| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,196,220 | C→T | H366H (CAC→CAT) | icd → | isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,196,220 | 0 | C | T | 95.8% | 132.6 / NA | 48 | H366H (CAC→CAT) | icd | isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (13/33); minor base A (2/0); total (15/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.31e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAACCCGAACACTGGCAAAGAGATCGTCATTAAAGACGTGATTGCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCA > NC_000913/1195922‑1196448 | aagaCCCGAACACTGGGAAAGAGTTCTGAAGTGAAGAGGTGATTGCTGATGCATTCCTGGTACAGGTCCTGCTGCGTCCGGCTGAAGAGGAGGTTATCGCCTGGATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCGGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCatat < 1:17208/298‑1 (MQ=255) cccGAACACTGGCAAAGAGATCGTCATTAAAGACGTGATTGCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCCCCCACGGTACTCCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAACGTCAATCCTGGCCCTATTATTCTCTCCGTTTGAG‑TGGTGCTGCGCCAACTGGGt > 1:762962/1‑301 (MQ=255) ccGAACACTAGCAAAGAGATCGTCATTAAAGACGTGATTGCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGtt < 2:34774/301‑1 (MQ=255) acacTTGCAAAGAGTGCGTCATTAAAGACGTGATTGCTGCTGCATTCCTGCAACAGATCCTGCGGCGTCCGGCTGAATATGAGGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTTTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGAc < 2:808308/301‑1 (MQ=255) gagaTCGTCATTAAAGACGTGATTGCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGCAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTTAGGACAAAGTAAATCCTGGCCCTATTCTTCTCTCCG‑CTGAGATGATTCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAgggg > 2:837436/1‑298 (MQ=255) cctgagtgcgcaTGCATTCCTGCAACTGATCCTGCTGCGTCCGGCCTAATATCATGGTATGTCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATCTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGt < 2:84058/290‑1 (MQ=255) cGTGATTGCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGt < 2:778840/301‑1 (MQ=255) cGTGATTGCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGACGTTATCGCCTGTATTAACCTGAACGGTGACTACATGTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCTCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATTCGCCCTGTTTGATGCCACCCTCGGCACTGCGCCGAAATATCCCGGTCAGGTCAAAGTAAATCCTGGCTCTTTTGTTCTCTCCG‑CTGTGAGTTTGCTTCCCCAAATGGGTCGGACTGAAGCGGCTGAccgtacttggaaaggg > 1:456994/1‑286 (MQ=255) tGCTGATTCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCGGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGaa < 1:137669/301‑1 (MQ=255) tGCTGATGCATTCCTGCAACAGCTCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATTATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGaa < 2:457007/301‑1 (MQ=255) gCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGCCCAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCCCCATATGGGGTGGACTTAAGCGGCTGCCCTGATTGGTAAAGGTATgggaa > 1:349742/1‑298 (MQ=255) gCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCTCCATATGGGGTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGGTAAAGGTATGGaaa > 1:305948/1‑300 (MQ=255) aTGCATTCCTGCAACAGGTCCTGGTTCGTCCGGCTGAATATGATGTGATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcgc < 2:433962/301‑1 (MQ=255) aTGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGAATGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcg > 2:874912/1‑300 (MQ=255) cTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCaatg > 2:396414/1‑299 (MQ=255) tgagccgggggtgtcacgCTGAATATGAGGGTATGGCCTGTATGAACCTGCACGGTGAATACATTTCTGAAAGCC‑GGCACGGGCAGGTTGGGGGGAACGGTTTCGCCCCTGGTGCAAAAATCGGTGACGAATGCGCCCTGATTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAGATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAGAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGAc < 1:270277/284‑1 (MQ=25) aTCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTTCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCg > 2:687194/1‑301 (MQ=255) gctgcGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAAc < 2:57109/300‑1 (MQ=255) ttgcGTCCGGCTGAATATGATGTTTACGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCG‑GGGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTTCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAActt < 1:687168/300‑3 (MQ=38) atgTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGGCTgat > 2:103098/1‑301 (MQ=255) tgtgctCGCCAGTATGACGCTGAACGGTTGTCACATGTCGGACGACCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGGATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAAAATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTgatg < 1:291961/296‑1 (MQ=25) tgTTTTAGCCCGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTGCTTACGCCCGGGCA‑GCGCAGGGTGGCGGGATCGGGAGCGCCCCTGGTTCAAACATCGGTGACGAAGTCGCCCTGTTTGAAGACACCCCCGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTAGTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTgatg < 1:730673/301‑1 (MQ=25) gTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGCTGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAACGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACGTATGACGTcagacttttgatgg > 1:845976/1‑288 (MQ=38) ttATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTgatgg < 2:297141/300‑1 (MQ=255) ttATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCGGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTgatgg < 2:196608/300‑1 (MQ=255) gCCTGTATGAACCTGAACGGTAACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGCGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGCTGTTGCTGCGCCATATGGGTTGGTCTGCAGCGGCTGACCTGCTTGTTAAAGGTAGGGAACGCGCAATCAATGACACGCCCGTAACTTATGACTTCGCACGCCTGAGGGAAGgcg > 2:99320/1‑301 (MQ=255) gTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTaa > 2:361161/1‑301 (MQ=255) tcaacactaaccggtggtcacgtttCGGACGCCCTGGCA‑GCGGAGGTTGGCGGTACTGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCGCGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCtgagc < 1:78165/279‑5 (MQ=21) aTGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTaagc < 2:765321/301‑3 (MQ=37) aTGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTaagc < 2:445294/301‑3 (MQ=37) ccTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCATGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGATATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGAACGTAACTTATGAATTCGCAAGGCTGCTGGAAGGCGCTAAGccgcta > 1:743553/1‑300 (MQ=37) ttccATGTCTGACGCGCTGGCA‑GAGCAGGTTGGCGGTATCGGGATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCTAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCagag < 1:655987/298‑1 (MQ=21) aCGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGaag < 2:477317/300‑3 (MQ=25) cggtatcggtatCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtc < 2:762990/300‑2 (MQ=21) gtatcgCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTTTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtctctccatg < 2:826949/300‑10 (MQ=18) tatcgCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGACCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAAGATGCCGGGCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGAGGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtctctccatgtg < 1:396403/301‑12 (MQ=17) cccTGGTGCAAACAGCCGGGACGAATCAGCCCGTGTTGAAGCCACCCCCGTTACTGCGCCGAAATATGGCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCGGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtctctccatgtgttaaat < 1:103093/301‑18 (MQ=14) cccTGGTGAAAACATAGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAATTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtctctccatgtgttaaat < 2:806189/301‑18 (MQ=17) cccTGGGGCAAAAATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtctctccatgtgttaaat < 2:846008/301‑18 (MQ=17) aaaGCCACCCACGGTAATGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCGCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttttattt < 1:361151/300‑5 (MQ=11) cGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttttatttatgtggatatt > 2:265037/1‑286 (MQ=14) ttACTTCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttttatttatgtggatattat < 2:197130/300‑18 (MQ=14) tACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTTTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttttatttatgtggatattat < 2:349752/300‑18 (MQ=14) tcTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGCCTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttttatttatgtggatattatta < 1:265027/300‑20 (MQ=14) tGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttttatttatgtggatattattaat < 2:305958/301‑22 (MQ=14) gcgcCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtc > 2:630980/1‑229 (MQ=14) gcgcCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtc < 1:630960/230‑2 (MQ=14) gcgcCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttttatttatgtggatattattaat < 2:467450/300‑22 (MQ=14) ccGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttttatttatgtggatattattaatagc < 2:901291/300‑25 (MQ=17) | AAAACCCGAACACTGGCAAAGAGATCGTCATTAAAGACGTGATTGCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCA‑GCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCG‑CTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCA > NC_000913/1195922‑1196448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |