Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,962,589 | T→A | 6.6% | K356* (AAG→TAG) | fleS ← | two‑component system sensor histidine kinase FleS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,962,589 | 0 | T | A | 6.6% | 178.5 / 3.0 | 61 | K356* (AAG→TAG) | fleS | two‑component system sensor histidine kinase FleS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/34); new base A (2/2); total (25/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 |
ACCCCCTCCGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATCGCTGGCCTGCAGGGC > NC_002947/4962441‑4962733 | acCCCCTCCGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCT‑ATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTtg > 2:108871/1‑149 (MQ=255) ccccTCCGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTtgg < 1:217498/149‑1 (MQ=255) cccTCCGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTtggt < 5:217873/149‑1 (MQ=255) ccTCCGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTtggtg > 3:51801/1‑149 (MQ=255) ccTCCGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTtggtg < 2:189744/149‑1 (MQ=255) cGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTggtggt > 3:311887/1‑147 (MQ=255) cGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTaa < 1:17488/149‑1 (MQ=255) gCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAg < 6:325069/149‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGaa > 5:292898/1‑149 (MQ=255) aTTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCATGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAAc < 8:299581/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACg < 6:292898/149‑1 (MQ=255) cccGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGtt < 2:19077/149‑1 (MQ=255) ccGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTc < 2:64389/149‑1 (MQ=255) gTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTTACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTTGTAAGGAACGGTTCGc > 6:304670/1‑149 (MQ=255) tCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGcc > 7:260990/1‑149 (MQ=255) aTCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCa > 8:254631/1‑148 (MQ=255) aTCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCT‑ATGCCCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCaaa < 1:108871/149‑1 (MQ=255) tCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCaaa > 1:33989/1‑149 (MQ=255) catcGGCAGCTCTACCCGCACGGAGGTACCAGGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTTATGGGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCaaa < 3:31954/145‑1 (MQ=255) cAGCTCCACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGa < 1:159941/149‑1 (MQ=255) gCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAg > 3:63768/1‑148 (MQ=255) gCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGc < 4:311887/149‑1 (MQ=255) ctctACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGc > 5:329649/1‑148 (MQ=255) tctACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGc > 3:112185/1‑147 (MQ=255) tACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCaa < 1:163438/147‑1 (MQ=255) cccGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCt < 8:198914/149‑1 (MQ=255) ccGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTAGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTg > 7:161147/1‑149 (MQ=255) ccGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTAGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTg > 3:323391/1‑149 (MQ=255) gcacgcaGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCa < 8:260990/149‑1 (MQ=255) caGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGAt < 4:112185/149‑1 (MQ=255) gTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTTCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGGGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGcc < 2:267210/149‑1 (MQ=255) aCCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTggtggt < 8:154335/102‑1 (MQ=255) cGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCt > 1:44458/1‑132 (MQ=255) cGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCt < 2:44458/132‑1 (MQ=255) ggCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCg < 4:51801/149‑1 (MQ=255) ccGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCgg > 8:161752/1‑148 (MQ=255) ccGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGc < 7:306238/149‑1 (MQ=255) gACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGTGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCAt < 7:100238/149‑1 (MQ=255) cTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCg > 8:244316/1‑149 (MQ=255) gcAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCCCCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGca > 4:250215/1‑148 (MQ=255) aGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAg < 5:59317/149‑1 (MQ=255) tCGTGCCCTGATTCGCACTCACCACCCCCTTGACCACGGCCATGCCCACGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGATCCCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGAGCAAg < 5:304670/149‑1 (MQ=255) cGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGAt < 4:118119/114‑1 (MQ=255) cGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGAt > 3:118119/1‑114 (MQ=255) cccTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGGCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACg > 4:198884/1‑149 (MQ=255) tGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGT‑AGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGCCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTcg > 8:305420/1‑149 (MQ=255) cgcacgcaCCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCgcgg < 7:161752/148‑1 (MQ=255) gcacgcacCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCgcggcg > 1:91307/1‑149 (MQ=255) gcacgcacCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCgcggcg > 7:34085/1‑149 (MQ=255) gcacCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTa > 4:94420/1‑148 (MQ=255) accaccGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGGCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAg < 3:198884/149‑1 (MQ=255) accaccGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCgcggcg > 6:39682/1‑143 (MQ=255) accaccGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCgcggcg < 5:39682/143‑1 (MQ=255) accaccGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAg > 2:9806/1‑149 (MQ=255) ccaccGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAgg < 2:334446/149‑1 (MQ=255) accGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTg < 6:329649/149‑1 (MQ=255) gCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCAc < 8:34085/149‑1 (MQ=255) cggtaccGGCCTGGGCCTGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCtt > 4:116518/7‑148 (MQ=255) cACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGcc > 7:304795/1‑149 (MQ=255) ggccGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATCg < 7:254631/149‑1 (MQ=255) gccGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATc < 3:116518/147‑1 (MQ=255) ccGGTACCGGTGGCCTAGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATCGCt < 8:161147/149‑1 (MQ=255) ccGGTACCGGTGGCCTAGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATCGCt < 4:323391/149‑1 (MQ=255) cGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATCGCTg < 2:234859/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATCGCTGGCCTg < 3:250215/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATCGCTGGCCTGCAGGGc < 4:63768/149‑1 (MQ=255) | ACCCCCTCCGCCAATTGCCCGTCGATCAACGGCAGCTCTACCCGCACGCAGGTACCACGGCCGACTTTCGAGCGCAGGTTGATCGTGCCCTGATGCGCACGCACCACCGCCTTGACCACGGCCAGGCCCAGGCCGGTACCGGTGGCCTTGGTGGTAAGGAACGGTTCGCCCAAACGACCGAGCAAGCCTGCATCGATGCCACTGCCGGCATCGCTGACGCACAGGTGCAAGCTACGTTCGCGGCGGTACAGGTGCACCTTCAGCCGCGCCGGGCCATCGCTGGCCTGCAGGGC > NC_002947/4962441‑4962733 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |