Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,463,619 | G→A | 7.4% | P247S (CCA→TCA) | PP_3078 ← | ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,463,619 | 0 | G | A | 7.4% | 155.8 / 2.1 | 55 | P247S (CCA→TCA) | PP_3078 | ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (23/27); new base A (2/2); total (26/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.59e-01 |
CCACTTCGGTGTCGCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCAAGTCGAATCGCACGCTGTGCAG > NC_002947/3463475‑3463766 | ccACTTCGGTGTCGCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCg < 8:19038/149‑1 (MQ=255) cACTTCGGTGTCGCCGAAGAACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGc < 4:110567/149‑1 (MQ=255) aCTTCGGTGTCGCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCt < 2:104671/149‑1 (MQ=255) gtgtCGCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGAc < 1:22094/149‑1 (MQ=255) gtgtCGCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGAc < 6:275639/149‑1 (MQ=255) gtgtCGCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGAc < 7:143499/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCt > 5:50304/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCt > 6:242990/1‑149 (MQ=255) gAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGt > 2:149890/1‑149 (MQ=255) aaGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCt > 1:130006/1‑134 (MQ=255) aaGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCt < 2:130006/134‑1 (MQ=255) gATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCgg < 4:174402/149‑1 (MQ=255) gATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCgg > 8:124611/1‑149 (MQ=255) gATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCgg > 5:9333/1‑149 (MQ=255) cAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGt < 7:124611/149‑1 (MQ=255) tttGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTg‑g > 6:263969/1‑149 (MQ=255) gAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGCCTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGt > 6:168791/1‑149 (MQ=255) aaTTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑ACCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTcg > 7:198032/1‑149 (MQ=255) aaTTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑ACCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTcg > 7:304075/1‑149 (MQ=255) aTTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTcgc < 6:50304/149‑1 (MQ=255) gCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCgctgct < 1:149890/149‑1 (MQ=255) ggCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCtgctgc < 4:91740/149‑1 (MQ=255) gCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GTCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGctgctg > 6:178865/1‑147 (MQ=255) ccACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAg > 5:183265/1‑149 (MQ=255) ccACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAg > 2:63710/1‑149 (MQ=255) cACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAgg > 8:151292/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCGAATGGAGGCCCAATGCGGTGATGCCCCCGCAGCCGAGTGTCTTGTCGAAGCCCGC‑CGGTTGCAAAAAGTCGCTctgctg > 1:276112/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGAc < 6:294604/100‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCTCGCTGCTGCAGGTCGt < 1:63710/149‑1 (MQ=255) tggtggGCACGTGACCTGCCCGCCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGc > 1:73247/1‑149 (MQ=255) gCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCt < 2:116318/148‑1 (MQ=255) cGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCg < 4:126786/149‑1 (MQ=255) gggCAGGTCACGTGCCCACCAACACGGGTCGCGTTCGAAGGTCATGCTCCGGCACTTGTCC‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCAGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGCCACCgaag > 6:316017/1‑115 (MQ=255) ggTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCAtt < 7:151292/149‑1 (MQ=255) tCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTAc < 5:263969/149‑1 (MQ=255) aCGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTAcc < 2:188730/148‑1 (MQ=255) gTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCgg > 6:118057/1‑148 (MQ=255) gCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAg > 6:137618/1‑149 (MQ=255) ccaTGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTgg < 5:137618/149‑1 (MQ=255) cctGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGAGGCTGCGGCCGTGGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACAGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGGCTTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGc < 6:183265/147‑1 (MQ=255) ccGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAg < 5:242990/148‑1 (MQ=255) gggTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑ACCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTc < 8:304075/149‑1 (MQ=255) gggTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑ACCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTc < 8:198032/149‑1 (MQ=255) gcgTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAgcg > 8:264019/1‑149 (MQ=255) gTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAgcgc > 4:49124/1‑148 (MQ=255) cGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GTCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAg < 5:178865/148‑1 (MQ=255) aTGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCGAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCAGCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGGCCAGCGCCAGGGTGCGGcc < 2:127986/149‑1 (MQ=255) tgctgcGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCg < 2:73247/149‑1 (MQ=255) gctgcGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGt > 3:134895/1‑149 (MQ=255) tGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCtt > 1:175065/1‑148 (MQ=255) tCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCaa < 3:49124/149‑1 (MQ=255) g‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCAAGt < 4:134895/149‑1 (MQ=255) cAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCAAGTCGAATCg > 6:66532/1‑148 (MQ=255) aaTGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCAAGTCGAATCGCa > 1:21186/1‑149 (MQ=255) aaTGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCAAGTCGAATCGCa > 4:79802/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCAAGTCGAATCGCACGCTGTGCAg < 7:264019/148‑1 (MQ=255) gCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCAAGTCGAATCGCACGCTGTGCAg < 4:48786/148‑1 (MQ=255) | CCACTTCGGTGTCGCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCACGTGCCCACCATGCCGGGTCGCGTTCGAAGGTGATGCTGCGGCCGTTGTCG‑ATG‑‑CGCCCAATGCGGT‑ATG‑GCCCGCTGCCGACTGGCTTGTCGAAGCCGGCACCGTTG‑GCAAAGTCGCGCTGCTGCAGGTCGTGCTCGGGCATTACCGGCAGGCTGGCGAGGTCCAGCGCCAGGGTGCGGCCGTGCTCGGGCTTCAAGTCGAATCGCACGCTGTGCAG > NC_002947/3463475‑3463766 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |