Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,293,725 | T→C | 5.4% | D221G (GAT→GGT) | mmsA‑II ← | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,293,725 | 0 | T | C | 5.4% | 219.8 / 2.2 | 74 | D221G (GAT→GGT) | mmsA‑II | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/36); new base C (2/2); total (36/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.73e-01 |
ATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCATGGGG > NC_002947/5293577‑5293874 | aTCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAACCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCAt > 5:271266/1‑149 (MQ=255) tCATGCAGCACCACCGCGTTGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATc < 3:248505/149‑1 (MQ=255) cagcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATccacca > 2:225678/1‑149 (MQ=255) cagcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGGACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGATGCCATTTGCACccacca < 5:235003/149‑1 (MQ=255) cagcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGATGGCCAAGCTGGCGGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCATTAGAGCCCACGAAGTAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGATGCCATTTGCACccacca < 5:235005/149‑1 (MQ=255) agcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCcaccac < 6:79460/149‑1 (MQ=255) gcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCaccacc > 2:206587/1‑149 (MQ=255) accaccGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATccac < 5:311924/143‑1 (MQ=255) accaccGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATccac > 6:311924/1‑143 (MQ=255) accGCGTGGTTCGTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCtt < 7:232137/149‑1 (MQ=255) cgcgTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGACGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTgc < 7:274054/149‑1 (MQ=255) gTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTgccgc > 3:313494/1‑149 (MQ=255) gTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCGCACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGt > 4:262756/1‑149 (MQ=255) gTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGccgccg < 5:37562/148‑1 (MQ=255) ggCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcacca > 2:217217/1‑149 (MQ=255) ggCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGca < 6:271266/146‑1 (MQ=255) cccccATCATTTACTTCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcaccac < 3:298995/148‑1 (MQ=255) cccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGtt > 2:21195/1‑149 (MQ=255) cccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGtt < 1:10734/149‑1 (MQ=255) ccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGAGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGtt < 1:79655/149‑1 (MQ=255) ccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTc < 5:28563/149‑1 (MQ=255) catcatTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTCCa < 1:21195/149‑1 (MQ=255) tcatTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGc < 6:46452/149‑1 (MQ=255) ttGACTGCCCACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCAACGAAGGAAATCGCCTTCATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCATCCCGCCCAGCACCACGATCAGCACg > 8:254435/1‑149 (MQ=255) gCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACgccggcc > 8:115991/1‑149 (MQ=255) cGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTAc < 1:206587/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCGGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCtt > 5:294294/1‑149 (MQ=255) tggctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAg > 3:307275/1‑149 (MQ=255) gctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAgcg > 6:176725/1‑149 (MQ=255) ctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAgcgc < 4:307275/149‑1 (MQ=255) ctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAgcgc > 8:83101/1‑149 (MQ=255) gCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAgcgc > 6:75825/1‑147 (MQ=255) tGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGAc > 4:314870/1‑148 (MQ=255) gTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATACACCACCTGCTTGCAGCCGTGCACCACGTTAAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGAc > 7:265979/1‑147 (MQ=255) tAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAg < 6:294294/149‑1 (MQ=255) aaaCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCAACACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAg > 4:58/1‑148 (MQ=255) aaCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAg > 2:270413/1‑147 (MQ=255) aaCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGaa < 1:270413/149‑1 (MQ=255) gTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGt < 4:313494/149‑1 (MQ=255) ccGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGa > 5:218265/1‑149 (MQ=255) aCTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAg > 4:46129/1‑149 (MQ=255) cTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGc < 3:250449/149‑1 (MQ=255) aGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGAt > 2:224310/1‑149 (MQ=255) aGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGAt < 6:136601/149‑1 (MQ=255) agCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGc < 7:83101/149‑1 (MQ=255) cACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCg > 6:40343/1‑148 (MQ=255) cACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCg > 8:317399/1‑148 (MQ=255) aCGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGa < 3:46129/149‑1 (MQ=255) gAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGttt < 7:115991/149‑1 (MQ=255) aaaTCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGttt > 7:66232/1‑148 (MQ=255) aaaTCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTg < 5:75825/149‑1 (MQ=255) aaTCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa < 1:291991/149‑1 (MQ=255) aaTCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa < 6:218265/149‑1 (MQ=255) aaTCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa < 3:262756/149‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGCCAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCAc > 7:305829/1‑148 (MQ=255) gATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAgg > 4:16249/1‑149 (MQ=255) tGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa < 4:22445/138‑1 (MQ=255) tGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGgtg > 5:273059/1‑149 (MQ=255) tGTACTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa > 3:22445/1‑138 (MQ=255) ggtg‑gtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTg > 4:194781/3‑149 (MQ=255) gtg‑gtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGc > 5:238455/2‑149 (MQ=255) tg‑gtggGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTc < 2:287152/122‑1 (MQ=255) tg‑gtggGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGcc > 6:201213/1‑149 (MQ=255) g‑gtgggtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCg > 3:265516/1‑149 (MQ=255) gtgggtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGcc < 8:66232/147‑1 (MQ=255) gtgggtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCg < 1:217217/148‑1 (MQ=255) tgggtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCg > 5:323565/1‑147 (MQ=255) gtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGAc < 3:16249/149‑1 (MQ=255) tgCAAATGGTATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGgtgt > 6:48136/1‑138 (MQ=255) tgCAAATGGTATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGgtgt < 5:48136/138‑1 (MQ=255) aaaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATg > 2:168614/1‑149 (MQ=255) aaaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATg < 5:176725/149‑1 (MQ=255) aTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGc < 5:40343/149‑1 (MQ=255) cATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCACCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCATg > 6:47476/1‑149 (MQ=255) aTCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCATgg < 1:168614/149‑1 (MQ=255) tCCACCACCTGCTTGGCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCATAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCATggg < 7:297315/149‑1 (MQ=255) tCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCATCACTCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGTAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTGGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTTCCGCAGACGATGGCCATggg < 7:254435/149‑1 (MQ=255) tCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCATggg > 8:36631/1‑149 (MQ=255) tCCACAACCTGCTTCCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCTCCTTCCAGCGCCAGCTCCACCACAAGCAT‑GTCGACAGCGGATCCTGCTCGCATGCTTTGAGCACGAAGGAGTAGCCGCAGACGATGGCCAAgggc > 2:316561/1‑148 (MQ=255) | ATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTG‑GTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCATGGGG > NC_002947/5293577‑5293874 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |