| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,638,584 | A→T | 5.9% | F23L (TTT→TTA) | bamB ← | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,638,584 | 0 | A | T | 5.9% | 266.9 / 4.3 | 96 | F23L (TTT→TTA) | bamB | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/47); new base T (3/3); total (46/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AGACAACGTTGTCCGCCAGTGCCGGATGAAGATTGGAATAGAAGTTGCCAATGCCGCTACCAACGGAAGTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACG > NC_000913/2638436‑2638732 | aGACAACGTTGTCCGCCAGTGCCGGATGAAGATTGGAATAGAAGTTGCCAATGCCGCTACCAACGGAAGTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTa < 2:1019424/149‑1 (MQ=255)aGACAACGTTGTCCGCCAGTGCCGGATGAAGATTGGAATAGAAGTTGCCAATGCCGCTACCAACGGAAGTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTa < 1:1168884/149‑1 (MQ=255)aGACAACGTTGTCCGCCAGTGCCGGATGAAGATTGGAATAGAAGTTGCCAATGCCGCTACCAACGGAAGTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTa < 1:240222/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |