| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 288,016 | T→C | 5.5% | Y31C (TAC→TGC) | tauA ← | taurine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 288,016 | 0 | T | C | 5.5% | 214.2 / 2.1 | 72 | Y31C (TAC→TGC) | tauA | taurine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/34); new base C (2/2); total (36/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
CACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGATCT > NC_002947/287883‑288162 | cACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑GCACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAgg < 1:182975/149‑1 (MQ=255)cACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGCCTGGTAGGCCACt < 6:8094/142‑1 (MQ=255)cACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGCCTACCAGACCACTGt < 5:272524/144‑1 (MQ=255) aCGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGTTCACGTGTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTTCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGG‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAgg < 1:188465/148‑1 (MQ=255) aCGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTc > 1:199723/1‑149 (MQ=255) cGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCg < 2:214422/149‑1 (MQ=255) cTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTg > 2:21016/1‑149 (MQ=255) cACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTgaccct > 8:275539/1‑144 (MQ=255) aCGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGATCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACATGCGCAAGTTTGGCCGGGTC‑G‑ACATTGTTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGATGCATGGGcc > 1:64878/1‑148 (MQ=255) aCGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCaa > 3:10216/1‑149 (MQ=255) aCGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGCCTACCAGACCACTGTc > 8:152736/1‑129 (MQ=255) aCGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGCCTACCAGACCACTGTc < 7:152736/129‑1 (MQ=255) gTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCt < 4:162605/149‑1 (MQ=255) tCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGt < 2:327523/148‑1 (MQ=255) cACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGt < 3:118074/147‑1 (MQ=255) cACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGt > 4:118074/1‑147 (MQ=255) tGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGCCCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGc > 6:176550/1‑147 (MQ=255) tGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGc > 5:119876/1‑147 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAgg > 7:184375/1‑149 (MQ=255) ccGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGt > 5:20720/1‑149 (MQ=255) ttATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAg > 3:186540/1‑149 (MQ=255) aTCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAgg < 2:64878/148‑1 (MQ=255) cAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcg > 4:259335/1‑149 (MQ=255) aaaTTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcgg > 8:291067/1‑149 (MQ=255) aaTTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcggc < 4:300666/149‑1 (MQ=255) cgcCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAg < 6:20720/149‑1 (MQ=255) gcCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAgg > 2:227253/1‑149 (MQ=255) ccAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGCGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGgc < 4:186540/149‑1 (MQ=255) cAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGgcg < 5:123026/149‑1 (MQ=255) gATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGc < 4:2545/148‑1 (MQ=255) gATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCg < 3:158075/149‑1 (MQ=255) gATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCg > 1:177128/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTg > 5:33555/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTg > 8:198912/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTGGCTTTTTCGTAGGCGCCATCGACCTGCGCCCCTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGGCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCGGGGGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGc < 5:191143/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCg < 3:259335/149‑1 (MQ=255) cTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGAGTC‑G‑ACACTGGTCTGGTAGCGCACTGTCAGGTCGGCTGCATGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGCGTCTGGGGGGCGAACAGGCGCAGAGGAGCGGGCGGGAt > 8:112931/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGAt > 2:48329/1‑148 (MQ=255) gCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATc < 6:33555/147‑1 (MQ=255) cTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATg < 8:68396/149‑1 (MQ=255) tttttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATgg < 8:184375/149‑1 (MQ=255) tttttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCAAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATgg > 5:257292/1‑149 (MQ=255) gTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGaa < 3:320198/148‑1 (MQ=255) gTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAc > 4:173072/1‑149 (MQ=255) gTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAc > 2:79684/1‑149 (MQ=255) tAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAcc > 3:184007/1‑149 (MQ=255) gCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCGGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCg > 4:3287/1‑149 (MQ=255) cATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGt > 5:328462/1‑148 (MQ=255) gACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGc < 1:21016/149‑1 (MQ=255) cgcCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCgg > 4:103381/1‑108 (MQ=255) cgcCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCgg < 3:103381/108‑1 (MQ=255) ccACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCgtg < 7:198912/149‑1 (MQ=255) cACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCgtgt > 6:270550/1‑149 (MQ=255) cACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCgtgt < 2:177128/149‑1 (MQ=255) aCTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGtt > 7:127570/1‑149 (MQ=255) cTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTg < 1:79684/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTg < 7:291067/149‑1 (MQ=255) tttGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTgg < 4:10216/149‑1 (MQ=255) cGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACg < 4:232373/149‑1 (MQ=255) gggTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACga < 6:119876/149‑1 (MQ=255) ggTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTc < 2:185685/134‑1 (MQ=255) ggTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTc > 1:185685/1‑134 (MQ=255) c‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAg > 7:184104/1‑149 (MQ=255) tg‑ACAGTGGCCTACCAGACCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAg > 3:318396/2‑149 (MQ=255) aCAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGc > 3:202559/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCt < 1:48329/149‑1 (MQ=255) cAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCt < 1:154162/149‑1 (MQ=255) tGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGATCCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGATc > 5:156515/1‑149 (MQ=255) gTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGAt < 1:227253/146‑1 (MQ=255) gTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGAt < 5:270550/146‑1 (MQ=255) gTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGATCt > 5:135928/1‑148 (MQ=255) gTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGATCt > 1:113673/1‑148 (MQ=255) | CACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAG‑TCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTC‑G‑ACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGATCT > NC_002947/287883‑288162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |