| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,319,174 | T→A | 8.3% | K67M (AAG→ATG) ‡ | ilvI ← | acetohydroxybutanoate synthase/acetolactate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,319,174 | 0 | T | A | 8.3% | 205.6 / 6.7 | 72 | K67M (AAG→ATG) ‡ | ilvI | acetohydroxybutanoate synthase/acetolactate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/27); new base A (3/3); total (42/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTCCTGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGCTTAACGCC > NC_002947/5319029‑5319322 | ttCCTGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCtt > 5:159515/1‑147 (MQ=255)ttCCTGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCtt < 6:159515/147‑1 (MQ=255) tGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGt > 8:55369/1‑149 (MQ=255) tGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGt > 4:113814/1‑149 (MQ=255) aaGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGgc < 2:16586/149‑1 (MQ=255) aaGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCAAGGCCGGTgtg < 3:271699/149‑3 (MQ=255) aTCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAg > 1:25458/1‑149 (MQ=255) tCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGc < 8:98668/149‑1 (MQ=255) gTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGt > 7:30896/1‑148 (MQ=255) gTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGt < 8:30896/148‑1 (MQ=255) accaTGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTc < 2:25458/149‑1 (MQ=255) caaggTGCTAGGCACCAGGCCTGACACGATGACCATCGGAATCGAGTACATGAAAGCGCTGCCAATAACGGTAATCGCAATGCTCGAGCCAGGACCGGAGGTAACAACCACCACACCCCCCTTGCAGGAGGCGCTAGc > 8:182787/4‑138 (MQ=255) caTGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGc < 7:182787/138‑1 (MQ=255) caTGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCg > 3:217903/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGc < 4:217903/149‑1 (MQ=255) cTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCatat < 6:84663/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCg > 7:235927/1‑124 (MQ=255) cTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCg < 8:235927/124‑1 (MQ=255) tGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGGCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGgccgc > 1:53646/1‑149 (MQ=255) aCAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCg < 5:148370/149‑1 (MQ=255) ggATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGt < 1:124776/147‑1 (MQ=255) ggATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGt > 2:124776/1‑147 (MQ=255) ccATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAAc > 6:104533/1‑148 (MQ=255) ggAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGa < 3:113814/148‑1 (MQ=255) tCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATgtgt > 2:149708/1‑149 (MQ=255) gAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCt < 7:285144/127‑1 (MQ=255) gAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCt > 8:285144/1‑127 (MQ=255) aGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCACAACCACACCGGCATTGGCGGAGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATgg > 8:138760/1‑113 (MQ=255) gTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTccc > 3:209951/1‑148 (MQ=255) gTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCa > 7:14936/1‑149 (MQ=255) gTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCa < 7:55369/149‑1 (MQ=255) aTGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTc > 2:170211/1‑149 (MQ=255) aTGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTc > 5:159091/1‑149 (MQ=255) gTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCg > 5:119792/1‑149 (MQ=255) tAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCg < 5:46190/148‑1 (MQ=255) ggCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGt < 7:99888/148‑1 (MQ=255) gCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGAt < 4:65589/131‑1 (MQ=255) gCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGAt > 3:65589/1‑131 (MQ=255) cGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCt < 3:59404/149‑1 (MQ=255) ggTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCtt > 1:197719/1‑149 (MQ=255) ggCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTg > 4:316175/1‑148 (MQ=255) aaaaCCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGAGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGaa > 5:301221/4‑147 (MQ=255) aaTACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAg > 6:230056/1‑79 (MQ=255) aaTACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAg < 5:230056/79‑1 (MQ=255) aaTACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGaa > 8:283929/1‑147 (MQ=255) tACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCAGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGt > 8:297323/1‑149 (MQ=255) gTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGgcc < 4:232066/93‑1 (MQ=255) gTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGgcc > 3:232066/1‑93 (MQ=255) tGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTa > 4:289641/1‑148 (MQ=255) gCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGAAGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTaaa > 7:284004/1‑148 (MQ=255) cATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAAc < 1:142533/134‑1 (MQ=255) cATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAAc > 2:142533/1‑134 (MQ=255) gcgcCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGga < 6:301221/148‑1 (MQ=255) cgcCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGgaga < 5:104533/149‑1 (MQ=255) gAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGt < 6:5125/105‑1 (MQ=255) gAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGt > 5:5125/1‑105 (MQ=255) gTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTa > 8:273212/1‑149 (MQ=255) aCCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACAAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTAccc > 1:12056/1‑149 (MQ=255) cAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCg > 4:225753/1‑148 (MQ=255) aGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCg > 7:93832/1‑147 (MQ=255) tcgcgccacCGGCAAGGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCg > 1:45720/7‑146 (MQ=255) gCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAg < 7:283929/149‑1 (MQ=255) cgcgccacCGGCAAGGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGa < 2:45720/144‑1 (MQ=255) caccacACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCg > 3:68923/1‑145 (MQ=255) accacACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGAt > 1:94793/1‑149 (MQ=255) accacACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGAt > 5:75003/1‑149 (MQ=255) gccacCGGCAAGGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGAtgt < 7:63477/147‑1 (MQ=255) gccacCGGCAAGGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGAtgt > 8:63477/3‑149 (MQ=255) gccacCGGCAAGGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGAtgt > 7:154741/3‑149 (MQ=255) cacaCCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGAtgt < 7:297323/149‑1 (MQ=255) cacCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGaa < 6:235748/97‑1 (MQ=255) cacCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGaa > 5:235748/1‑97 (MQ=255) cacCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGc > 6:245310/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGCTTAACGc < 3:225753/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCTTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGATCAGTGCGTCGTAACCATGCAGGAGCGCACCACCAGGGTACGCTTAGATGTGCTTAACGcc > 8:157009/1‑149 (MQ=255) | TTCCTGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGCTTAACGCC > NC_002947/5319029‑5319322 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |