| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,553,793 | C→T | 8.0% | R154C (CGC→TGC) | PP_3138 → | VirK domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,553,793 | 0 | C | T | 8.0% | 178.8 / 3.0 | 63 | R154C (CGC→TGC) | PP_3138 | VirK domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/27); new base T (2/3); total (32/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCTGAGGCTGTGTGACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGTTG > NC_002947/3553647‑3553939 | aCCTGAGGCTGTGTGACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGc < 5:111423/149‑1 (MQ=255) ccTGAGGCTGTGTGACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCa < 2:155698/149‑1 (MQ=255) ccTGAGGCTGTGTGACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCa < 8:154724/149‑1 (MQ=255) tgtgACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGt < 1:122231/147‑1 (MQ=255) tgtgACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGt < 1:323688/147‑1 (MQ=255) ccTGTCGAGCCACTGGCCGGGCGGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGGGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCT‑GGCTGCGGCCCAGGGTGaaggc < 8:120400/148‑4 (MQ=255) cTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAAcctg > 1:25855/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCTGCAG‑CCAGGGTGAAAcctgcc > 7:150075/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAAcctgc < 5:260298/147‑1 (MQ=255) aCTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGTTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCAtt > 7:242352/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTg < 1:65358/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTg < 3:85871/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTggtg < 5:149985/149‑1 (MQ=255) gggCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTggtgcgg < 3:267410/149‑1 (MQ=255) tGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGTTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCa < 8:242352/149‑1 (MQ=255) tGTAGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGATCAAGCGCGAACGAGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGAGCTGCGTGTGGCATCCCTTGACTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGGGAAAACTGCCTGTTCATTGGTGCGGTCCa > 8:246565/1‑149 (MQ=255) gCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAgg < 3:322117/107‑1 (MQ=255) gCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAgg > 4:322117/1‑107 (MQ=255) tGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCcaca > 5:141340/1‑147 (MQ=255) gACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACaa‑‑‑a < 2:169387/147‑1 (MQ=255) gACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑Agg > 1:264295/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGTGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑t < 1:133179/149‑1 (MQ=255) ggCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATc < 7:53490/149‑1 (MQ=255) gCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATc > 2:255075/1‑148 (MQ=255) gCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATc > 2:106366/1‑148 (MQ=255) aaTCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCAtt > 7:249311/1‑115 (MQ=255) aaTCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCAtt < 8:249311/115‑1 (MQ=255) aaTCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACa > 4:183795/1‑149 (MQ=255) tCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCCTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGACGCAG‑CAAGGGAGCAACCTGCCTGGTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACacc > 3:215539/1‑147 (MQ=255) gcgcGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGc > 1:323588/1‑149 (MQ=255) aGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCa < 5:68176/149‑1 (MQ=255) ggCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGt > 6:42371/1‑91 (MQ=255) ggCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGt < 5:42371/91‑1 (MQ=255) gAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGtgacctga > 1:174364/1‑149 (MQ=255) aaCCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGtgacctgac < 2:264295/149‑1 (MQ=255) aaCCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGtgacctgac > 8:290521/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACt > 5:44048/1‑149 (MQ=255) aGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGGCTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACtt < 1:255075/149‑1 (MQ=255) aGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTc > 3:190446/1‑149 (MQ=255) aGGCCGACCTGCGTGGGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTc < 3:183795/149‑1 (MQ=255) accGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTggtgcg > 2:31965/2‑75 (MQ=255) ccGACCTGCGTGTGGCATACGTTGCCTTCAGCGTTGGCAGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGGGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCGATCTACCTTTACCTGACCAAGGACTTCGaa < 4:215539/149‑1 (MQ=255) cTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCt > 8:221549/1‑149 (MQ=255) gCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGc > 4:732/1‑149 (MQ=255) gggtgGCATCCCTTGCATTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCgg < 8:249685/147‑1 (MQ=255) gttgCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGc > 1:67869/4‑148 (MQ=255) gtgGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGc > 8:237313/1‑148 (MQ=255) gCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCTGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCAc < 8:150075/148‑1 (MQ=255) cTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCt > 8:52026/1‑149 (MQ=255) gCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCATACACAACCACAACCTCAG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGc < 1:106366/148‑1 (MQ=255) gCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGtt > 1:221928/1‑149 (MQ=255) gCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGt < 6:44048/148‑1 (MQ=255) gtttCACCCT‑GGCTGCGGCCCAGGGTGAAGCCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGaa < 3:139245/123‑1 (MQ=255) gtttCACCCT‑GGCTGCGGCCCAGGGTGAAGCCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGaa > 4:139245/3‑125 (MQ=255) cTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGc > 8:190330/1‑149 (MQ=255) ttCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCt > 3:109813/1‑149 (MQ=255) ttCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCt > 3:89225/1‑149 (MQ=255) ttCACACTGGGAAGCAG‑CCAGGGTCAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGCCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACctctct > 7:266625/1‑89 (MQ=255) aCCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGa < 2:174364/149‑1 (MQ=255) cccTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCg > 2:279219/1‑147 (MQ=255) ccTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAg > 4:213719/1‑149 (MQ=255) ggCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGtt < 7:290521/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGt < 3:732/148‑1 (MQ=255) ccGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGTTg > 5:339006/1‑148 (MQ=255) ccGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGTTg > 1:212938/1‑148 (MQ=255) | ACCTGAGGCTGTGTGACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCA‑GGGCATCCACAA‑‑‑AGG‑TATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGTTG > NC_002947/3553647‑3553939 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |