| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,674,751 | +G | intergenic (+113/+27) | rhlE‑II → / ← yceI | ATP‑dependent RNA helicase/polyisoprene‑binding acidic stress response factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,674,750 | 1 | . | G | 97.1% | 230.5 / ‑0.4 | 69 | intergenic (+112/+28) | rhlE‑II/yceI | ATP‑dependent RNA helicase/polyisoprene‑binding acidic stress response factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); new base G (38/29); total (40/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGC‑G‑CG‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGC > NC_002947/5674604‑5674890 | gTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAgc‑gg < 7:38596/149‑2 (MQ=255) gAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAgc‑ggc > 5:209565/1‑146 (MQ=255) ccGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTgg > 2:33093/1‑147 (MQ=255) ccGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCACAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGAGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGC‑G‑GGCCCCTCGGTTTTCAGATg > 5:46857/1‑146 (MQ=37) gCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCGCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTAc < 4:84688/149‑1 (MQ=255) aTAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACtt < 7:106430/147‑1 (MQ=255) aTAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTc < 8:182799/148‑1 (MQ=255) aTAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCt > 2:165666/1‑149 (MQ=255) aTAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCt < 3:185499/149‑1 (MQ=255) gAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGc < 1:194613/148‑1 (MQ=255) aaGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCtt < 7:197266/149‑1 (MQ=255) tACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTATTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTcac < 1:33093/149‑1 (MQ=255) ccGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCacac > 2:12539/1‑149 (MQ=255) ctTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGa > 8:136376/1‑149 (MQ=255) ctTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGa > 3:274970/1‑149 (MQ=255) aGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtcc < 4:243470/148‑1 (MQ=255) aGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtcc > 3:243470/1‑148 (MQ=255) aTCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtccaggtc > 3:316316/1‑147 (MQ=255) tCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtccaggtccag < 8:286782/149‑1 (MQ=255) cGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGt > 3:30836/1‑149 (MQ=255) aaGGACGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATCGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCGTCGGTTTTGAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACATTCGACACTGATATACAGGTCGAGGGTCttgg > 3:5957/1‑145 (MQ=37) cGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑Ag < 1:12539/149‑1 (MQ=255) gCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGc > 7:280985/1‑149 (MQ=255) gCTCCTGCACAGAATTTCTTGATCACTACAGGAGCCGCCTTGTGTCGTGATAGCGACGCAAAGCGG‑CC‑CCCACGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTCCTTCACACCAACGACACTGATATCCAGTTCCACGGTCTGCGAAGT‑Ag > 2:94559/1‑148 (MQ=255) tGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCAc < 6:375155/146‑1 (MQ=255) gCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCgg > 2:92642/1‑149 (MQ=255) cAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCgg < 7:136376/148‑1 (MQ=255) agagAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGc > 4:251847/1‑149 (MQ=255) agaATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACATCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑Ag < 4:57038/138‑1 (MQ=255) agaATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACATCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑Ag > 3:57038/1‑138 (MQ=255) tttCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGa < 4:316316/149‑1 (MQ=255) tttCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGa > 1:166015/1‑149 (MQ=255) tttCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGa > 3:194541/1‑149 (MQ=255) cTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCttt < 8:307170/144‑1 (MQ=255) cTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCttt > 7:307170/1‑144 (MQ=255) ttGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGc > 6:233407/1‑148 (MQ=255) aTCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCg > 2:87703/1‑147 (MQ=255) ctACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTc > 5:240035/1‑148 (MQ=255) tACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAg < 1:165666/145‑1 (MQ=255) aCAGGCGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAg < 6:209565/144‑1 (MQ=255) aCAGGAGCGGCCTTGTGTAGTGATAGGGCCGCAAAGC‑GTCA‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTACACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTATGCGAAGT‑ATCAAACTGGCCATTGATTCAGAAGTCgt > 4:293883/1‑148 (MQ=255) cAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCg > 4:59270/1‑86 (MQ=37) cAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCg < 3:59270/86‑1 (MQ=37) cAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCgtt > 3:358001/1‑148 (MQ=255) cAGGAGCAGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCgtt < 3:42047/148‑1 (MQ=255) cccaGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCgttc < 5:78512/145‑1 (MQ=255) gAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCCGTTTTCACCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGCGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGACCTTTCATGCAGAAGTCgttcagg > 8:197612/1‑149 (MQ=255) gCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCgtt > 5:377501/1‑140 (MQ=255) ccTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCgttc < 6:377501/140‑1 (MQ=255) tCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCgtggtgg > 2:58837/1‑149 (MQ=255) tCGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCgtggtg < 4:194541/148‑1 (MQ=255) cGTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCgtggtggt > 7:119786/1‑149 (MQ=255) gTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCgtggtggt < 1:87703/149‑1 (MQ=255) gTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCgtggtggtg > 4:383261/1‑149 (MQ=255) gTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCgtggtggtg > 2:66446/1‑149 (MQ=255) gTGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCgtggtggtg > 2:148023/1‑149 (MQ=255) tGATAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGtggtggtgg > 3:348770/1‑149 (MQ=255) aTAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGc < 4:274970/148‑1 (MQ=255) tAGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGTTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTTATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGc < 6:46857/147‑1 (MQ=255) aGGGCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGACGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGtt > 8:355929/1‑149 (MQ=255) gggCCGCAAAGCGG‑CC‑GGCTCGTTTTTCAGCTGGCATAAATTACTTCTGCTTCACACCTTGGACAGTGATATCGAGGTCCAGGGTCTGCGATGT‑AGCTCCCGGGCGTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCTGCGTGGTGGTGGCGTTg < 1:94559/149‑1 (MQ=255) gggCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACCCCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTg > 8:60826/1‑149 (MQ=255) ggCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTg > 7:332121/1‑148 (MQ=255) ggCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTg > 7:222862/1‑148 (MQ=255) ggCCGCAAAGCGG‑CC‑ACCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTCCTTCACCCATTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTTATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTg > 2:142554/1‑148 (MQ=255) gCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGaa < 1:229343/149‑1 (MQ=255) gCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGaa < 4:358001/149‑1 (MQ=255) gCCGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGaa < 4:348770/149‑1 (MQ=255) ccGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAg > 3:269969/1‑149 (MQ=255) ccGCAAAGCGG‑CC‑CCCTCGCATTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCAAGGGTCTGCGAAGT‑AGCAACCGGCCCTTTGATGCCGAAGACGTGCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAg > 2:61742/1‑149 (MQ=255) cAAAGCGG‑CC‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGc > 4:192199/1‑147 (MQ=255) | GTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGC‑G‑CG‑CCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGT‑AGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGC > NC_002947/5674604‑5674890 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |