Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,964,613 | C→T | 7.8% | D249N (GAC→AAC) | fleQ ← | transcriptional regulator FleQ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,964,613 | 0 | C | T | 7.8% | 185.0 / 4.1 | 64 | D249N (GAC→AAC) | fleQ | transcriptional regulator FleQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/32); new base T (3/2); total (30/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.46e-01 |
GTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGAC > NC_002947/4964465‑4964757 | gTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTc < 2:20446/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGc > 8:58373/1‑149 (MQ=255) ccGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGcc > 1:158862/1‑149 (MQ=255) cGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtcg > 5:264274/1‑149 (MQ=255) gATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtc < 8:179156/147‑1 (MQ=255) aTCATGGTGTCGAGGTTCTTGTGCGGCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGGCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtcgtc < 6:250005/149‑1 (MQ=255) aTGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGa < 8:185466/148‑1 (MQ=255) tCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACa < 2:67654/148‑1 (MQ=255) gAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAggg < 3:120732/149‑1 (MQ=255) gAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAgg < 1:22217/148‑1 (MQ=255) gAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAgg < 8:206012/148‑1 (MQ=255) gTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTAc > 7:61873/1‑149 (MQ=255) gtgCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGt > 2:119612/1‑149 (MQ=255) tgCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGtt < 6:305804/149‑1 (MQ=255) cGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTgg < 1:305346/149‑1 (MQ=255) cGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTg < 6:80202/148‑1 (MQ=255) gTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGc < 7:58373/149‑1 (MQ=255) cAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGt > 8:69984/1‑149 (MQ=255) aGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGtt < 3:130520/149‑1 (MQ=255) atgatgCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGaa < 5:50896/149‑1 (MQ=255) atgCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAAc < 3:316294/148‑1 (MQ=255) cACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTTGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCgg < 4:10044/149‑1 (MQ=255) cGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCa < 2:158862/149‑1 (MQ=255) cGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACgg > 3:180096/1‑149 (MQ=255) gATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTTGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGc > 7:311767/1‑149 (MQ=255) gTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGc < 2:33474/149‑1 (MQ=255) gttgCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCATACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCg < 1:167352/148‑1 (MQ=255) gttgCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGccc < 4:180096/146‑1 (MQ=255) gttgCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCgg > 7:86477/1‑149 (MQ=255) tgCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCAAGGCTGGTGATGGCCCCGGt > 8:310276/1‑148 (MQ=255) cACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTAGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGgcgc > 2:152789/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTTGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGcc < 8:311767/149‑1 (MQ=255) cgcTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCtt < 8:61873/149‑1 (MQ=255) gcTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTtc > 8:86519/1‑149 (MQ=255) gAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGa < 5:300163/122‑1 (MQ=255) gAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGa > 6:300163/1‑122 (MQ=255) gAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGt > 4:301081/1‑149 (MQ=255) aGGTACGCTCCTGAAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTgg > 5:199567/1‑149 (MQ=255) ggTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTGGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGc > 6:206945/1‑149 (MQ=255) gTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTTGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGcc > 4:226734/1‑149 (MQ=255) cGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGaa < 1:152789/149‑1 (MQ=255) tCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAg > 2:276081/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCgg < 6:301139/98‑1 (MQ=255) cagcaCACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCGCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGc > 7:146154/1‑149 (MQ=255) cagcaCACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTc < 1:119612/147‑1 (MQ=255) cagcaCACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCg < 7:86519/148‑1 (MQ=255) cacaCGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCttt < 6:264274/149‑1 (MQ=255) cacaCGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGCCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCACTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCtt > 4:282335/1‑148 (MQ=255) acGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCca < 3:301081/149‑1 (MQ=255) cagcagCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTCCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCtt > 8:84361/1‑142 (MQ=255) cagcagCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTCCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCtt < 7:84361/142‑1 (MQ=255) agcagcTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCcagcag > 4:176441/1‑149 (MQ=255) gACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCg > 2:283705/1‑149 (MQ=255) aCCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCgg > 6:146559/1‑149 (MQ=255) ccTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCggg < 7:69984/149‑1 (MQ=255) gCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATc > 5:5567/1‑149 (MQ=255) gCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATc > 4:28140/1‑149 (MQ=255) cATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATcg > 6:47112/1‑149 (MQ=255) tCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATcgcg < 3:176441/149‑1 (MQ=255) cGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCgcgc > 4:94602/1‑149 (MQ=255) gCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCca > 2:148290/1‑149 (MQ=255) aaCGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCcaca < 3:94602/149‑1 (MQ=255) ggCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCTAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGtt < 6:199567/149‑1 (MQ=255) aTGTTGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCACCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGAc > 4:180254/1‑149 (MQ=255) aTGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGAc < 5:146559/149‑1 (MQ=255) | GTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGAC > NC_002947/4964465‑4964757 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |