| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,923,896 | C→G | 5.7% | E306D (GAG→GAC) | peaB ← | quinohemoprotein amine dehydrogenase modification protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,923,896 | 0 | C | G | 5.7% | 233.2 / 3.2 | 70 | E306D (GAG→GAC) | peaB | quinohemoprotein amine dehydrogenase modification protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/34); new base G (2/2); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.71e-01 | |||||||||||
CACACGGCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCCGCGCCCCCAC > NC_002947/3923754‑3924042 | cacaCGGCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCg > 2:27902/1‑149 (MQ=255) acacGGCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGc > 2:280040/1‑149 (MQ=255) cacGGCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGAGCTGGTGCAGGTCTTCGcc < 4:250698/149‑1 (MQ=255) acGGCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCa < 4:15659/149‑1 (MQ=255) acGGCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCa < 1:97284/149‑1 (MQ=255) ggCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGt < 7:56812/149‑1 (MQ=255) gCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTg < 7:11868/149‑1 (MQ=255) acttgttGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCGAGTGCCGCTTCCAGTTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTg < 7:214031/148‑1 (MQ=255) ggCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCATTGCCGCTTCCACGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGc < 1:245612/122‑1 (MQ=255) ggCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGc > 2:245612/1‑122 (MQ=255) gCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGcc < 3:33690/148‑1 (MQ=255) cTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAgg > 8:115087/1‑134 (MQ=255) cTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATg > 4:267597/1‑149 (MQ=255) cTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATg > 2:123711/1‑149 (MQ=255) gTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCGTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGACGc > 3:146879/1‑149 (MQ=255) tGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCagag < 1:27902/149‑1 (MQ=255) aTCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCgg < 3:142978/149‑1 (MQ=255) tCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCggg < 5:300077/149‑1 (MQ=255) aaCTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCgggg < 3:197592/148‑1 (MQ=255) aaCTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGc < 4:120205/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCagag < 4:72052/133‑1 (MQ=255) gTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCagag > 3:72052/1‑133 (MQ=255) gTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGc > 1:53453/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGAGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGc > 3:133958/1‑149 (MQ=255) gTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCt > 5:84296/1‑149 (MQ=255) ggAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCGGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCgg > 7:218809/1‑149 (MQ=255) agaAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGc > 6:175410/1‑148 (MQ=255) aGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGCCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGaaa < 1:240824/149‑1 (MQ=255) gCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAAc > 5:331216/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGtt < 5:228043/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGtt < 8:91141/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGt < 1:4643/148‑1 (MQ=255) ggTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGtt > 2:209611/1‑148 (MQ=255) cAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAggt > 5:305159/1‑149 (MQ=255) aGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAggtg > 4:84845/1‑149 (MQ=255) tGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCCCCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTCACCGGGGCAAAGCCGCCCTCGGCGAACCCCATGTCGTTGAACAggtggt > 7:151688/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTc < 3:84845/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTc > 1:7230/1‑149 (MQ=255) cGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTcc < 6:305159/149‑1 (MQ=255) cGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTcc < 1:209611/149‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTc > 7:145736/1‑147 (MQ=255) tCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGa < 4:146879/148‑1 (MQ=255) ccAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGAt < 4:133958/148‑1 (MQ=255) cAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATgg < 4:6156/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATg < 6:331216/148‑1 (MQ=255) aGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAgg < 5:159525/135‑1 (MQ=255) aGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAgg > 6:159525/1‑135 (MQ=255) ggtcccgcCGGCCGAGGGCCTTCATCGTGGCGACGCCCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGGTGCAGGCGGCCATGTCGCCAGAGCTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTCGCACAGGTGGTTCCAGATgggt < 8:151688/144‑3 (MQ=255) gTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGtt > 3:8627/1‑148 (MQ=255) gcgcCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCaa < 6:84296/149‑1 (MQ=255) gccgAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCgg < 8:145736/149‑1 (MQ=255) gTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATg < 2:53453/149‑1 (MQ=255) cTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCAc > 7:224731/1‑149 (MQ=255) tGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTc < 4:258471/149‑1 (MQ=255) tGGCGAAGAGCTGGTGCAGGTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCAc > 1:213500/1‑141 (MQ=255) tGGCGAAGAGCTGGTGCAGGTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCAc < 2:213500/141‑1 (MQ=255) gAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGa > 5:158959/1‑149 (MQ=255) gAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGa > 2:284793/1‑149 (MQ=255) gAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGa > 2:22127/1‑149 (MQ=255) aaGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGAc > 5:18157/1‑149 (MQ=255) cTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGttt > 5:69845/1‑113 (MQ=255) cTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGttt < 6:69845/113‑1 (MQ=255) cTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCcgcg > 5:128307/1‑149 (MQ=255) cTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCcgcg > 2:107965/1‑149 (MQ=255) gtgcAGGTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCCGCGccc > 3:10817/4‑149 (MQ=255) cACCAGCTCTTCGCCGGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCCgcgc < 8:218809/147‑1 (MQ=255) cACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCCGCGcc < 1:123711/148‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCCGCGCCCCCa > 7:81707/1‑149 (MQ=255) aGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGaa < 7:254647/71‑1 (MQ=255) aGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGaa > 8:254647/1‑71 (MQ=255) aGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCCGCGCCCCCAc < 2:7230/149‑1 (MQ=255) aGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCCGAGCCCCCAc > 4:157530/1‑149 (MQ=255) | CACACGGCAGGGCCTTCTTGTGGCCTTCGTGGATGTCGGTGATCAACTGGTGCAGGTTGGAGAAGCCGATGTTGCGGTGCTCCAGTGCCGCTTCCAGGTAGCGCCGGCCGAGTGCCTTCATGTTGGCGAAGACCTGCACCAGCTCTTCGCCAGTGAGGTTGAAGTCGGCCATGTCGCCAGAGGTAACCGGGGCAAAGCCGACCTCGGCGAAACCCATTTCGTTGAACAGGTGGTTCCAGATGGTTTCAACGTCGGTAATGCCACGGGTCAGCGTGACCCGCGCCCCCAC > NC_002947/3923754‑3924042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |