Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,964,546 | C→A | G271V (GGT→GTT) | fleQ ← | transcriptional regulator FleQ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,964,546 | 0 | C | A | 100.0% | 57.1 / NA | 20 | G271V (GGT→GTT) | fleQ | transcriptional regulator FleQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (10/10); total (10/10) |
CGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGT > NC_002947/4964405‑4964688 | cGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCAc < 5:70887/146‑1 (MQ=255) tAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACTGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTg < 4:89326/148‑1 (MQ=255) ggAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTgca > 5:160959/1‑147 (MQ=255) ggAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTgca < 5:30932/147‑1 (MQ=255) gtccAGGCGGTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCacac > 4:50690/4‑146 (MQ=255) ggTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCtt < 2:150089/148‑1 (MQ=255) ggTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCt > 8:5020/1‑147 (MQ=255) aGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGc < 7:55293/147‑1 (MQ=255) aGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCa > 6:103526/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCgg > 3:83526/1‑147 (MQ=255) gcgGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCaa < 2:80933/147‑1 (MQ=255) gAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGc < 7:25344/148‑1 (MQ=255) aTCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtcgt < 5:103526/148‑1 (MQ=255) aTCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtcg < 4:83526/147‑1 (MQ=255) ggTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGCCCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGt > 8:89665/1‑148 (MQ=255) tCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTAcc > 7:110837/1‑148 (MQ=255) gcACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGccc < 2:162635/148‑1 (MQ=255) gTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCa > 5:40798/1‑148 (MQ=255) tCTTGTTGCTAACCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGCTGGc > 4:12551/1‑148 (MQ=255) cTAACCACGCGCTCGAACGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATCTCGCCGATTTCGTCCAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCCGCACGGCTGGAGATGGCCCCgga > 2:183083/1‑145 (MQ=38) | CGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGT > NC_002947/4964405‑4964688 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |