Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,077,797 | G→A | 6.1% | G381E (GGG→GAG) | PP_3588 → | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,077,797 | 0 | G | A | 6.1% | 192.9 / 2.1 | 66 | G381E (GGG→GAG) | PP_3588 | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/34); new base A (2/2); total (29/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.73e-01 |
CGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACGGGTGAATCAGCTTACAAGGCCGTACACCACG > NC_002947/4077653‑4077940 | cgcgTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCCATACGCCATGGCTGTTCGCCGGGGCCGGATTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAgggggg < 8:292120/149‑1 (MQ=255) cgcgTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTgg < 8:15934/149‑1 (MQ=255) gcgTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTg > 8:1114/1‑147 (MQ=255) gcgTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTg < 7:1114/147‑1 (MQ=255) aggcaggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCtt < 3:73813/149‑1 (MQ=255) aggcaggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCtt < 4:92060/149‑1 (MQ=255) aggcaggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCtt < 7:129145/149‑1 (MQ=255) aggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATGGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTtgcat < 4:256841/149‑1 (MQ=255) tGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTtgcagacg > 5:274892/1‑145 (MQ=255) cGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCAc < 5:186919/148‑1 (MQ=255) gCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCAcc > 1:53664/1‑147 (MQ=255) gCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCaa < 7:17252/149‑1 (MQ=255) gTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGgat > 6:77114/1‑148 (MQ=255) tCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGgatga > 1:131179/1‑149 (MQ=255) tCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGgatga < 5:183671/149‑1 (MQ=255) tCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGgatga > 2:189589/1‑149 (MQ=255) gCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGatgatg < 2:253038/149‑1 (MQ=255) gCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGatgatg < 2:118427/149‑1 (MQ=255) gCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGatgatg < 1:340165/149‑1 (MQ=255) gCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGatgatg < 7:306699/149‑1 (MQ=255) gCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGCGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGgatgat < 1:189589/148‑1 (MQ=255) tCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATgg > 5:81608/1‑148 (MQ=255) aaTACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAAt > 7:33761/1‑149 (MQ=255) aaTACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAAt < 4:124996/149‑1 (MQ=255) tACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGc < 5:77114/149‑1 (MQ=255) gACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAAc > 6:120672/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTAATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACgct > 3:257502/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGaaa > 1:332689/1‑149 (MQ=255) cGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAAc < 2:172290/148‑1 (MQ=255) tgccggtTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGAt > 1:259179/1‑148 (MQ=255) cggtTTGACGAGCATTGTGGTCGCAGGTTTGGTTAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATTGTGGCCATCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCTCCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAgg < 3:218484/149‑1 (MQ=255) cggtTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAgg > 4:143913/1‑149 (MQ=255) gtTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGc > 7:35746/1‑148 (MQ=255) tGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCaaa < 8:56529/148‑1 (MQ=255) aCGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCaaaaaa < 1:327966/149‑1 (MQ=255) aCGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCaaaaa < 8:33761/148‑1 (MQ=255) aCGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCaaaaa > 6:108019/1‑148 (MQ=255) gAGCAGTGTGGTCACAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCaaaaaaaa < 3:170039/149‑1 (MQ=255) gtgtGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATAccc < 6:81608/149‑1 (MQ=255) gtgtGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGGGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATAccc < 2:288331/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTgg > 5:278693/1‑149 (MQ=255) cGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGc > 5:44045/1‑149 (MQ=255) gAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGAc < 5:108019/149‑1 (MQ=255) gAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGAc < 2:259179/149‑1 (MQ=255) gAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGAc > 4:247322/1‑149 (MQ=255) aGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCa > 2:63745/1‑149 (MQ=255) cggccggcTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCtt > 5:56699/1‑148 (MQ=255) ggccggcTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTtga < 7:252993/149‑1 (MQ=255) ggcgggTTGGGGGTGGTGTTCATGGTGGGCAGGCTGTGGGGTTGGTGGGTGGTTGCATTCAACAATGATGATGGAATGCAAAGGTGGTGAAAACTTTATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTtgaa < 8:35746/147‑1 (MQ=255) gccggcTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTtgaa < 2:332689/149‑1 (MQ=255) gccggcTTGGGCGTGCTCTTCATGGTGGCCACCCTGTGCGGAGGGTGGCTCCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGAGGCGACAACCCACCCGGGCATACTtgaa > 2:286271/1‑149 (MQ=255) ccggcTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGAGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTtgaat > 4:112498/1‑149 (MQ=255) ccggcTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGAGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTtgaat > 6:271734/1‑149 (MQ=255) cggcTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGAGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGACACCTTGATCAGGCAAAAAAAATAGCGGGGGGGCGACAAGCGACCCGGGGATTCTtgaatg < 5:271734/149‑1 (MQ=255) cggcTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGAGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTtgaatg < 3:112498/149‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACggg < 6:56699/149‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACgg < 2:131179/148‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACgg < 5:120672/148‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGATTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACggg > 1:64769/1‑149 (MQ=255) gCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACGGGt < 6:278693/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACGGGTGAATCAGCTTa > 1:228192/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGATGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGAGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACGGGTGAATCAGCTTACAAGGc > 3:14123/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACGGGTGAATCAGCTTACAAGGCCg > 6:28400/1‑149 (MQ=255) gtgCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACGGGTGAATCAGCTTACAAGGCCGTacac > 4:209383/1‑148 (MQ=255) cGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACGGGTGAATCAGCTTACAAGGCCGTACACCACg < 2:228192/149‑1 (MQ=255) gAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACaa < 2:196706/89‑1 (MQ=255) gAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACaa > 1:196706/1‑89 (MQ=255) | CGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGCACCAAGGATGATGGAATGCAACGCTGCTGAAACCTTGATCAGGCAAAAAAAATACCCGGGTGGCGACAAGCGACCCGGGCATTCTTGAATGAAACGGGTGAATCAGCTTACAAGGCCGTACACCACG > NC_002947/4077653‑4077940 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |