Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 869,126 | 0 | T | G | 42.2% | 107.1 / 24.7 | 66 | V536G (GTG→GGG) | gsiA | glutathione ABC transporter ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (5/32); new base G (27/0); total (34/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGACCGCAGCGTGTACTGCTGTCGGACGAT > NC_000913/868979‑869274 | ccGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTTTTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGAt < 2:427543/151‑1 (MQ=255) gaAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑At‑c < 2:314008/151‑1 (MQ=255) gaAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑At‑c < 2:378099/151‑1 (MQ=255) aaGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑At‑ct < 1:1297340/151‑1 (MQ=255) aGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑At‑ct‑c < 1:1369821/151‑1 (MQ=255) ttCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑TT‑C‑GGGcg > 2:540693/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCa < 1:746704/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTTGCGGTGATTT‑TT‑CT‑C‑CGGCCAAt > 1:316139/1‑151 (MQ=255) cGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGCGGGGGGGT‑AT‑TT‑C‑gggggaa > 2:242516/1‑146 (MQ=255) ggCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAAtt < 2:812084/151‑1 (MQ=255) gcTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑TT‑C‑GGGGaaaatttt > 1:107971/1‑146 (MQ=255) ggATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑Ga < 1:700569/150‑1 (MQ=255) aTGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAAt < 2:480845/151‑1 (MQ=255) gTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGGTTTGTCATCGTGGGGCGGGGGTGG‑AT‑TTCC‑GGGGAAATTT‑TT‑GAAAtt > 1:212260/1‑151 (MQ=255) ttCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCCTCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑TT‑C‑GGGGGAATTT‑TT‑TTAAATGGt > 2:205070/1‑151 (MQ=255) cTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGGGGGGGTGT‑AT‑CT‑CGGGGCAAATTT‑TT‑TAATTTgtgc > 1:766288/1‑148 (MQ=255) aTTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTcc < 1:1186386/149‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTcc < 1:201102/149‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTcc < 1:309802/149‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGCGGGAAAGCGGGTTAGTTCTCTGGTTGCGGCGCTTT‑AT‑CT‑CTGGGCAAA‑TG‑TT‑GAAAATGGTCCAc > 1:1280488/1‑151 (MQ=255) cgcgGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGgc < 2:1340664/151‑1 (MQ=255) cgcgGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGGGGGGGTGT‑GT‑CT‑CGGGGGAAATTT‑TT‑AAATTTGGTCCCCgg > 1:334970/1‑151 (MQ=255) cgcgGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGTGTT‑TT‑C‑GGGGAAATTT‑TT‑AAAATTGGTCCCCgc > 1:293406/1‑150 (MQ=255) gggCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGGTTTGTCATCGTGTGGGGGGGGTGT‑TT‑TTCC‑GGGGAAATTT‑TG‑TAAATTgggcaccgcgcc > 2:1433244/1‑141 (MQ=255) gggCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑AT‑C‑GGGGGAAATG‑TT‑TAAATTTGTCCACcgcgcg > 2:453107/1‑151 (MQ=255) gCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGcgcgcg < 2:1356973/151‑1 (MQ=255) aGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTTGTCATCGTGTGGCGGTGGTGT‑AT‑TTCC‑GGGCAAATT‑‑TT‑GTAAATTGTCCCCGGCGCGCggg > 2:289142/1‑150 (MQ=255) aTCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCg < 1:762683/151‑1 (MQ=255) aTCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGATTT‑CTCCC‑C‑GGGCAAATT‑‑TT‑GTAAATTGTGCCCGGCGCGCGG‑GC‑TTct > 1:600093/1‑150 (MQ=255) cAACTTGTTTCTCCGTCTCCAGCGTTATTTCGGCATTGCGTATCTTTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGaa < 1:1160603/151‑1 (MQ=255) cGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGAGTTGTCGTCGGGTGGGGGGGGTGG‑AT‑AT‑T‑GGGGAAATTG‑TTGGAAGTTGGGTAAC‑GCGCGCGG‑GG‑TTTGAAAAACCGCAGCAt > 2:107737/1‑151 (MQ=255) cGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAACGGGATAGTTAACGTCTGGGGGGGGTGG‑TT‑AA‑CGGGGCAAATCG‑TT‑‑AAATTCGTCCCCGGCCCGCGGCCC‑TTCCAAAAccgccaca > 1:1286941/1‑144 (MQ=255) gATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGGGTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑TT‑C‑CGGGGAAATG‑TT‑GTAAATTGTGCACCGCGCGCGG‑GG‑CTCGAAAAACCCCCGCATc > 2:536232/1‑151 (MQ=255) ccAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCt < 2:1261288/148‑1 (MQ=255) aGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGGTTAGGCATCCTGTGGCGGGGGGCT‑AT‑CTCC‑CGGCAAATTT‑TT‑TAAATTGG‑CCACCGCCCGCGG‑GC‑TTCGAAAAACCCCCCCATCCCTTTAc > 2:1137100/1‑151 (MQ=255) gATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTa < 1:452801/151‑1 (MQ=255) cGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTa < 1:897195/151‑1 (MQ=255) gCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑Ct < 1:1414889/151‑1 (MQ=255) gCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑CT‑C‑GGGGGAAATT‑TT‑GAAATTTGGTCACCGCGCGCGG‑GG‑TTCGGAAAACCCCAGCAACCTTATACGC‑GGaaaattat > 2:1112406/1‑146 (MQ=255) cGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑CTCC‑GGGGAAATTT‑TT‑GAAATTGTTCC‑CGGCGCGCGG‑GC‑TTTGGAAAACCCCCGCATCCTTATACGC‑GGAAAATA‑CTtgc‑ggc > 2:79920/1‑151 (MQ=255) cGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGGGGGGGGGT‑AT‑TT‑C‑GGGCAAAATG‑TT‑GGAAATTGTGCACCGCGCGCGG‑GC‑TTCGGAAAACCCCAGCACTCTTATAAGC‑GGAAAATA‑CTtgc‑ggg > 1:151299/1‑150 (MQ=255) tCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑CT‑C‑GGGCGAAATG‑TT‑TTAAATTGTCCCCGGCGCGCGG‑GC‑CTCTAAAAACCCCAGCACCCCTTTAAGC‑GCAAAATA‑TTGGG‑GGGA‑ggt > 2:360264/1‑149 (MQ=255) cTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGATGT‑AT‑TT‑CGGGGAAAATTT‑TT‑AAAATTGG‑CCCCCGCGCGCGG‑GC‑TTCGAAAAACCCCAGCATCCCTTTAAGC‑GGAAAATT‑CTTGC‑GGCA‑ggtt > 1:34801/1‑148 (MQ=255) gTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATCCGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTcc < 2:1244524/150‑1 (MQ=255) gTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTcc < 1:723871/150‑1 (MQ=255) gTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGCGGGGATGG‑AT‑CTCC‑GGGCAATTGT‑TT‑GAAATTGG‑CCCCCGCGCGCGG‑GCTTTCGAAAACCC‑CCGCATCCCTTTACGC‑GGAAAATA‑ATTGG‑GGCA‑GGTccc > 1:1070272/1‑150 (MQ=255) ttATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCgg < 1:485763/150‑1 (MQ=255) ttATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑TT‑TTCC‑GGGCAAATTT‑TT‑AAAATTGG‑CCCCCGCGCGCGG‑GC‑TTCGAAAAACCCCAGCAACCCTTTACGC‑GGAAAATA‑Ctttggggaggttccgg > 1:1340973/1‑136 (MQ=255) ttATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑TT‑CT‑C‑GGGGAAAATGTTT‑TAAATTGG‑CCCCCGCGCGCGG‑GC‑TTTGAAAAACCCCCGCAACCCTTTACGC‑GGAAAATA‑CTTGC‑GGGA‑GTTcccgg > 1:566065/1‑148 (MQ=255) aTCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGGGTGGCGGGGGAGT‑TT‑TTCC‑GGGGAAATTT‑TT‑AAAATT‑GTCCCCCGCGCGCGG‑GC‑TTTGAAAAACCCCAGGATCCTTTTAACC‑GGTAATTATTTGGC‑GGCG‑GTTCCggcg > 1:912908/1‑149 (MQ=255) aTCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGGAGT‑TT‑TT‑T‑GGGGGAAATG‑TT‑TTAAATTGTTCACCGGGCGCGG‑GC‑TTTCAAAAACCCCAACCTCCCTTTATCC‑GGAAAATA‑CTTGCGGGCG‑GTTCCggcg > 2:983252/1‑149 (MQ=255) tctcCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGT‑AT‑TT‑CGGGGCAAATT‑‑TT‑GTAAATTGTCCCCAGCGCGCGG‑GC‑TTTCAAAAACCCCCGCATCCTTTTAACC‑GGAAAATA‑CTTGC‑GGGAGGTTCCggcgc > 1:1277313/1‑148 (MQ=255) cccACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCt < 2:316143/149‑1 (MQ=255) cccACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTg < 1:1321967/150‑1 (MQ=255) gATATGGCGGTGGTAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTGG‑AT‑TT‑C‑GGGGGAAATG‑TT‑TTAAATTGTTCACCGCGCGCGG‑GCTTTCAAAAACCCCCGCCACCCTT‑TACGCGGAAAATTC‑TTGGG‑GGCG‑GTTCCggggctggaccgc > 2:86954/1‑140 (MQ=255) ggCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGATTTGT‑AT‑CG‑C‑AGGCAAATTG‑GT‑TAAATTGGTCCACGGCGGGCGG‑TC‑TTCCAAAACCCCCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑TTTCCTGTCCCTTAACCGTccctc > 2:612585/1‑149 (MQ=255) ggCGGTGGTAGAGCGGATGAGTCGTCGTGTGGCAGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTGAACCTTCCCg < 2:1305561/150‑1 (MQ=255) tggtAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACg > 2:354538/1‑151 (MQ=255) agagCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGAcc < 1:540694/150‑1 (MQ=255) agagCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGACCg > 1:904955/1‑151 (MQ=255) agagCGGATTAGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGACCg < 1:1037222/151‑1 (MQ=255) aGTCATCGTGTGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGGCCGCAGCGTGTa < 2:1050918/150‑1 (MQ=255) gtgtGGCGGTGATGT‑AT‑CT‑C‑GGGCAAATTG‑TT‑GAAATTGGTCCACGGCGCGCGG‑TC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGC‑GTAAATTA‑CTGGC‑GGCA‑GTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGACCGCAGCGTGTACTGCTGTc > 2:168489/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |