Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,596,231 | C→T | 7.9% | A259T (GCC→ACC) | nemA ← | FMN‑linked N‑ethylmaleimide reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,596,231 | 0 | C | T | 7.9% | 222.5 / 5.9 | 76 | A259T (GCC→ACC) | nemA | FMN‑linked N‑ethylmaleimide reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/38); new base T (3/3); total (35/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.70e-01 |
TCTTCGCCTTTCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCACCGCCTCCAGCACAATGCG > NC_002947/3596083‑3596378 | tCTTCGCCTTTCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGc < 2:262371/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCTTTCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGc > 1:23849/1‑148 (MQ=255) cGCCTTTCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCa < 5:264768/147‑1 (MQ=255) gCCTTTCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGtt < 8:279969/149‑1 (MQ=255) cTTTCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTcg > 3:137048/1‑149 (MQ=255) cTTTCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTcg > 3:132095/1‑149 (MQ=255) tttCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTcgc > 6:12320/1‑149 (MQ=255) tctcGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTcgc < 3:269859/147‑1 (MQ=255) tctcGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTcgc < 1:204705/147‑1 (MQ=255) ctcGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGa > 3:77961/1‑149 (MQ=255) tcGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGAt > 1:53416/1‑149 (MQ=255) ggcggTATAGGCACCTGCAGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCATTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGTAt < 3:279333/147‑1 (MQ=255) gcggTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAg < 2:234853/149‑1 (MQ=255) gcggTATAGGCACCGGCCGCGATGATCAACCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAg < 2:247244/149‑1 (MQ=255) ggTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGt < 1:24792/149‑1 (MQ=255) tataGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTAc < 4:94120/149‑1 (MQ=255) aGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAgg > 7:105904/1‑149 (MQ=255) gCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGcc > 8:39180/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCcggcg < 3:20087/149‑1 (MQ=255) cGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCcggcg > 4:35479/1‑149 (MQ=255) cgcgATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGcct > 6:107869/1‑149 (MQ=255) cgcgATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGcct > 5:68504/1‑149 (MQ=255) cgcgATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGcct > 3:158172/1‑149 (MQ=255) gcgATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCCGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGcctc < 4:132095/149‑1 (MQ=255) gcgATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGcctc < 4:137048/149‑1 (MQ=255) cgATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGcctcc > 3:242314/1‑149 (MQ=255) atgatCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTg < 5:332432/149‑1 (MQ=255) cACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCtt > 1:217497/1‑149 (MQ=255) ccccGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCg < 3:117642/149‑1 (MQ=255) cccGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGCGGGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGt > 1:207837/1‑123 (MQ=255) cccGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGt < 2:207837/122‑1 (MQ=255) cccGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGc > 4:305689/1‑149 (MQ=255) cccGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGc < 4:77961/149‑1 (MQ=255) cccGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGc > 2:241536/1‑149 (MQ=255) ccGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATc < 1:2455/117‑1 (MQ=255) ccGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCCTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATc > 2:2455/1‑117 (MQ=255) cGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCa < 7:236002/149‑1 (MQ=255) gggTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCAtt < 8:31147/149‑1 (MQ=255) cggcgCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCcaca > 6:70733/1‑149 (MQ=255) cgcgAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGcc > 8:104208/1‑122 (MQ=255) cgcgAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGcc < 7:104208/122‑1 (MQ=255) cgAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCAtt < 5:12320/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGaa < 8:105904/149‑1 (MQ=255) cTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAaccac < 2:217497/149‑1 (MQ=255) ggAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAAc < 6:68504/149‑1 (MQ=255) ggAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAAc > 2:254964/1‑149 (MQ=255) ggAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAAc < 4:158172/149‑1 (MQ=255) gTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGTGAac < 5:70733/148‑1 (MQ=255) gTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAaca > 6:310652/1‑149 (MQ=255) gTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAaca > 3:148646/1‑149 (MQ=255) cGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACAcgcg < 2:180218/149‑1 (MQ=255) aGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGaa > 7:132147/1‑148 (MQ=255) aGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑t < 5:310652/149‑1 (MQ=255) tGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGCGGAGGTTGCGGTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCGTCGTGGTGTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑Ta > 1:245703/1‑149 (MQ=255) tGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCTGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TAc < 3:35479/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCg > 3:323308/1‑149 (MQ=255) cTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGa < 2:245703/149‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGAc > 3:28172/1‑149 (MQ=255) tGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGTCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCAtt < 5:191423/115‑1 (MQ=255) tGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGTCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCAtt > 6:191423/1‑115 (MQ=255) gCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGaa < 8:42852/132‑1 (MQ=255) cACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGTCAGTTCGCGGATCAgg < 1:197503/68‑1 (MQ=255) cACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGTCAGTTCGCGGATCAgg > 2:197503/1‑68 (MQ=255) cACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGTCAGTTCGCGGATCAgg > 2:192265/1‑68 (MQ=255) cACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GACGTTGCGCTTGGTCAGTTCGCGGATCAgg < 1:192265/68‑1 (MQ=255) ccGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTc > 1:332134/1‑149 (MQ=255) cGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCg < 6:85394/149‑1 (MQ=255) gCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTg < 4:242314/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATgg < 7:39180/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCg > 7:32079/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCg > 2:132499/1‑149 (MQ=255) gTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCa > 6:336670/1‑149 (MQ=255) gTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCa < 4:148646/149‑1 (MQ=255) ggC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCACCg > 4:100665/1‑149 (MQ=255) ggC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCACCg < 3:305689/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAACTACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCACCGCCTCCAg < 1:254964/148‑1 (MQ=255) ggCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCACCGCCTCCAGCACAAt < 5:336670/147‑1 (MQ=255) gCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCACCGCCTCCAGCACAATgcg > 4:160602/1‑149 (MQ=255) | TCTTCGCCTTTCTCGGCGGTATAGGCACCGGCCGCGATGATCACCCCGGGGTAGGCGGCGCGAATGGCCTGGC‑GGAACTCGTCACGCAGTGGCTTGCCACCGGCCCAGTCCGGCTCGGACAGGTGCAGGTAGGC‑GAGGTTGCGCTTGGCCAGTTCGCGGATCAGGTACAGGCCGGCGGCCTCCTGGTCTTCGCCATTGTCCACACCATTGAAACCACCCAACGGGAACACGCGAA‑TACCGACCCGGTCGGCGCTCCAGTTGGCAATGGCCGCATCCACCGCCTCCAGCACAATGCG > NC_002947/3596083‑3596378 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |