Predicted mutation | ||||||
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JC | NC_000913 | 3,411,485 | Δ15 bp | coding (215‑229/297 nt) | fis → | global DNA‑binding transcriptional dual regulator |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 3411500 = | 1 (0.010) | coding (230/297 nt) | fis | global DNA‑binding transcriptional dual regulator |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
TTGGAGGCATACTTCGAAAATTTTGCGTAAACAGAAATAAAGAGCTGACAGAACTATGTTCGAACAACGCGTAAATTCTGACGTACTGACCGTTTCTACCGTTAACTCTCAGGATCAGGTAACCCAAAAACCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAA > NC_000913/3411216‑3411794 | gaacagctggaggcgttggaggcatacttcgaaaattttgcgtaaacagaaataaagtgctgacagaactatgttcgaacaacgcgtaaattctgacgtactgaccgtttctaccgttaactctcaggatcaggtaacccaaaaacccctgcgtgactcggttaaacaggcactgaagaactattttgctcaactgaatggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtgCTGCGCTGATGATggg > 1:333900‑M2/285‑300 (MQ=255) gaggcttttgatgcatactcctaaaattttgcgtaaacagaaataaagagctgacagaacgatgttcgaacaacgcgtaaattctgacgtactgaccgtttctacctttaactctcaggatcaggtaacccaaaaacccctgcgtgactcggttaaacaggcactgaagaactattttgctcaactgaatggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtgCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCg < 1:1004429‑M2/25‑1 (MQ=255) gcgttggaggcatacttcgaaaattttgcgtaaacagaaataaagagctgacagaactatgttcgaacaacgcgtaaattctgacgtactgaccgtttctaccgttaactctcaggatcaggtaacccaaaaacccctgcgtgacacggttaaacaggcactgaagaactattttgctcaactgaatggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggcggaagtagaacagcccctgtaggacatggtgatgcaatacacccgtgCTGCGCTGAGGATGGGCATCTACTGTGGt > 1:589104‑M2/273‑301 (MQ=255) cgtttgagccatacttctaaaattttgcgtaaacagaaataaagagctgacagaactatgttcgaacaacgcgtaaattctgacgtactgaccgtttctaccgttaactctcaggatcaggtaacccaaaaacccctgcgtgactcggttaaacaggcactgaagaactattttgctcaactgaatggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtgCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTa < 1:733733‑M2/30‑1 (MQ=255) ttggaggcatacttcgaaaattttgcgtaaacagaaataaagagctgacagaactatgttcgaacaacgcgtaaattctgacgtactgaccgtttctaccgttaactctcaggatcaggtaacccaaaaacccctgcgtgactcggttaaacaggcactgaagaactattttgctcaactgaatggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtgCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTAc < 1:149581‑M2/31‑1 (MQ=255) gaggcatacttcgaaaattttgcgtaaacagaaataaagagctgacagaactatgttcgaacaacgcgtaaattctgacgtactgaccgtttctaccgttaactctcaggatcaggtaacccaaaaacccctgcgtgactcggttaaacaggcactgaagaactattttgctcaactgaatggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcactacacccgtgCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACg > 1:887342‑M2/267‑298 (MQ=255) aggcatacttcgaaaattttgcgtaaacagaaataaagagctgacagaactatgttcgaacaacgcgtaaattctgacgtactgaccgtttctaccgttaactctcaggatcaggtaacccaaaaacccctgcgtgactcggttaaacaggcactgaagaactattttgctcaactgaatggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtgCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTg < 1:468789‑M2/35‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |