| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,936,249 | C→T | A22A (GCG→GCA) | zwf ← | glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,936,249 | 0 | C | T | 96.4% | 382.6 / NA | 112 | A22A (GCG→GCA) | zwf | glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (43/65); minor base G (1/3); total (44/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GCATGGCAAAGTAGTTAATGGTGATACGATTTTTTTGATCCAGCATCGCGCCGAGACGGCTGAATGCAGCAGTGTCATTGACATCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGGAAAAGCGCGCAAAGTGCGGCAAAACTGATAAAAAAATCATCGTTTTCCATTGGGTAAAAATCTGACACTGATCATGTTATGAAAAAA > NC_000913/1935957‑1936530 | gcATGGCAAAGTAGTTAATGGTGATACGATTGTTTTGATTCAGCATCGCGCCCAGACGGCTGAATGCAGCAGTGTCATGGACATCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGAACTCAGCGTGTCCCATAAGCCATCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCCGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGTGCAAGGt < 2:256158/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |