| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1158538 | 114 (0.760) | coding (670/1434 nt) | ptsG | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAAGCTGCCTGAGTATCTTGGCTTCTTTGCCGGTAAACGCTTTGTGCCGATCATTTCTGGCCTGGCTGCCATCTTTACTGGCGTTGTGCTGTCCTTCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAGTTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTAC > NC_000913/1158206‑1158804 | tGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGTGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAAGCTGCCTGAGTATCTTGGCTTCTTTGCCGGTAAACGCTTTGTGCCGATCATTTCTGGCCTGGCTGCCATCTTTACTGGCGTTGTGCTGTCCTTCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACAt < 2:823461/301‑1 (MQ=255) ttACTGGCTTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAAGCTGCCTGAGTATCTTGGCTTCTTTGCCGGTAAACGCTTTGTGCCGATCATTTCTGGCCTGGCTGCCATCTTTACTGGCGTTGTGCTGTCCTTCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGaa < 2:776839/300‑1 (MQ=255) ttACTGGCGTACTCGTCGGGATTATCTCCGGTGCGATCTCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAAGCTGCCTGAGTATCTTGGCTTCTTTGCCGGTAAACGCTTTGTGCCGATCATTTCTGGCCTGGCTGCCATCTTTACTGGCGTTGTGCTGTCCTTCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGaa < 2:248237/300‑1 (MQ=255) atcctagcgtaccaggtaggATTATCTCCGGTGCGATAGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAAGATGCCTGAGTATATTGGCTTCTTTGCAGGTAAACGCTTTGGGCCGATCATTGCTGGCCTGGCTGTCATCTTTACTGGCGTTGTGCTGTCCTTCATGTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCAGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCGCATCTGGaa < 2:980004/283‑1 (MQ=255) aTACTGGCGTAGTCGGAGGGATTATCTCCGATGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAAGCTGCCTGAGTATCTTGGCTTCTTTGCCGGTAAACGCTTTGTGCCGATCATTTCTGGCCTGGCTGCCATCTTTACTGGCGTTGTGCTGGCCTTCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGaa < 2:1229394/301‑1 (MQ=255) aTACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAAGCTGCCTGAGTATTTTGGCTTCTTTGCCGGTAAACGCTTTTTGCCGCTCATTTCTGGCCTGGCTGCCATCTTTACTGCCTTTGTGCTGTCCTTCATTTGGCCGCCGATCGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTTCGTTGGGAATTTACGGTTTCATCGACCGTTGCCTGGTACTGTTTGGTTTGCACGACATCTGGaa > 2:1170264/1‑301 (MQ=255) aTACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAAGCTGCCTGAGTATCTTGGCGTCTTTGCCGGTAAACGCTTTGTGCCGATCATTTCTGGCCTGGCTGCCATCTTTACTGGCGTTGTGCTGTCCTTCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGaa < 2:724982/301‑1 (MQ=255) 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gtattcaccaatctgcaTCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAGTTCTCCTTCATGTTCGtt > 2:1004473/16‑301 (MQ=255) atattcaccaatctgcaTCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTCCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTTGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCTAGCCGATCGAGCTCTCCTTCATGTTCGtt > 2:177912/16‑301 (MQ=255) tcaccaatctgcaTCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGCTTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCTAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGCAAACCGCGCGAACGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTAGTTCCTGAACGGTATCCCCGAGCCGATCGCGTTATCATTCATGTTCGTTgcg > 2:574617/12‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |