Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,912,130 | A→G | 5.4% | E159G (GAG→GGG) | PP_3452 → | GGDEF domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,912,130 | 0 | A | G | 5.4% | 224.2 / 2.3 | 74 | E159G (GAG→GGG) | PP_3452 | GGDEF domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/32); new base G (2/2); total (40/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
CGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGT > NC_002947/3911983‑3912271 | cGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAg < 3:43496/149‑1 (MQ=255) gATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGc > 7:266914/1‑149 (MQ=255) cgcCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGGGCTCGATgcgg < 5:280132/148‑2 (MQ=255) cGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGaa < 5:234055/149‑1 (MQ=255) tgtgGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGgc < 3:274423/149‑1 (MQ=255) ggggTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATc < 6:170252/147‑1 (MQ=255) gtCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGAt < 7:300553/118‑1 (MQ=255) gtCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGAt > 8:300553/1‑118 (MQ=255) gtCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATg > 4:5504/1‑149 (MQ=255) cACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCAACTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCg > 6:63640/1‑149 (MQ=255) aCCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCgt > 4:214180/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGc > 2:337522/1‑131 (MQ=255) cTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTc > 6:41383/1‑148 (MQ=255) tATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACATCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATg < 1:249606/136‑1 (MQ=255) tATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATg > 2:249606/1‑136 (MQ=255) ccATGTCGGTGCTACTGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGc > 7:76582/1‑149 (MQ=255) ccATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGc > 4:34129/1‑149 (MQ=255) tCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGt > 1:228539/1‑149 (MQ=255) ggTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGt > 5:62169/1‑147 (MQ=255) gTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTaa > 8:186874/1‑136 (MQ=255) gTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTaa < 7:186874/136‑1 (MQ=255) tGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTcagc > 7:89422/1‑149 (MQ=255) tGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTcagc > 1:298361/1‑149 (MQ=255) tACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTcagcta > 6:275848/1‑148 (MQ=255) ccGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTcagctacag > 5:60603/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTcagctac < 3:34129/147‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCagctacagctac < 3:214180/149‑1 (MQ=255) ggcgCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTg < 8:266914/149‑1 (MQ=255) gTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATcc > 3:196401/1‑149 (MQ=255) gTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATcc > 3:136612/1‑149 (MQ=255) aTTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGc > 4:88453/1‑148 (MQ=255) aTTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGc > 6:237878/1‑148 (MQ=255) cttctGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGGCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAg < 5:63640/148‑1 (MQ=255) cttctGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAg < 8:89422/148‑1 (MQ=255) ctGCGCCATGGTCCTCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAg < 8:222137/145‑1 (MQ=255) gattaagcatcaCCCAGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACATGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTg > 5:187681/8‑149 (MQ=255) gattaagcatcaCCCAGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATAAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTg > 7:173668/8‑149 (MQ=255) aTGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGca > 1:40723/1‑149 (MQ=255) tGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGc > 2:44794/1‑104 (MQ=255) tcatcaCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAAt < 2:298361/149‑1 (MQ=255) catcaCCTGGGCGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGACCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAAtt > 2:152936/1‑149 (MQ=255) tcaCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTc < 5:275848/149‑1 (MQ=255) caCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTc > 6:14685/1‑148 (MQ=255) caCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTc > 7:302469/1‑148 (MQ=255) aCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCt < 6:60603/148‑1 (MQ=255) aCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTa < 5:41383/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTa > 4:315354/1‑149 (MQ=255) aCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTa < 8:302469/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTAc < 5:237878/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTAc < 3:24901/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTAcc > 1:174771/1‑149 (MQ=255) ggTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGt > 6:269448/1‑149 (MQ=255) ggTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGt > 3:284393/1‑149 (MQ=255) ggTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGt < 3:5504/149‑1 (MQ=255) tGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAg < 2:228539/149‑1 (MQ=255) aTCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTg < 4:136612/149‑1 (MQ=255) cGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTg < 2:40723/149‑1 (MQ=255) cGTTCTACCACACCCGCATCGAGACCGATTCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACATGTCCAAGGTGTTGCTg > 3:180575/1‑149 (MQ=255) ttCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATc > 1:185522/1‑102 (MQ=255) ttCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATc < 2:185522/102‑1 (MQ=255) ttCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGa < 6:62169/149‑1 (MQ=255) tACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGc > 6:236950/1‑148 (MQ=255) ccACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAATGTGTTGCTGGAGc < 5:236950/146‑1 (MQ=255) ccACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCaa < 5:269448/148‑1 (MQ=255) ccACACCCACATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAg > 4:103181/1‑149 (MQ=255) cacaCCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGc < 4:284393/149‑1 (MQ=255) cacCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCt < 8:76582/149‑1 (MQ=255) agcGCATCGGGCTCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTAc > 6:130997/3‑149 (MQ=255) gcGCATCGGGCTCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACg < 5:130997/148‑1 (MQ=255) gcGCATCGGGCTCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGAACCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACg > 6:119787/2‑149 (MQ=255) ccGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACg > 5:71835/1‑149 (MQ=255) cGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGt < 2:174771/149‑1 (MQ=255) gAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATc < 7:164969/84‑1 (MQ=255) gAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATc > 8:164969/1‑84 (MQ=255) | CGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGT > NC_002947/3911983‑3912271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |