| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,160,733 | C→T | G20S (GGC→AGC) | sthA ← | pyridine nucleotide transhydrogenase, soluble |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,160,733 | 0 | C | T | 99.2% | 457.9 / NA | 126 | G20S (GGC→AGC) | sthA | pyridine nucleotide transhydrogenase, soluble |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (57/68); minor base A (0/1); total (57/69) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TCCCTGCAATATTTCACAGTGATTACGTTCGTAAAATCCCTGACGCATGCGCGTTTGTTGATTAATCACGTTATCGGCATGGTTAAGGATATCGGCAAAAGAAGAGCGGAGCAGTCGGGAATGGTCGCTGTAAAGTGGGTTTTGATTGAATTCTATAATGCGGCTGACGGCGTGACGGAGAGCTTTCGACGGGATGGTGCCCCAGTGGGTGCAACCGCCGCCAACATTTTGATAACGCTCGATAACTGCGACGCGCGCACCTTGCTTAACCAGGCCCATTGCAGCGCCTTCGCCGCCGGGGCCGGAACCTATTACTATGGCATCGTAATCGTAGGAATGTGGCATGGTAGGGCTTACCTGTTCTTATACATAAAAGCAACAGAATGGTAACATTTTATCGCGGGTAAGCCAATTGATCCCCGTCATTTATCTGGCTATATCCTGAGCGGCCTTTGCTTTGTCTGTTTCTTACTTTTGCCCTGACGTTTTATTGGATTTTTATCGACGATACTCTCCGTTTAAGCGGCAGGTTTCCGCTGTACGTAAAAGAACCGGCCAAAGAATTGCAGTAAATATGTTTTATTG > NC_000913/4160446‑4161030 | tCCCTGCAATATTTCACAGTGATTACGTTCGTAAAATCCCTGACGCATGCGCGTTTGTTGATTAATCACGTTATCGGCATGGTTAAGGATATCGGCAAAAGAAGAGCGGAGCAGTCGGGAATGGTCGCTGTAAAGTGGGTTTTGATTGAATTCTATAATGCGGCTGACGGCGTGACGGAGAGCTTTCGACGGGATGGTGCCCCAGTGGGTGCAACCGCCGCCAACATTTTGATAACGCTCGATAACTGCGACGCGCGCACCTTGCTTAACCAGGCCCATTGCAGCGCTTTCGCCGCCgggg > 1:465545/1‑301 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |