| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,244,248 | G→C | 5.7% | R78R (CGC→CGG) | hmgA ← | homogentisate 1,2‑dioxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,244,248 | 0 | G | C | 5.7% | 230.1 / 3.6 | 70 | R78R (CGC→CGG) | hmgA | homogentisate 1,2‑dioxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/39); new base C (2/2); total (29/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 | |||||||||||
CCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGAGTTCTGCCCAACA > NC_002947/5244103‑5244395 | ccGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAATCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGCCTGGCGCGCCAGccgc > 2:192349/1‑149 (MQ=255) ggTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAATCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGCCTGGCGCGCCAGCCGCTc < 1:192349/149‑1 (MQ=255) cGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTAGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGt < 3:51236/148‑1 (MQ=255) gCTCCGTCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTgg < 4:31378/149‑1 (MQ=255) gCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTgg < 5:299825/149‑1 (MQ=255) tCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGt > 7:211692/1‑149 (MQ=255) gaaggTTGGCTGCCCATGGCTGCCATCCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGgcgc < 8:137249/130‑1 (MQ=255) gaaggTTGGCTGCCCATGGCTGCCATCCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGgcgc > 7:137249/5‑134 (MQ=255) cGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGaa < 6:123167/139‑1 (MQ=255) cGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGaa > 5:123167/1‑139 (MQ=255) cGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTg < 6:180287/148‑1 (MQ=255) gCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCaa < 8:17300/149‑1 (MQ=255) gCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCaa < 3:154569/149‑1 (MQ=255) gTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAgg > 7:254683/1‑149 (MQ=255) ggCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAgg > 3:96216/1‑146 (MQ=255) cAGCCATGGGCAGGCAACCTTCGATGAAATCGGTGGGTTCAGCAGGAATCGGGTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGGGACCCTGTGGCCGGCGGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGTAGaa < 8:82515/149‑1 (MQ=255) ccATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAgg < 6:318073/141‑1 (MQ=255) ccATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAgg > 5:318073/1‑141 (MQ=255) cATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGc < 1:49739/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCTGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGaa < 8:254683/148‑1 (MQ=255) ggCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAAt < 5:263718/149‑1 (MQ=255) aGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCg < 8:227374/149‑1 (MQ=255) aaCCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTa > 6:332000/1‑148 (MQ=255) cTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGAGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGc > 6:192510/1‑149 (MQ=255) aTGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAgg > 6:82148/1‑148 (MQ=255) aaaTCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCCGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACg > 6:14849/1‑149 (MQ=255) tcggtcggTTCCGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGgcg < 5:88879/149‑1 (MQ=255) gtTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCa < 2:331650/144‑1 (MQ=255) gtTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCa > 1:331650/1‑144 (MQ=255) cagcagGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCt < 5:332000/148‑1 (MQ=255) cgcagGCTTCGGCTGCGGGCTCCCGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGc < 8:211692/148‑1 (MQ=255) gcagGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAgg > 2:95339/1‑103 (MQ=255) aaTCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCa < 5:341639/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATg < 6:134020/149‑1 (MQ=255) ggCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATgg < 4:96216/148‑1 (MQ=255) ggCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGt < 2:212315/149‑1 (MQ=255) gCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGt > 2:202850/1‑148 (MQ=255) gggCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGc > 2:14644/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGt < 5:174659/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTg > 5:59918/1‑149 (MQ=255) cAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATg < 1:201605/96‑1 (MQ=255) cAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATg > 2:201605/1‑96 (MQ=255) cAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGcc > 8:69642/1‑149 (MQ=255) aGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGccc < 7:208457/149‑1 (MQ=255) gcAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGAc < 6:59918/149‑1 (MQ=255) aGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGAcag > 3:328859/1‑149 (MQ=255) ggTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACagcagc < 5:14849/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGTTGATGCCAGCCAGTGGCCGGCCGTGCGGCTGGGGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGGAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCTTGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCt < 4:15392/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCt > 5:336690/1‑149 (MQ=255) ttGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGTGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTc > 4:161508/1‑149 (MQ=255) gggTGGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGc < 5:342808/149‑1 (MQ=255) ggTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCa > 3:178696/1‑149 (MQ=255) ggTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCa > 3:48925/1‑149 (MQ=255) ggTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCa > 4:75721/1‑149 (MQ=255) aTGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAg > 3:263393/1‑149 (MQ=255) cACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCa > 1:214320/1‑149 (MQ=255) aGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACgg < 5:157710/149‑1 (MQ=255) gCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGcc > 4:201312/1‑149 (MQ=255) ttcgAGCGCCTGGCGCGCCAGCCGCTCGGAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCt > 2:22386/3‑149 (MQ=255) ggAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGTAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCGCGCTGCGGGCCATTGTGAACGCCGTGCCAGACATCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGc < 5:192510/148‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGAcagc > 7:134974/1‑112 (MQ=255) cGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGAcagc < 8:134974/112‑1 (MQ=255) ggCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGa < 1:14644/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGa < 4:154260/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGTGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGAGtt < 3:161508/147‑1 (MQ=255) gcgcgcCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGt < 7:189025/96‑1 (MQ=255) gcgcgcCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGt > 8:189025/1‑96 (MQ=255) gcgcgcCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGAGTTCt < 4:263393/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGAGTTCTGc < 5:82148/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGCCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCgg > 5:63646/1‑139 (MQ=255) gcgcCAGCCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCgg < 6:63646/139‑1 (MQ=255) cgcCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGAGTTCTGcc < 4:328859/149‑1 (MQ=255) gcCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGAGTTCTGccc < 4:178696/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGAGTTCTGCCCAACa < 4:48925/149‑1 (MQ=255) | CCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGCGAATGCGGTACAGCCAGGTACGGCGCAGCTCGCTGCGGGCCATGGTGAACGCCGTGCCCGACAGCAGCTCGGCATACAGGCCATACGGGGCCTTCTGCGGGGAGTTCTGCCCAACA > NC_002947/5244103‑5244395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |