| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 4,547,304 | Δ2 bp :: IS186 (+) +7 bp :: Δ1 bp | coding (2209‑2215/2637 nt) | fimD → | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 74 (0.960) | 55/490 | 0.2 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4547304 = | 0 (0.000) | coding (2209/2637 nt) | fimD | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher | |||||
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TACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATGGCGTAACGCTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGC > NC_000913/4547012‑4547600 | tACTTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATGGCGTAACGCTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTAc > 1:147580‑M2/1‑299 (MQ=255) 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(MQ=255) atccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCAt > 1:636021‑M2/111‑301 (MQ=255) gcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAGAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATGAAACTGCTCATGACGCTGAc > 1:129702‑M2/101‑300 (MQ=255) cctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTg > 2:299531‑M2/100‑217 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |