Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 296,502 | A→T | 5.9% | L501Q (CTG→CAG) | gshA ← | glutamate‑‑cysteine ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 296,502 | 0 | A | T | 5.9% | 203.1 / 2.0 | 67 | L501Q (CTG→CAG) | gshA | glutamate‑‑cysteine ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/35); new base T (2/2); total (30/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 |
GCCAGGATCGCCTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGAAGCTCTCGTCATGCTCGGTC > NC_002947/296359‑296648 | gccAGGATCGCCTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCg > 6:242314/1‑149 (MQ=255) ccAGGATCGCCTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCgg < 5:46195/149‑1 (MQ=255) ccAGGATCGCCTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCg > 2:206116/1‑148 (MQ=255) cAGGATCGAGGCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGa > 2:242585/1‑149 (MQ=255) ggATCGCCTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACt < 6:308238/149‑1 (MQ=255) aTCGCCTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGc < 1:206116/149‑1 (MQ=255) ctctATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGgc < 2:96398/149‑1 (MQ=255) cTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGgc > 8:136165/1‑149 (MQ=255) gATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGgcga < 2:156815/148‑1 (MQ=255) ctggcTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTcgcg > 6:219998/1‑149 (MQ=255) gctgctGGCGCGTGGTTTGCTCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCgg < 6:347055/147‑1 (MQ=255) gctgctGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGc > 2:242409/1‑149 (MQ=255) ctgGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGGGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCa < 5:84332/147‑1 (MQ=255) tgGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTc < 4:174141/138‑1 (MQ=255) tgGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTc > 3:174141/1‑138 (MQ=255) gcgTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGtctc < 7:230014/149‑1 (MQ=255) gcgTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGtctc > 3:10699/1‑149 (MQ=255) gcgcGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAAtgctt < 8:165106/148‑1 (MQ=255) gggTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCTGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTgctgct > 2:334220/1‑149 (MQ=255) gtggtgCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCg < 6:244491/149‑1 (MQ=255) tgCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGc < 8:257434/149‑1 (MQ=255) gCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGc > 8:285354/1‑148 (MQ=255) ggTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCt > 4:250883/1‑147 (MQ=255) ttCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGc < 6:170798/149‑1 (MQ=255) catcaACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCgg > 4:100177/1‑149 (MQ=255) catcaACTGCTCATTGCCAGGATGCTGGCCTTGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCg < 4:196364/148‑1 (MQ=255) atcaACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGt > 6:342800/1‑149 (MQ=255) tcaACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTtgctgc > 3:31618/1‑130 (MQ=255) tcaACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTtgctgc < 4:31618/130‑1 (MQ=255) tcaACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGCTTTGCTCCTGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGCCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGtt > 3:193883/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCTGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGTGGTTGc < 1:334220/149‑1 (MQ=255) aaCTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGc > 3:291793/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGc < 5:219998/149‑1 (MQ=255) tgctgATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTcg > 3:118217/1‑149 (MQ=255) tgcggATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGACCAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCAAGCTCTGAATGACTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGAGTCGCGAATGCTTGCTGCTTTTCTGTGCTCCGCGGTTGCTct > 3:146824/1‑148 (MQ=255) ctgATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTcgcg < 5:342800/149‑1 (MQ=255) ctgATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTcgc < 1:242409/148‑1 (MQ=255) ctgATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCCCAGCGGTTGCTcgc < 7:285354/148‑1 (MQ=255) tgATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTcgcg > 4:302341/1‑148 (MQ=255) aTTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTTGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGa > 5:1433/1‑148 (MQ=255) ttGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGaaa < 7:136165/149‑1 (MQ=255) tGCCAGGATGTTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAg > 5:278263/1‑149 (MQ=255) ccAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGtc < 2:328633/149‑1 (MQ=255) cAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCgg < 1:274847/142‑1 (MQ=255) cAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCgg > 2:274847/1‑142 (MQ=255) aGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTTGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGtctc < 6:1433/149‑1 (MQ=255) ggATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCg > 4:151731/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCgg < 3:151731/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGc < 3:250883/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCg > 6:305231/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTg < 7:10846/149‑1 (MQ=255) ccTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGcaca < 1:242585/149‑1 (MQ=255) cTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCacac > 2:141066/1‑149 (MQ=255) aCAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGACTGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCgag < 5:242314/149‑1 (MQ=255) gTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACt > 3:143451/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACt > 8:15762/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGAGGAGTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCTGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGCAcg > 8:313523/1‑148 (MQ=255) acGAAGTCGGTGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTg > 2:295800/2‑149 (MQ=255) aaGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGAc < 4:50005/149‑1 (MQ=255) tCACCGACTTCGGTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGaa < 2:93227/149‑1 (MQ=255) aCCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGAAg < 1:141066/148‑1 (MQ=255) aCCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGAAg < 3:100177/148‑1 (MQ=255) gTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGAAGCTCTCGTCa < 7:15762/148‑1 (MQ=255) gCTCCTGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGCCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGAAGCTCTCGTCATGCTc < 4:193883/148‑1 (MQ=255) cTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGAAGCTCTCGTCATGCTCgg < 1:295800/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGAc > 4:37835/1‑127 (MQ=255) cAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGAAGCTCTCGTCATGCTCGGTc < 6:278263/148‑1 (MQ=255) | GCCAGGATCGCCTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATCAACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGTTGCTCAGCGGTTGCTCGCGGAAAGTCTCGGCGTGCACACGGCTCTGGCGCAGCGAGAACTGGACGAAGCTCTCGTCATGCTCGGTC > NC_002947/296359‑296648 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |