| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,734,894 | T→A | 6.9% | E247D (GAA→GAT) ‡ | sucA ← | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,734,894 | 0 | T | A | 6.9% | 213.4 / 5.2 | 72 | E247D (GAA→GAT) ‡ | sucA | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/36); new base A (2/3); total (33/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
CAGCTCGTTCATCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGA > NC_002947/4734747‑4735041 | cAGCTCGTTCATCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCAttt < 5:159759/149‑1 (MQ=255)cAGCTCGTTCATCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCAtt > 4:112566/1‑148 (MQ=255) gCTCGTTCATCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCa > 2:274347/1‑149 (MQ=255) gTTCATCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACATCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGGCACGGTGGGCCATGCCGATCACTACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGCATCATTTCATCCa < 5:83555/149‑1 (MQ=255) ttCATCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATGAAATGATCCAg > 1:8828/1‑149 (MQ=255) ttCATCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAg > 7:1027/1‑149 (MQ=255) aTCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATGAAATGATCCAGcg < 2:8828/148‑2 (MQ=255) aTCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATGAAATGATCCAGcg < 7:213943/148‑2 (MQ=255) cttGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCg < 1:274347/146‑1 (MQ=255) gCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAAt > 4:307800/1‑147 (MQ=255) ccTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAg > 5:27490/1‑149 (MQ=255) ccTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGGGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAg < 6:61216/149‑1 (MQ=255) cTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAgg < 3:307800/149‑1 (MQ=255) ttCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGc > 1:285264/1‑149 (MQ=255) aaCTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTGCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGTCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCtctc < 8:276229/149‑1 (MQ=255) cTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTcgc < 7:176836/149‑1 (MQ=255) cTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTcgc < 7:172088/149‑1 (MQ=255) tcgtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTcgcc > 3:250284/1‑149 (MQ=255) gtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAgg > 5:224122/1‑139 (MQ=255) gtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAgg < 6:224122/139‑1 (MQ=255) gtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTcgccgc > 2:255325/1‑149 (MQ=255) gtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTcgccgc < 7:35414/149‑1 (MQ=255) gtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTcgccgc > 8:35414/1‑149 (MQ=255) gtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTcgcc < 1:188248/147‑1 (MQ=255) cgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCt > 1:301129/1‑149 (MQ=255) gAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCtt < 1:318758/149‑1 (MQ=255) gAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCtt < 1:313911/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCCGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAgg > 5:91940/1‑149 (MQ=255) gCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAgg < 7:179086/149‑1 (MQ=255) tCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGcc > 3:125473/1‑149 (MQ=255) ttCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCtt < 1:201652/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTg < 4:279750/148‑1 (MQ=255) tGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTg > 8:80880/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCg > 6:154662/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCg < 4:125473/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTgg < 2:339553/142‑1 (MQ=255) aaGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTgg > 1:339553/1‑142 (MQ=255) aaGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCgg < 2:285264/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCg > 4:171906/1‑148 (MQ=255) aaGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCg < 3:171906/148‑1 (MQ=255) aaGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCAGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCgg < 4:250284/149‑1 (MQ=255) gtTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACt > 8:21510/1‑149 (MQ=255) ttCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGTGCCATGCCGATCACGTCCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACtt < 5:44430/149‑1 (MQ=255) ttCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACtt > 6:132148/1‑149 (MQ=255) ttCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACtt > 7:294213/1‑149 (MQ=255) cACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTg < 5:154662/148‑1 (MQ=255) aCCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGt < 1:255325/149‑1 (MQ=255) gCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGcc > 4:267718/1‑148 (MQ=255) gCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGcc > 7:72911/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTa < 8:105679/149‑1 (MQ=255) ttCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTa > 3:128074/1‑149 (MQ=255) aGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACtt < 3:267718/149‑1 (MQ=255) gcggcCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACtttt > 2:252580/1‑149 (MQ=255) ggcCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTcc < 7:21510/149‑1 (MQ=255) ggCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCAc > 4:145641/1‑149 (MQ=255) cATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCACGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACcg > 1:176849/1‑149 (MQ=255) cGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTcc > 3:130697/1‑131 (MQ=255) cGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTcc < 4:130697/131‑1 (MQ=255) cGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGtt < 6:126899/149‑1 (MQ=255) cGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGt > 7:1006/1‑148 (MQ=255) aCCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTc > 4:301315/1‑149 (MQ=255) tcctTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAg > 4:258598/1‑149 (MQ=255) ctTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGc < 7:226862/148‑1 (MQ=255) ttGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAg > 5:188565/1‑149 (MQ=255) c‑cGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGc < 3:145641/149‑1 (MQ=255) tAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAg < 6:247289/110‑1 (MQ=255) agagCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGc < 1:252580/148‑1 (MQ=255) gatgCTGGATGAAATGATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGc < 6:47010/145‑1 (MQ=255) gatgCTGGATGAAATGATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGc > 5:47010/4‑148 (MQ=255) aaCGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCg < 6:91940/149‑1 (MQ=255) gCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGTCGTATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGaa < 1:279103/149‑1 (MQ=255) gCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGaa < 7:80880/149‑1 (MQ=255) gATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCAc < 3:81030/135‑1 (MQ=255) gATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCAc > 4:81030/1‑135 (MQ=255) tttCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGa > 7:156622/1‑149 (MQ=255) | CAGCTCGTTCATCTTCTTGCCTTCGAACTCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGC‑CGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGA > NC_002947/4734747‑4735041 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |