| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 704375 = | 87 (0.870) | 7 (0.070) | 6/482 | 9.8 | 7.6% | coding (432/1947 nt) | nagE | N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme IIC, IIB, and IIA components |
| ? | NC_000913 | 704405 = | 86 (0.880) | coding (462/1947 nt) | nagE | N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme IIC, IIB, and IIA components | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
TTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAACACCATCGCCTGGTTCCAGATTGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACA‑TTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGCACCGCGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATGATGTTCGGTCT > NC_000913/704088‑704665 | tttGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTAGTTTGTGGCGCAGCCTCTAAACTTTGGTCCTATATTAAACTGCAGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCAGCAACCGGTTTTTGCCGATTGCCCCCGGACTCTTCTTCCTGTGTCTGGGCGCCCtttttt > 2:724671/1‑300 (MQ=255) ttCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGATGGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTAc < 2:430096/301‑1 (MQ=255) cATCGGTGTGGCATCCAGCTGGGCGAAAGACAGGGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCAc < 2:466993/301‑1 (MQ=255) gtgGCATGCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAGCC‑AAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAGATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATcc < 2:663330/300‑1 (MQ=255) cATCCCGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGGTCGGCGGCGCTTGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGc < 2:695158/301‑1 (MQ=255) gTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCCGCCTATAACCGTTTGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGTGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGAGTGCCACCGGTTTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCCTTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGgcggcgcg > 2:338916/1‑299 (MQ=255) ggCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGCTATTAAACTGACGGACTTCCGGCGCTTCTTCGGCGGCCAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGGTTCTTCTTCCTTGTGCCggcggc > 1:806218/1‑216 (MQ=255) ggCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAACAGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTTACTGGTGCTggcggc > 1:715402/1‑216 (MQ=255) gTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGCCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAAACGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGAATGCCTCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCAttttt > 1:547105/1‑218 (MQ=255) gTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCCTTGTTCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTCGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGTTACAGCCCGCTATCCATTCCGGCGGTGAGTGGATCGTTTATTCGGGCGCCGTGGGTTTCGGTCTCgttt > 2:440991/1‑300 (MQ=255) gTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCCGGTTGGTGTCGCCGCCTATAACCGTTGGACCGATATTCAACTGCCGGACTTCCTGAGCTGCTTGGGCGGCACACGCTTTGTGTCGATTGCCACCGTATCCTTCTGCCTGGTCCTGGCCGCCATTTTTGGTTa > 1:599990/1‑218 (MQ=255) aGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGgccgccagcacccggc > 2:885926/1‑228 (MQ=255) ttACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTc < 1:478944/217‑1 (MQ=255) nttGTTTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAGGTGACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTTGGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGgcc < 1:888729/217‑1 (MQ=255) gtgtTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGCGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTTTTCTGCCTGGGGTTGGCGGCCATTTTTGGCTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTCTCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTGCGGCGGCCTGCGTGGTTCCGGTATTCTTGGTTTAATCAAc > 2:317512/1‑300 (MQ=255) gtgtTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGACATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTTTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCCTTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGGTATCCATGCAGGCGGCTAGGGGCACGTTTCTGCTGGCGCGCTGGGTTCCGGTCACTTTGGTTTCCTCGAc > 2:794904/1‑300 (MQ=255) aCCAAAGCGATGGGGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTctgc < 2:938415/301‑1 (MQ=255) ccAAAGCGGTGGTGTCCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCAGGTATCATTACCGGTCTGGTTAGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAACCGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTctgcg < 2:127593/301‑2 (MQ=255) cgagcgTGACAATAAACCCAGCAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCAGTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTTGAACCGTTGGTCCGATATCAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCCATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCGTTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGAGccc < 2:865806/296‑1 (MQ=255) cGATGGTGACGATCAAACCAGAAATGAAAATGGGTGT‑ACGGGCGGGGATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGTTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCAATCGGATTCTTCTGCCTTGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGTTCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATcc < 2:136385/300‑1 (MQ=255) 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aCCCAGAAATTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAggcgg > 1:424930/1‑217 (MQ=255) taaaTTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCCTTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGTTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGGGCTTCCTCGGCGGCAAACGCTTTTTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGTTGCTTGCGGCCATTTTTGGTTTCGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCCTTCCGGCGGCGAGtn > 1:775059/2‑217 (MQ=255) aactttATCATGGTTGT‑CCTGGGGGGTATCATTACCTGTCTTGTTGTTGTCTCAGCCTATAGCCGTTGGGCCGATATTAAACTGCCGGCCTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCGAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCTGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTAc < 2:820946/297‑1 (MQ=255) aaaTTACCATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTTAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAg < 1:663949/215‑1 (MQ=255) aaaTTAACAT‑GGTGTGACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTAc < 2:575835/300‑1 (MQ=255) tctAACATGGGTTT‑ACTGGCGTGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCATCCTATAACCGTTGGTCCGCTATTAAGCTGCCGGACTTCCTGAGCTTCGTCGGCGGCAAACGCTTTGGGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGa < 2:438272/299‑1 (MQ=255) aTTAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCGATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCGGCCTGGTGCTGGCGNCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGa < 2:906469/301‑1 (MQ=255) tAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCGTTACCGGTATGGTAGGTAGCGCAGCCTATAACCGTTGGTACGATAGTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCAGATTCTTCTACCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCAGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAac < 2:62878/301‑1 (MQ=255) tAACATGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTTGCGGCCACTTTTGGTTACCTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCCTGCAGGCGGCGGGTGGATCg > 1:250814/1‑218 (MQ=255) tGGGTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTGAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAACACCAt < 2:765426/301‑1 (MQ=255) tGGGTGT‑ACCGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAACACCAt > 2:621238/1‑301 (MQ=255) gggTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGTCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCCACCTTCTGCTGCTCCCCACCGGTCTGCATCCGGTACTCATCACCAt > 2:820920/1‑300 (MQ=255) ggTGT‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTTCCTTGTGCTGGCCGCCATTTTTGGTTACGTCCGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATTCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTg > 1:565550/1‑217 (MQ=255) gtgt‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCCACCGGTCTGCCTCAGGTACTGAACACCCTCg > 2:83025/1‑300 (MQ=255) tgt‑ACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAACCGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAACACCATCGcc < 2:323390/301‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |