Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 342,201 | G→A | 6.1% | V240I (GTA→ATA) | gabP‑I → | gamma‑aminobutyrate permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 342,201 | 0 | G | A | 6.1% | 193.2 / 2.0 | 66 | V240I (GTA→ATA) | gabP‑I | gamma‑aminobutyrate permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/28); new base A (2/2); total (36/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 |
AGGGCTTCATGCCCAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAGCTGATCGTCGA > NC_002947/342058‑342349 | aGGGCTTCATGCCCAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTaa < 5:170626/147‑1 (MQ=255) aGGGCTTCATGCCCAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGACGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCCGCCGGGCCACCAACTCGGTaa > 6:170626/1‑147 (MQ=255) gggCTTCATGCCCAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACACGGGCAAGCAGATCAGACGTGCAACCAACTCGGTAATCt > 2:321361/1‑149 (MQ=255) cTTCATGCCCAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGc < 3:92017/149‑1 (MQ=255) attCATGCCCAACTGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCTTGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGc < 1:321361/148‑1 (MQ=255) cATGCCCAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTa > 4:230330/1‑149 (MQ=255) ccAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGc > 3:162132/1‑149 (MQ=255) cAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGcc > 4:177191/1‑149 (MQ=255) aCGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCt > 4:130525/1‑144 (MQ=255) aCGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCt < 3:130525/144‑1 (MQ=255) gCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGATAATCTGGCGTATCTGCCTGTTc > 7:314185/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTa > 5:255073/1‑149 (MQ=255) gggCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCt > 8:96362/1‑141 (MQ=255) gggCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCt < 7:96362/141‑1 (MQ=255) gggCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTAcc > 6:119243/1‑149 (MQ=255) cgcgGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTgg > 4:166211/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATc > 4:263782/1‑148 (MQ=255) ggCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAAATCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCt > 4:201001/1‑149 (MQ=255) gCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTgg > 4:81849/1‑139 (MQ=255) gCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTgg < 3:81849/139‑1 (MQ=255) ccATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGATAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTg < 8:314185/149‑1 (MQ=255) aTGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTg < 2:221389/132‑1 (MQ=255) aTGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTg > 1:221389/1‑132 (MQ=255) caccaTGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGATAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGccc > 8:286294/1‑149 (MQ=255) ccaTGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGCTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTTGCACTg > 8:166701/1‑149 (MQ=255) ctcGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCg < 6:255073/148‑1 (MQ=255) ctcGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGt > 8:99869/1‑149 (MQ=255) gTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCg > 7:18728/1‑149 (MQ=255) tACCCAAATCGTCCCCCTCGCCGCTGCCTAGTCGAAGGACCCTGGCAAGCAGAGCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCgg < 8:281113/149‑1 (MQ=255) aaaTCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTTGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTg < 4:162132/149‑1 (MQ=255) aaTCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTCTGTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTg < 1:40496/149‑1 (MQ=255) aTCGTCCCCATCGCCGCTGCCGAGAGGAAGGACCGGTGCTAGCAGATCACCCGTGCCACCAACTAGGTAATCTGGCGTAGCTGCCTGTTCTACCTGGTCTCGTTCTTGCTGGTC‑GTGGCCGTGGTGGCGTGGAACGACCCGGCCCTGGc < 3:74883/149‑1 (MQ=255) aTCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGc < 3:166211/149‑1 (MQ=255) gTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGcc > 1:318468/1‑147 (MQ=255) tCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGcc > 3:158799/1‑146 (MQ=255) aCCATCGCCGCTGCCGAGTCTAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGATAATCTGGCGGATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGAc < 7:286294/149‑1 (MQ=255) ccATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACg > 6:320825/1‑149 (MQ=255) ccATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACACGGGCAAGCAGATAAGCCCTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCATCCTGGTC‑GTGGCCCTCCTGCCCTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACg > 8:13156/1‑149 (MQ=255) cATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACgg < 7:99869/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACggg < 4:288739/149‑1 (MQ=255) gccgcTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTc < 8:18728/149‑1 (MQ=255) gcTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTa < 5:119243/149‑1 (MQ=255) ccGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGcc < 4:35416/109‑1 (MQ=255) ccGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGcc > 3:35416/1‑109 (MQ=255) aGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGAcc > 8:70264/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGATCCTACCAGACCGt > 7:128888/1‑149 (MQ=255) gAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGc > 4:322022/1‑149 (MQ=255) aaGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTAGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGc < 2:260638/148‑1 (MQ=255) aaGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTAGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGc > 1:260638/1‑148 (MQ=255) ggACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGa < 7:13156/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGc < 4:158799/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGc < 3:201001/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGc < 3:230330/149‑1 (MQ=255) ccGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCg > 3:3940/1‑149 (MQ=255) aaGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCgg < 8:128888/149‑1 (MQ=255) aaGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCgg > 2:98073/1‑149 (MQ=255) aGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGtgtg > 4:101107/1‑149 (MQ=255) cAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGCTGTGCCg > 7:141069/1‑148 (MQ=255) ccGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGcc < 6:215294/131‑1 (MQ=255) ccGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGcc > 5:215294/1‑131 (MQ=255) gTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGgtgt > 3:164914/1‑139 (MQ=255) gTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGgtgt < 4:164914/139‑1 (MQ=255) ccaccaACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAg < 3:101107/149‑1 (MQ=255) caccaACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAGc < 4:164862/149‑1 (MQ=255) aaCTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAGCTGAt > 5:254464/1‑149 (MQ=255) cTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAGCTGAtcg > 7:76196/1‑149 (MQ=255) ggTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAGCTGAtcgtc < 2:175191/148‑1 (MQ=255) ggTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAGCTGAtcgt < 3:237613/147‑1 (MQ=255) gTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAGCTGATCGTCGa > 8:126719/1‑149 (MQ=255) | AGGGCTTCATGCCCAACGGCCTGGGCGCGGTGCTGGCAGCCATGCTGACCACCATGTTCTCGTTCATGGGTACCGAAATCGTCACCATCGCCGCTGCCGAGTCGAAGGACCCGGGCAAGCAGATCAGCCGTGCCACCAACTCGGTAATCTGGCGTATCTGCCTGTTCTACCTGGTATCGATCTTCCTGGTC‑GTGGCCCTGGTGCCGTGGAACGACCCGGCCCTGGCCGAGACGGGCTCCTACCAGACCGTGCTGAGCCGTATCGGTGTGCCGAATGCCAAGCTGATCGTCGA > NC_002947/342058‑342349 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |