255) gcAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCAt > 2:324495/1‑145 (MQ=255) gcAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCAt < 1:324495/145‑1 (MQ=255) cAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCTTTAGc < 3:101993/148‑1 (MQ=255) cTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTACAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAAtt > 5:130537/1‑149 (MQ=255) tCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtc > 3:36397/1‑149 (MQ=255) gcgGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCGAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcgtc < 7:262494/149‑1 (MQ=255) gTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcgtcgtc < 3:222542/149‑1 (MQ=255) gggCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTc > 4:275154/1‑149 (MQ=255) gggATGCAACGCGTTTCTCAAAGTCGTTATTTAGCAGTCTCAACTGGGCTTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCTTAAAGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTc < 8:204810/149‑1 (MQ=255) tctcCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGAt < 8:217948/148‑1 (MQ=255) tcCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGt > 5:193947/1‑148 (MQ=255) cAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAAATGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAACGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAAc > 7:306675/1‑149 (MQ=255) gTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGt < 6:193947/149‑1 (MQ=255) tCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTg < 2:243091/149‑1 (MQ=255) gTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTgg < 4:288839/148‑1 (MQ=255) gTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGa > 5:75329/1‑149 (MQ=255) gTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGa > 6:74023/1‑149 (MQ=255) ttATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGTCGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTgg < 1:267577/149‑1 (MQ=255) aTTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCGGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCt > 4:56923/1‑149 (MQ=255) aGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCAt < 3:291587/98‑1 (MQ=255) aGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCAt > 4:291587/1‑98 (MQ=255) tctcAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCAt > 1:249315/1‑149 (MQ=255) ctcAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCAtt < 5:254151/149‑1 (MQ=255) aaCTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGa < 3:275154/148‑1 (MQ=255) gggCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCa > 5:142432/1‑106 (MQ=255) gggCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCa < 6:142432/106‑1 (MQ=255) ggCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGcc < 3:128321/148‑1 (MQ=255) gTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGCCGGCCTtga > 8:56770/1‑149 (MQ=255) gTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTtga < 4:36397/149‑1 (MQ=255) gTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTtga < 3:226046/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGCTCTGACCGTCATTGACGGCCTtgat > 5:330810/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTgg < 6:75329/148‑1 (MQ=255) cagcTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCgg > 7:140906/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGAGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTAATGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCa > 6:291054/1‑147 (MQ=255) ggCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTAACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCg > 1:332700/1‑149 (MQ=255) gcgcTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCa < 6:312412/149‑1 (MQ=255) ctcTCGCGTTCGGAATGCTGGTTCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAACGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTTCGCTTGTTTCGGCATAGCCGGTCAGCaa < 5:291054/147‑1 (MQ=255) gcTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACTGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGt < 6:285230/129‑1 (MQ=255) gcTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGt > 5:285230/1‑129 (MQ=255) tCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGc > 1:193466/1‑144 (MQ=255) tCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGc < 4:146025/144‑1 (MQ=255) tCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGc > 3:146025/1‑144 (MQ=255) gcgTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATcc > 4:172049/1‑149 (MQ=255) gTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCTCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCt < 8:306675/148‑1 (MQ=255) cGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGAc < 6:130537/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGAt > 8:58227/1‑149 (MQ=255) tGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATgg > 3:305993/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCAG‑‑GCCCTGGAGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGt > 4:263149/2‑149 (MQ=255) ttGCGCCAG‑‑GCCCTGGAGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGt > 4:258680/2‑149 (MQ=255) gTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATgg < 8:140906/147‑1 (MQ=255) gTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATgg < 2:193466/147‑1 (MQ=255) gTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGt > 5:45435/1‑149 (MQ=255) gTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGt < 7:58227/149‑1 (MQ=255) cgccAG‑‑GCCCTGGAGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGTGa < 3:263149/146‑1 (MQ=255) cgccAG‑‑GCCCTGGAGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGTGa < 3:258680/146‑1 (MQ=255) tCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGTGAt > 7:220720/1‑148 (MQ=255) ccAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGTGATGc > 8:99177/1‑149 (MQ=255) ccAG‑‑GGCCTGGCACAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGTGa < 2:128393/146‑1 (MQ=255) ccAG‑‑GGCCTGGCACAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGTGa > 1:128393/1‑146 (MQ=255) | AGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGGGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAG‑‑GGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACTGATGTAACGGTGGATCTGACCGTCATTGACGGCCTTGATGATTGCGCTTGGGTCGGCATAGCCGGTCAGCAAGATCCTGACGGTCGATGGGTGATGC > NC_002947/3345970‑3346260 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |