Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 1,818,103 | A→T | V133E (GTA→GAA) | chbF ← | phospho‑chitobiase; general 6‑phospho‑beta‑glucosidase activity |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,818,103 | 0 | A | T | 98.7% | 321.1 / ‑6.7 | 78 | V133E (GTA→GAA) | chbF | phospho‑chitobiase; general 6‑phospho‑beta‑glucosidase activity |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (45/32); total (46/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AATAAACATCTTCATGCCGATCGGAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCGCGCCGTTGGTTTCCTGACCAAGATAACCATGACTTAATGGAATACGTTCATCCAGTTCACGCGCCGGTAATTGGCCAACGCGCAGTTGGGTAGTA > NC_000913/1817955‑1818249 | aaTAAACATCTTCATGCCGATCGGAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCg > 1:812120/1‑151 (MQ=255) aaaaaCATCTTCATGCGGATCGAAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGa < 2:870057/149‑1 (MQ=255) aTAAACATCTTCATGCCGATCGGAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTACGACATCTTTTTCg > 1:1341873/1‑150 (MQ=255) tAAACATCTTCATGCCGATCGGAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGAt > 2:12740/1‑151 (MQ=255) aaaaCATCTTCAGGCCGATCGAAATTTTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGAt < 1:909457/150‑1 (MQ=255) aaaCATCTTCATGCCGATCGGAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATg > 2:5071/1‑151 (MQ=255) aCATCTTCATCCCGATGGGAATATTCCCCACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTc < 1:1103910/151‑1 (MQ=255) cATCTTCATGCCGATCGGAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTc > 2:89784/1‑150 (MQ=255) tCATGCCGATCGGAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAAt > 2:1351634/1‑151 (MQ=255) tCATGCCGATCGGAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAATTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAAt > 2:884036/1‑151 (MQ=255) actcgcggaacgaaaTATTACGCACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCaaaaa < 1:1286741/137‑1 (MQ=255) cATGCCGATGGAAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATc < 1:127331/151‑1 (MQ=255) cATGCCGATCGGAATATTACCCACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAAt < 1:1300344/150‑1 (MQ=255) cccGATCGAAATATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCAcc < 2:230890/150‑1 (MQ=255) gatggaaaTTTTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGa < 1:58869/145‑1 (MQ=255) cgaaaTATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAAt < 1:311012/147‑1 (MQ=255) aaTATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGt > 2:194142/1‑150 (MQ=255) aaTATTACACACGCCGATAAAGCGTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTa < 1:429366/151‑1 (MQ=255) 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gTTTAAATCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAAccgcc > 2:111853/1‑151 (MQ=255) aaTCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCGCCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCgcgc > 1:751099/1‑151 (MQ=255) aaTCCGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCgcgc < 2:482979/151‑1 (MQ=255) ccGGTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCGCGCCg < 1:42703/150‑1 (MQ=255) cGGTAGGACGATAAACGGTTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCGCGCCGtt < 1:746216/151‑1 (MQ=255) ggTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCGCGCCGTTg > 1:1347881/1‑151 (MQ=255) gTATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCGCGCCGTTgg > 1:382227/1‑151 (MQ=255) tATGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCGCGCCGTTGGt > 2:977469/1‑151 (MQ=255) tGACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCGCGCCGTTGGttt > 1:340660/1‑151 (MQ=255) gACGATAAACGGCTTCAGTGACCATTCCCGCCGGGTTAGTGAAGTTAATCACCCATGCATTCGGACAAAGTTCTTCGACATCTTTTTCGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAAACCGCCCGCGCCGTTGGTTTc > 2:1110211/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |